seq1 = pF1KE0808.tfa, 843 bp
seq2 = pF1KE0808/gi568815587r_5077717.tfa (gi568815587r:5077717_5278553), 200837 bp

>pF1KE0808 843
>gi568815587r:5077717_5278553 (Chr11)

(complement)

1-843  (100001-100837)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACATTGTGGCTGTTGCAGGCAATATCTTCTTGATCTTCCTGATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACATTGTGGCTGTTGCAGGCAATATCTTCTTGATCTTCCTGATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACTGAGCGCAGTCTCCATGAGCCCTTGTATCTCTTCCTATCCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100051 GACTGAGCGCAGTCTCCATGAGCCCATGTATCTCTTCCTATCCATGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCAGCCAACTTCCTGCTCGCCGCTGCTGCAGCCCCTGAGGTGCTGGCT
        |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
 100101 CCTCAGCCGACTTCCTGCTCGCCACTGCTGCAGCCCCTAAGGTGCTGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTCTGGTTCCACTCCATGGACATATCCTTTGGTAGTTGTGTGTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTCTGGTTCCACTCCATGGACATATCCTTTGGTAGTTGTGTGTCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATGTTCTTCATACATTTCATCTTTGTGGCAGAATCTGCTATTCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATGTTCTTCATACATTTCATCTTTGTGGCAGAATCTGCTATTCTCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAATGGCATTTGACCGCTATGTGGCCATCTGTTACCCACTGAGATACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAATGGCATTTGACCGCTATGTGGCCATCTGTTACCCACTGAGATACACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTTTAACCTCATCAGCCGTCAGGAAGATTGGCATAGCAGCTGTGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTTTAACCTCATCAGCCGTCAGGAAGATTGGCATAGCAGCTGTGGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCTTTTTCATCTGCTGTCCGTTCATCTTCCTGGTATACCGACTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCTTTTTCATCTGCTGTCCGTTCATCTTCCTGGTATACCGACTTACAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATTGTGGGAGAAACATCATTCCTCATTCCTACTGTGAGCACATGGGCATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||------|
 100401 ATTGTGGGAGAAACATCATTCCTCATTCCTACTGTGAGCACAT      T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAGATTGGCTTGTGGCAATATCAATGTCAATATCATTTATGGCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100445 GCCAGATTGGCTTGTGGCAATATCAATGTCAATATCATTTATGGCCTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTGGCCCTACTCTCTACAGGACTGGATATAGTGCTTATCATTATATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100495 TGTGGCCCTACTCTCTACAGGACTGGATATAGTGCTTATCATTATATCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACACAATGATCCTTCACGCAGTGTTTCAGATGTCTTCCTGGGCTGCCAGG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100545 ACACAATGATCCTTCACTCAGTGTTTCAGATATCTTCCTGGGCTGCCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCAAGGCCCTTAGTACGTGCGGCTCTCATATCTGTGTCATATTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100595 TTCAAGGCCCTTAGTACGTGCGGCTCTCATATCTGTGTCATATTTATGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATACCCCAGCATTCTTTTCATTTCTTGCCCATCGCTTTGGAGGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100645 CTATACCCCAGCATTCTTTTCATTTCTTGCCCATCGCTTTGGAGGTAAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCATCCCTCACCACATTCACATCCTAGTGGGCAGTCTCTATGTGTTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100695 CCATCCCTCACCACATTCACATCCTAGTGGGCAGTCTCTATGTGTTAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCCCTATGCTAAACCCCATCATTTATGGGGTGAAGACCAAACAAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100745 CCCCCTATGCTAAACCCCATCATTTATGGGGTGAAGACCAAACAAATTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGATCGAGTGATTTTGCTTTTCTCTCCTATCAGTGTATGCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100795 AGATCGAGTGATTTTGCTTTTCTCTCCTATCAGTGTATGCTGT