seq1 = pF1KE0813.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KE0813/gi568815587f_55954539.tfa (gi568815587f:55954539_56155300), 200762 bp

>pF1KE0813 762
>gi568815587f:55954539_56155300 (Chr11)

1-762  (100001-100762)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACTTCTTCCTTGGCAACCTCTCCTTTTGTGATATCTGCTACTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACTTCTTCCTTGGCAACCTCTCCTTTTGTGATATCTGCTACTCTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCTTTGCTCCTAAGATGCTAGTCAATTTCCTATCAAAACATAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCTTTGCTCCTAAGATGCTAGTCAATTTCCTATCAAAACATAAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTACATTTTCTGGCTGTGTTCTACAGAGTTTCCCTTTTGCAGTATATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTACATTTTCTGGCTGTGTTCTACAGAGTTTCCCTTTTGCAGTATATGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCACAAAGGACATTCTCCTGTCCATGATGGCTTATGACCATTACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCACAAAGGACATTCTCCTGTCCATGATGGCTTATGACCATTACGTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATAGCTAATCCCTTGTTGTATACAGTCATTATGGCCCAAAAAGTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATAGCTAATCCCTTGTTGTATACAGTCATTATGGCCCAAAAAGTTTGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCAGATGGTCCTTGCTTCTTACTTAGGTGGGCTCATTAATTCCCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCAGATGGTCCTTGCTTCTTACTTAGGTGGGCTCATTAATTCCCTGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACACAATAGGTTTGCTCAAATTAGACTTCTGTGGTCCTAATATTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACACAATAGGTTTGCTCAAATTAGACTTCTGTGGTCCTAATATTGTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCATTATTTCTGTGATGTTCCTCCTCTTCTGAGGCTTTCTTGCTCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCATTATTTCTGTGATGTTCCTCCTCTTCTGAGGCTTTCTTGCTCTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCATATCAATGAAATGCTGCCCTTGGTCTTCTCTGGGCTCATTGCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCATATCAATGAAATGCTGCCCTTGGTCTTCTCTGGGCTCATTGCAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCACTTTCATTGTCATTATGGTGTCTTATATCTGCATCATCATTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCACTTTCATTGTCATTATGGTGTCTTATATCTGCATCATCATTGCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGAGAATCCATGCAGCTGAGGGAAGGTACAAAGCCTTCTCCACTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGAGAATCCATGCAGCTGAGGGAAGGTACAAAGCCTTCTCCACTTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTCCCACCTAACCACGGTGACCTTATTCTATGGGTCTGTTTCTTTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCCCACCTAACCACGGTGACCTTATTCTATGGGTCTGTTTCTTTTAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TATATCCAGCCAAGTTCTCAGTATTCCTTGGAACAGGAGAAGGTCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TATATCCAGCCAAGTTCTCAGTATTCCTTGGAACAGGAGAAGGTCTTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTGTTTTATACACTGGTGATCCCCATGCTAAACCCACTTATTTATAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTGTTTTATACACTGGTGATCCCCATGCTAAACCCACTTATTTATAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGAAATAAGGATGTAAAAGATGCAGCCAAAAGGTTGATATGGTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGAAATAAGGATGTAAAAGATGCAGCCAAAAGGTTGATATGGTGGGGG

    750     .    :
    751 AAAAACCCCACT
        ||||||||||||
 100751 AAAAACCCCACT