seq1 = pF1KE0837.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE0837/gi568815586r_10701617.tfa (gi568815586r:10701617_10902570), 200954 bp

>pF1KE0837 954
>gi568815586r:10701617_10902570 (Chr12)

(complement)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGATAAAGTGCAGACTACTTTATTGTTCTTAGCAGTTGGAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGATAAAGTGCAGACTACTTTATTGTTCTTAGCAGTTGGAGAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAGTGGGGATCTTAGGGAATGCATTCATTGGATTGGTAAACTGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCAGTGGGGATCTTAGGGAATGCATTCATTGGATTGGTAAACTGCATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGTCAAGAAGAGGAAAATTGCCTCCATTGATTTAATCCTCACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGGTCAAGAAGAGGAAAATTGCCTCCATTGATTTAATCCTCACAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCATATCCAGAATTTGTCTATTGTGCGTAATACTATTAGATTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCCATATCCAGAATTTGTCTATTGTGCGTAATACTATTAGATTGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATATTGGTGCTATATCCAGATGTCTATGCCACTGGTAAAGAAATGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TATATTGGTGCTATATCCAGATGTCTATGCCACTGGTAAAGAAATGAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATTGACTTCTTCTGGACACTAACCAATCATTTAAGTATCTGGTTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATTGACTTCTTCTGGACACTAACCAATCATTTAAGTATCTGGTTTGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTGCCTCAGCATTTACTATTTCTTCAAGATAGGTAATTTCTTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTGCCTCAGCATTTACTATTTCTTCAAGATAGGTAATTTCTTTCACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTTTTCCTCTGGATGAAGTGGAGAATTGACAGGGTGATTTCCTGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTTTTCCTCTGGATGAAGTGGAGAATTGACAGGGTGATTTCCTGGATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACTGGGGTGCGTGGTTCTCTCTGTGTTTATTAGCCTTCCAGCCACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TACTGGGGTGCGTGGTTCTCTCTGTGTTTATTAGCCTTCCAGCCACTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AATTTGAACGCTGATTTCAGGTTTTGTGTGAAGGCAAAGAGGAAAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AATTTGAACGCTGATTTCAGGTTTTGTGTGAAGGCAAAGAGGAAAACAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTAACTTGGAGTTGCAGAGTAAATAAAACTCAACATGCTTCTACCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTAACTTGGAGTTGCAGAGTAAATAAAACTCAACATGCTTCTACCAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATTTCTCAACCTGGCAACGCTGCTCCCCTTTTGTGTGTGCCTAATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATTTCTCAACCTGGCAACGCTGCTCCCCTTTTGTGTGTGCCTAATGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTTTCCTCTTGATCCTCTCCCTGCGGAGACATATCAGGCGAATGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTTTCCTCTTGATCCTCTCCCTGCGGAGACATATCAGGCGAATGCAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAGTGCCACAGGGTGCAGAGACCCCAGCACAGAAGCCCATGTGAGAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAGTGCCACAGGGTGCAGAGACCCCAGCACAGAAGCCCATGTGAGAGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAAAGCTGTCATTTCCTTCCTTCTCCTCTTTATTGCCTACTATTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAAAGCTGTCATTTCCTTCCTTCTCCTCTTTATTGCCTACTATTTGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTCTCATTGCCACCTCCAGCTACTTTATGCCAGAGACGGAATTAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTCTCATTGCCACCTCCAGCTACTTTATGCCAGAGACGGAATTAGCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATTTTTGGTGAGTCCATAGCTCTAATCTACCCCTCAAGTCATTCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATTTTTGGTGAGTCCATAGCTCTAATCTACCCCTCAAGTCATTCATTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTAATACTGGGGAACAATAAATTAAGACATGCATCTCTAAAGGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTAATACTGGGGAACAATAAATTAAGACATGCATCTCTAAAGGTGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGGAAAGTAATGTCTATTCTAAAAGGAAGAAAATTCCAACAACATAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGGAAAGTAATGTCTATTCTAAAAGGAAGAAAATTCCAACAACATAAACA

    950 
    951 AATC
        ||||
 100951 AATC