seq1 = pF1KE0831.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE0831/gi568815587r_7672893.tfa (gi568815587r:7672893_7873648), 200756 bp

>pF1KE0831 756
>gi568815587r:7672893_7873648 (Chr11)

(complement)

1-756  (100001-100756)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACCTGTTCCTCAGCCACTTGGCTTTTGTGGACATAGGGCTTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACCTGTTCCTCAGCCACTTGGCTTTTGTGGACATAGGGCTTGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTAGTCACACCTATAATGCTTATGGGATTCCTAAGACGTGGAACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTAGTCACACCTATAATGCTTATGGGATTCCTAAGACGTGGAACAGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCTGTCACTAGCTGTGAAGCCCAGCTCTGTTCTGTAGTCATGTTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCTGTCACTAGCTGTGAAGCCCAGCTCTGTTCTGTAGTCATGTTTGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACGTCTGAATGCTTCCTACTGGCGACCATGGCCTATGATCGCTATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACGTCTGAATGCTTCCTACTGGCGACCATGGCCTATGATCGCTATGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCTGCTCACCCCTGGTGAACTCCACCCACTTGTCCCCCATAATCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATCTGCTCACCCCTGGTGAACTCCACCCACTTGTCCCCCATAATCTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TACTCTTAGTGGGGGTTTGCTACCTGGGTGGATGTGTGAATGCCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TACTCTTAGTGGGGGTTTGCTACCTGGGTGGATGTGTGAATGCCTCAACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTACTAGTTGTTTATTGAGTCTGTCTTTCTGTGGACCAAATCAGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTACTAGTTGTTTATTGAGTCTGTCTTTCTGTGGACCAAATCAGATAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCATTTTTTCTGTGATTTCTCTCCTTTGTTGAAACTTTCCTGCTCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCATTTTTTCTGTGATTTCTCTCCTTTGTTGAAACTTTCCTGCTCAAATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTCCATTCCTGAAATTATCCCTTCCATCTCTTCTGGATCTATCATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTCCATTCCTGAAATTATCCCTTCCATCTCTTCTGGATCTATCATTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCACAGTATTTGCCATAGCCATCTCCTACATCTACATCCTCATCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCACAGTATTTGCCATAGCCATCTCCTACATCTACATCCTCATCACCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGAAGATGCGCTCCGCCGAGGGGCGCCACAAGGCCTTCTCCACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGAAGATGCGCTCCGCCGAGGGGCGCCACAAGGCCTTCTCCACCTGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTCCCACCTCGCTGCGGTTACTCTCTACTATGGAACGATTACCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTCCCACCTCGCTGCGGTTACTCTCTACTATGGAACGATTACCTTCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TATGTGATGCCCAAATCCAGTTACTCAACTAGCCAGAACAGATTGATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TATGTGATGCCCAAATCCAGTTACTCAACTAGCCAGAACAGATTGATATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTGTCCTACACAGTGGTAATCCCCATACTGAACCCCTTTATCTATAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTGTCCTACACAGTGGTAATCCCCATACTGAACCCCTTTATCTATAGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGGAACAGAGATGTAAAGGAGGCACTAAGAAAGGCAACTGTCAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGGAACAGAGATGTAAAGGAGGCACTAAGAAAGGCAACTGTCAGAATA

    750     .
    751 TATTCT
        ||||||
 100751 TATTCT