seq1 = pF1KE0840.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KE0840/gi568815592f_132470322.tfa (gi568815592f:132470322_132671356), 201035 bp

>pF1KE0840 1035
>gi568815592f:132470322_132671356 (Chr6)

1-1035  (100001-101035)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAGCAATTCATCCCTGCTGGTGGCTGTGCAGCTGTGCTACGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAGCAATTCATCCCTGCTGGTGGCTGTGCAGCTGTGCTACGCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGAATGGGTCCTGTGTGAAAATCCCCTTCTCGCCGGGATCCCGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTGAATGGGTCCTGTGTGAAAATCCCCTTCTCGCCGGGATCCCGGGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTGTACATAGTGTTTGGCTTTGGGGCTGTGCTGGCTGTGTTTGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCTGTACATAGTGTTTGGCTTTGGGGCTGTGCTGGCTGTGTTTGGAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCTGGTGATGATTTCAATCCTCCATTTCAAGCAGCTGCACTCTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCTGGTGATGATTTCAATCCTCCATTTCAAGCAGCTGCACTCTCCGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATTTTCTCGTTGCCTCTCTGGCCTGCGCTGATTTCTTGGTGGGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATTTTCTCGTTGCCTCTCTGGCCTGCGCTGATTTCTTGGTGGGTGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGTGATGCCCTTCAGCATGGTCAGGACGGTGGAGAGCTGCTGGTATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGTGATGCCCTTCAGCATGGTCAGGACGGTGGAGAGCTGCTGGTATTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGAGGAGTTTTTGTACTTTCCACACCTGCTGTGATGTGGCATTTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGAGGAGTTTTTGTACTTTCCACACCTGCTGTGATGTGGCATTTTGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTTCTCTCTTTCACTTGTGCTTCATCTCCATCGACAGGTACATTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTTCTCTCTTTCACTTGTGCTTCATCTCCATCGACAGGTACATTGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTACTGACCCCCTGGTCTATCCTACCAAGTTCACCGTATCTGTGTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTACTGACCCCCTGGTCTATCCTACCAAGTTCACCGTATCTGTGTCAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTTGCATCAGCGTGTCCTGGATCCTGCCCCTCATGTACAGCGGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTTGCATCAGCGTGTCCTGGATCCTGCCCCTCATGTACAGCGGTGCTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTCTACACAGGTGTCTATGACGATGGGCTGGAGGAATTATCTGATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTCTACACAGGTGTCTATGACGATGGGCTGGAGGAATTATCTGATGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAAACTGTATAGGAGGTTGTCAGACCGTTGTAAATCAAAACTGGGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAAACTGTATAGGAGGTTGTCAGACCGTTGTAAATCAAAACTGGGTGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACAGATTTTCTATCCTTCTTTATACCTACCTTTATTATGATAATTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACAGATTTTCTATCCTTCTTTATACCTACCTTTATTATGATAATTCTGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGTAACATATTTCTTGTGGCTAGACGACAGGCGAAAAAGATAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGTAACATATTTCTTGTGGCTAGACGACAGGCGAAAAAGATAGAAAATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGGTAGCAAGACAGAATCATCCTCAGAGAGTTACAAAGCCAGAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGGTAGCAAGACAGAATCATCCTCAGAGAGTTACAAAGCCAGAGTGGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGGAGAGAGAGAAAAGCAGCTAAAACCCTGGGGGTCACAGTGGTAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGGAGAGAGAGAAAAGCAGCTAAAACCCTGGGGGTCACAGTGGTAGCATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATGATTTCATGGTTACCATATAGCATTGATTCATTAATTGATGCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATGATTTCATGGTTACCATATAGCATTGATTCATTAATTGATGCCTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGGCTTTATAACCCCTGCCTGTATTTATGAGATTTGCTGTTGGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGGCTTTATAACCCCTGCCTGTATTTATGAGATTTGCTGTTGGTGTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TATTATAACTCAGCCATGAATCCTTTGATTTATGCTTTATTTTACCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TATTATAACTCAGCCATGAATCCTTTGATTTATGCTTTATTTTACCCATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTTTAGGAAAGCAATAAAAGTTATTGTAACTGGTCAGGTTTTAAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTTTAGGAAAGCAATAAAAGTTATTGTAACTGGTCAGGTTTTAAAGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 GTTCAGCAACCATGAATTTGTTTTCTGAACATATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GTTCAGCAACCATGAATTTGTTTTCTGAACATATA