seq1 = pF1KE0836.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE0836/gi568815591f_143343453.tfa (gi568815591f:143343453_143544406), 200954 bp

>pF1KE0836 954
>gi568815591f:143343453_143544406 (Chr7)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGGAGACCACATGGTTCTAGGATCTTCGGTGACTGACAAGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGGAGACCACATGGTTCTAGGATCTTCGGTGACTGACAAGAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCATCTTGGTTACCATTTTACTCCTTTTACGCCTGGTAGCAATAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCATCTTGGTTACCATTTTACTCCTTTTACGCCTGGTAGCAATAGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAATGGCTTCATCACTGCTGCTCTGGGCGTGGAGTGGGTGCTACGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAATGGCTTCATCACTGCTGCTCTGGGCGTGGAGTGGGTGCTACGGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGTTGTTGCCTTGTGATAAGTTATTGGTTAGCCTAGGGGCCTCTCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGTTGTTGCCTTGTGATAAGTTATTGGTTAGCCTAGGGGCCTCTCGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGTCTGCAGTCAGTGGTAATGGGTAAGACCATTTATGTTTTCTTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGTCTGCAGTCAGTGGTAATGGGTAAGACCATTTATGTTTTCTTGCATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGATGGCCTTCCCATACAACCCTGTACTGCAGTTTCTAGCTTTCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGATGGCCTTCCCATACAACCCTGTACTGCAGTTTCTAGCTTTCCAGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACTTCCTGAATGCTGCCACCTTATGGTCCTCTACCTGGCTCAGTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACTTCCTGAATGCTGCCACCTTATGGTCCTCTACCTGGCTCAGTGTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATTGTGTGAAAATTGCTACCTTCACCCACCCTGTCTTCTTCTGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATTGTGTGAAAATTGCTACCTTCACCCACCCTGTCTTCTTCTGGCTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCACAAGTTGTCTGGGTGGCTACCATGGATGCTCTTCAGCTCTGTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCACAAGTTGTCTGGGTGGCTACCATGGATGCTCTTCAGCTCTGTAGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTCCAGCTTCACCACCATTCTATTTTTCATAGGCAACCACAGAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTCCAGCTTCACCACCATTCTATTTTTCATAGGCAACCACAGAATGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCAGAACTATTTAAGGAACCATCTACAACCTTGGAATGTCACTGGCGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCAGAACTATTTAAGGAACCATCTACAACCTTGGAATGTCACTGGCGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATACGGAGCTACTGTGAGAAATTCTATCTCTTCCCTCTAAAAATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCATACGGAGCTACTGTGAGAAATTCTATCTCTTCCCTCTAAAAATGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACTTGGACAATGCCCACTGCTGTCTTTTTCATTTGCATGATTTTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACTTGGACAATGCCCACTGCTGTCTTTTTCATTTGCATGATTTTGCTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACATCTCTGGGAAGACACAGGAAGAAGGCTCTCCTTACAACCTCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACATCTCTGGGAAGACACAGGAAGAAGGCTCTCCTTACAACCTCAGGAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCGAGAGCCCAGTGTGCAGGCACACATAAAGGCTCTGCTGGCTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCGAGAGCCCAGTGTGCAGGCACACATAAAGGCTCTGCTGGCTCTCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTTTTGCCATGCTCTTCATCTCATATTTCCTGTCACTGGTGTTCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTTTTGCCATGCTCTTCATCTCATATTTCCTGTCACTGGTGTTCAGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCAGGTATTTTTCCACCTCTGGACTTTAAATTCTGGGTGTGGGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCAGGTATTTTTCCACCTCTGGACTTTAAATTCTGGGTGTGGGAGTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGATTTATCTGTGTGCAGCAGTTCACCCCATCATTCTGCTCTTCAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGATTTATCTGTGTGCAGCAGTTCACCCCATCATTCTGCTCTTCAGCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGCAGGCTGAGAGCTGTGCTGAAGAGTCGTCGTTCCTCAAGGTGTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGCAGGCTGAGAGCTGTGCTGAAGAGTCGTCGTTCCTCAAGGTGTGGGAC

    950 
    951 ACCT
        ||||
 100951 ACCT