seq1 = pF1KE0814.tfa, 768 bp
seq2 = pF1KE0814/gi568815587f_55971030.tfa (gi568815587f:55971030_56171797), 200768 bp

>pF1KE0814 768
>gi568815587f:55971030_56171797 (Chr11)

1-768  (100001-100768)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTTGATATTGCGGTATCATTACTCTGAATTAATTCCAATCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTCTTGATATTGCGGTATCATTACTCTGAATTAATTCCAATCTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCATTAACAGGCATCAAGAAACACAAATCCATGGCTGATGTTAATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCATTAACAGGCATCAAGAAACACAAATCCATGGCTGATGTTAATTTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATTGGTTACTGAGTTTATCCTTTTGGAACTGACAGATCGTGCTGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATTGGTTACTGAGTTTATCCTTTTGGAACTGACAGATCGTGCTGAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGATGGTCCTCTTCGTGTTGTTCCTGCTGATCTACACCATTTCCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGATGGTCCTCTTCGTGTTGTTCCTGCTGATCTACACCATTTCCCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGAAATATAGGAATGCTCTTTCTAATCTATGTAACTCCCAAACTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGAAATATAGGAATGCTCTTTCTAATCTATGTAACTCCCAAACTCCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CACCCATGTATTATTTCCTCAGCTGTCTGTCATTTGTTGATGCCTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CACCCATGTATTATTTCCTCAGCTGTCTGTCATTTGTTGATGCCTGCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCATCAGTTTTTGCACCCAGAATGCTGCTGAACTTCTTTGTTGAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCATCAGTTTTTGCACCCAGAATGCTGCTGAACTTCTTTGTTGAGCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACAATCTTATTCTCTGCATGTATTGTGCAGTATTTTTTATTCGTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACAATCTTATTCTCTGCATGTATTGTGCAGTATTTTTTATTCGTGTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTTACCACTGAGGGCTTCTTGCTGGCCACAATGGCTTACGACCGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTTACCACTGAGGGCTTCTTGCTGGCCACAATGGCTTACGACCGTTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGCCATTGTGAACCCTTTACTTTATACAGTAGCTATGACTAAAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGCCATTGTGAACCCTTTACTTTATACAGTAGCTATGACTAAAATAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTGTATTGTGCTCGCATTTGGGTCATGTATGGGAGGTTTAATCAACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTGTATTGTGCTCGCATTTGGGTCATGTATGGGAGGTTTAATCAACTCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGACACATACAATTGGCTTGGTGAAACTGTCTTTCTGTGGGCCAAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGACACATACAATTGGCTTGGTGAAACTGTCTTTCTGTGGGCCAAATGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCAGTCACTTCTTCTGTGATCTTCCCCCACTGTTGAAGCTGTCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCAGTCACTTCTTCTGTGATCTTCCCCCACTGTTGAAGCTGTCATGTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGACATCTATGAATGAATTGTTGCTTTTGATCTTCTCTGGCATTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAGACATCTATGAATGAATTGTTGCTTTTGATCTTCTCTGGCATTATTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCACGCTCACTTTTTTGACTGTGGTGATCTCCTACATCTTCATTGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCACGCTCACTTTTTTGACTGTGGTGATCTCCTACATCTTCATTGTTGCT

    750     .    :    .
    751 GCTATCCTGAGGATCCGC
        ||||||||||||||||||
 100751 GCTATCCTGAGGATCCGC