seq1 = pF1KE0841.tfa, 1026 bp
seq2 = pF1KE0841/gi568815592f_132452693.tfa (gi568815592f:132452693_132653718), 201026 bp

>pF1KE0841 1026
>gi568815592f:132452693_132653718 (Chr6)

1-1026  (100001-101026)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAGCAATTTTTCCCAACCTGTTGTGCAGCTTTGCTATGAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAGCAATTTTTCCCAACCTGTTGTGCAGCTTTGCTATGAGGATGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAATGGATCTTGTATTGAAACTCCCTATTCTCCTGGGTCCCGGGTAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAATGGATCTTGTATTGAAACTCCCTATTCTCCTGGGTCCCGGGTAATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACACGGCGTTTAGCTTTGGGTCTTTGCTGGCTGTATTTGGAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACACGGCGTTTAGCTTTGGGTCTTTGCTGGCTGTATTTGGAAATCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTAGTAATGACTTCTGTTCTTCATTTTAAGCAGCTGCACTCTCCAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTAGTAATGACTTCTGTTCTTCATTTTAAGCAGCTGCACTCTCCAACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTCTCATTGCCTCTCTGGCCTGTGCTGACTTCTTGGTAGGTGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTCTCATTGCCTCTCTGGCCTGTGCTGACTTCTTGGTAGGTGTGACTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGATGCTTTTCAGCATGGTCAGGACGGTGGAGAGCTGCTGGTATTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGATGCTTTTCAGCATGGTCAGGACGGTGGAGAGCTGCTGGTATTTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCAAATTTTGTACTCTTCACAGTTGCTGTGATGTGGCATTTTGTTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCAAATTTTGTACTCTTCACAGTTGCTGTGATGTGGCATTTTGTTACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCTGTCCTCCACTTGTGCTTCATCTGCATCGACAGGTACATTGTGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTCTGTCCTCCACTTGTGCTTCATCTGCATCGACAGGTACATTGTGGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGATCCCCTGGTCTATGCTACCAAGTTCACCGTGTCTGTGTCGGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGATCCCCTGGTCTATGCTACCAAGTTCACCGTGTCTGTGTCGGGAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCATCAGCGTGTCCTGGATTCTGCCTCTCACGTACAGCGGTGCTGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCATCAGCGTGTCCTGGATTCTGCCTCTCACGTACAGCGGTGCTGTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACACAGGTGTCAATGATGATGGGCTGGAGGAATTAGTAAGTGCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACACAGGTGTCAATGATGATGGGCTGGAGGAATTAGTAAGTGCTCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTGCGTAGGTGGCTGTCAAATTATTGTAAGTCAAGGCTGGGTGTTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTGCGTAGGTGGCTGTCAAATTATTGTAAGTCAAGGCTGGGTGTTGATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATTTTCTGTTATTCTTCATACCTACCCTTGTTATGATAATTCTTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATTTTCTGTTATTCTTCATACCTACCCTTGTTATGATAATTCTTTACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAAGATTTTTCTTATAGCTAAACAACAAGCTATAAAAATTGAAACTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAAGATTTTTCTTATAGCTAAACAACAAGCTATAAAAATTGAAACTACTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTAGCAAAGTAGAATCATCCTCAGAGAGTTATAAAATCAGAGTGGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTAGCAAAGTAGAATCATCCTCAGAGAGTTATAAAATCAGAGTGGCCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGAGAGAGGAAAGCAGCTAAAACCCTGGGGGTCACGGTACTAGCATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGAGAGAGGAAAGCAGCTAAAACCCTGGGGGTCACGGTACTAGCATTTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATTTCATGGTTACCGTATACAGTTGATATATTAATTGATGCCTTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATTTCATGGTTACCGTATACAGTTGATATATTAATTGATGCCTTTATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTTCCTGACCCCTGCCTATATCTATGAAATTTGCTGTTGGAGTGCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTTCCTGACCCCTGCCTATATCTATGAAATTTGCTGTTGGAGTGCTTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TATAACTCAGCCATGAATCCTTTGATTTATGCTCTATTTTATCCTTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TATAACTCAGCCATGAATCCTTTGATTTATGCTCTATTTTATCCTTGGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TAGGAAAGCCATAAAACTTATTTTAAGTGGAGATGTTTTAAAGGCTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TAGGAAAGCCATAAAACTTATTTTAAGTGGAGATGTTTTAAAGGCTAGTT

   1000     .    :    .    :    .
   1001 CATCAACCATTAGTTTATTTTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 101001 CATCAACCATTAGTTTATTTTTAGAA