seq1 = pF1KE0816.tfa, 678 bp
seq2 = pF1KE0816/gi568815584f_20129402.tfa (gi568815584f:20129402_20330079), 200678 bp

>pF1KE0816 678
>gi568815584f:20129402_20330079 (Chr14)

1-678  (100001-100678)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATAACTCACAGATATCTACTGTGACGCAGTTTGTGGTGTTGGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100001 ATGAATAACTCACAGATATCTACTGTGACGCAGTTTGTGTTGTTGGGGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCTGGTCCCTGGAAAATTCAGATCATCTTTTTCTCAATGATTTTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCTGGTCCCTGGAAAATTCAGATCATCTTTTTCTCAATGATTTTGTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACATCTTCACTCTGACTGGGAATATGGCCATCATCTGTGCAGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACATCTTCACTCTGACTGGGAATATGGCCATCATCTGTGCAGTGAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGGACCATCGACTCCATACCCCTATGTACGTGCTCCTAGCCAACTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGGACCATCGACTCCATACCCCTATGTACGTGCTCCTAGCCAACTTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCTAGAGATCTGGTATGTGACCTGCACAGTCCCCAACATGCTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCCTAGAGATCTGGTATGTGACCTGCACAGTCCCCAACATGCTGGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTTTTCTCCAAAACTAAGACCATATCATTCTCTGGATGTTTCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTTTTCTCCAAAACTAAGACCATATCATTCTCTGGATGTTTCACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCACTTCTTCTTTTCCCTGGGCACAACTGAATGCTTCTTCCTCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCACTTCTTCTTTTCCCTGGGCACAACTGAATGCTTCTTCCTCTGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCTTATGATCGGTACCTGGCCATCTGCCACCCACTGCACTATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCTTATGATCGGTACCTGGCCATCTGCCACCCACTGCACTATCCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATTATGACTGGCCAGCTCTGTGGCATCTTGGTGTCTCTTTGTTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATTATGACTGGCCAGCTCTGTGGCATCTTGGTGTCTCTTTGTTGGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGTTTCCTTGGACATTCAATTTCCATTTTCTTCATTTTTCAACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGTTTCCTTGGACATTCAATTTCCATTTTCTTCATTTTTCAACTACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGTCCCAACATCATTGATCATTTTCTGTGTGATGTAGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGGTCCCAACATCATTGATCATTTTCTGTGTGATGTAGACCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGATGGCATTGTCCTCTGCCCCTACTCACATCATAGGGCATGTGTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGATGGCATTGTCCTCTGCCCCTACTCACATCATAGGGCATGTGTTCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTGTGAGCTCTCTTTTCATCAACCTCACCATGGTGTACATCCTTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTGTGAGCTCTCTTTTCATCAACCTCACCATGGTGTACATCCTTGGGTC

    650     .    :    .    :    .
    651 CTATACCTTGGTGCTCAGAACTGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATACCTTGGTGCTCAGAACTGTGCTT