seq1 = pF1KE0839.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE0839/gi568815586r_10709140.tfa (gi568815586r:10709140_10910075), 200936 bp

>pF1KE0839 936
>gi568815586r:10709140_10910075 (Chr12)

(complement)

1-936  (100001-100936)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCAAGTGCAATAGAGGCAATATATATTATTTTAATTGCTGGTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCAAGTGCAATAGAGGCAATATATATTATTTTAATTGCTGGTGAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCATAGGGATTTGGGGAAATGGATTCATTGTACTAGTTAACTGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCATAGGGATTTGGGGAAATGGATTCATTGTACTAGTTAACTGCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGCTCAAAAGAAGAGATATTTCCTTGATTGACATCATCCTGATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGCTCAAAAGAAGAGATATTTCCTTGATTGACATCATCCTGATCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCCATCTCCAGAATCTGTCTGCTGTGTGTAATATCATTAGATGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCCATCTCCAGAATCTGTCTGCTGTGTGTAATATCATTAGATGGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTATGCTGCTCTTTCCAGGTACATATGGCAATAGCGTGCTAGTAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTATGCTGCTCTTTCCAGGTACATATGGCAATAGCGTGCTAGTAAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGAATGTTGTCTGGACATTTGCCAATAATTCAAGTCTCTGGTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTGAATGTTGTCTGGACATTTGCCAATAATTCAAGTCTCTGGTTTACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTTGCCTCAGTATCTTCTATTTACTCAAGATAGCCAATATATCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTTGCCTCAGTATCTTCTATTTACTCAAGATAGCCAATATATCGCACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATTTTTCTTCTGGCTGAAGCTAAAGATCAACAAGGTCATGCTTGCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATTTTTCTTCTGGCTGAAGCTAAAGATCAACAAGGTCATGCTTGCGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCTGGGGTCCTTTCTTATCTCTTTAATTATTAGTGTTCCAAAGAATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCTGGGGTCCTTTCTTATCTCTTTAATTATTAGTGTTCCAAAGAATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATATGTGGTATCACCTTTTCAAAGTCAGTCATGAAGAAAACATTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GATATGTGGTATCACCTTTTCAAAGTCAGTCATGAAGAAAACATTACTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAATTCAAAGTGAGTAAAATTCCAGGTACTTTCAAACAGTTAACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAATTCAAAGTGAGTAAAATTCCAGGTACTTTCAAACAGTTAACCCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTGGGGGCGATGGTTCCCTTTATCCTTTGCCTGATCTCATTTTTCTTG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTGGGGGTGATGGTTCCCTTTATCCTTTGCCTGATCTCATTTTTCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTACTTTTCTCCCTAGTTAGACACACCAAGCAGATTCGACTGCATGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTACTTTTCTCCCTAGTTAGACACACCAAGCAGATTCGACTGCATGCTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGGTTCAGAGACCCCAGTACAGAGGCCCACATGAGGGCCATAAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGGTTCAGAGACCCCAGTACAGAGGCCCACATGAGGGCCATAAAGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGATCATCTTTCTGCTCCTCCTCATCGTGTACTACCCAGTCTTTCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGATCATCTTTCTGCTCCTCCTCATCGTGTACTACCCAGTCTTTCTTGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGACCTCTAGCGCTCTGATTCCTCAGGGAAAATTAGTGTTGATGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGACCTCTAGCGCTCTGATTCCTCAGGGAAAATTAGTGTTGATGATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACATAGTAACTGTCATTTTCCCATCAAGCCATTCATTCATTCTAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACATAGTAACTGTCATTTTCCCATCAAGCCATTCATTCATTCTAATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGGAAATAGCAAGTTGAGGGAAGCTTTTCTGAAGATGTTAAGATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGGAAATAGCAAGTTGAGGGAAGCTTTTCTGAAGATGTTAAGATTTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGTGTTTCCTTAGAAGAAGAAAGCCTTTTGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGTGTTTCCTTAGAAGAAGAAAGCCTTTTGTTCCA