seq1 = pF1KE0804.tfa, 867 bp
seq2 = pF1KE0804/gi568815587r_3117947.tfa (gi568815587r:3117947_3318813), 200867 bp

>pF1KE0804 867
>gi568815587r:3117947_3318813 (Chr11)

(complement)

1-867  (100001-100867)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTGGGCTGTTCGGCCTCTGGAGAACCTTCGACAGTGTGGTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTGGGCTGTTCGGCCTCTGGAGAACCTTCGACAGTGTGGTCTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGACGCTGATCGTGGGCCTCGGGGGACCGGTAGGTAACGGGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGACGCTGATCGTGGGCCTCGGGGGACCGGTAGGTAACGGGCTGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGGAACCTCGGCTTCCGCATCAAGAAGGGCCCCTTCTCCATCTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGGAACCTCGGCTTCCGCATCAAGAAGGGCCCCTTCTCCATCTACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCACCTGGCCGCCGCCGACTTCCTGTTCCTCTCCTGCCGTGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCACCTGGCCGCCGCCGACTTCCTGTTCCTCTCCTGCCGTGTGGGCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCGTGGCTCAGGCTGCCCTGGGCGCCCAGGACACACTCTACTTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCGTGGCTCAGGCTGCCCTGGGCGCCCAGGACACACTCTACTTCGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCACCTTCCTGTGGTTCGCGGTGGGGCTCTGGCTGCTGGCGGCCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCACCTTCCTGTGGTTCGCGGTGGGGCTCTGGCTGCTGGCGGCCTTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGAGCGCTGCCTCTCCGACCTCTTCCCCGCCTGCTACCAGGGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGGAGCGCTGCCTCTCCGACCTCTTCCCCGCCTGCTACCAGGGCTGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCCAGACACGCCTCGGCCGTCCTCTGCGCCCTGGTGTGGACCCCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCCAGACACGCCTCGGCCGTCCTCTGCGCCCTGGTGTGGACCCCGACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCCGGCCGTGCCGCTGCCCGCCAACGCCTGCGGCCTGCTGCGCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCCGGCCGTGCCGCTGCCCGCCAACGCCTGCGGCCTGCTGCGCAACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCGTGCCCCCTGGTCTGCCCGCGCTACCACGTGGCCAGCGTCACCTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCGTGCCCCCTGGTCTGCCCGCGCTACCACGTGGCCAGCGTCACCTGGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTGGTGCTGGCCCGCGTCGCCTGGACGGCTGGCGTGGTCCTCTTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTGGTGCTGGCCCGCGTCGCCTGGACGGCTGGCGTGGTCCTCTTTGTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGTGACCTGCTGCTCCACTCGCCCGCGGCCCAGGCTCTACGGCATCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGTGACCTGCTGCTCCACTCGCCCGCGGCCCAGGCTCTACGGCATCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGGCGCGCTGCTCCTGCTCTTCTTCTGTGGCCTGCCCTCGGTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGGCGCGCTGCTCCTGCTCTTCTTCTGTGGCCTGCCCTCGGTCTTCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGGAGCCTGCAGCCCCTGCTGAACTTCCTGCTGCCCGTGTTTTCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGGAGCCTGCAGCCCCTGCTGAACTTCCTGCTGCCCGTGTTTTCCCCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGCCACGCTGCTGGCCTGCGTCAACAGCAGCTCCAAGCCCCTCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGCCACGCTGCTGGCCTGCGTCAACAGCAGCTCCAAGCCCCTCATCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCGGGGTTGGGCCGACAGCCCGGGAAGCGGGAGCCGCTGAGGTCGGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCGGGGTTGGGCCGACAGCCCGGGAAGCGGGAGCCGCTGAGGTCGGTACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCGGAGGGCCCTGGGGGAGGGCGCCGAGCTGGGTGCCAGGGGACAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCGGAGGGCCCTGGGGGAGGGCGCCGAGCTGGGTGCCAGGGGACAGTCCC

    850     .    :    .
    851 TGCCCATGGGTCTCCTA
        |||||||||||||||||
 100851 TGCCCATGGGTCTCCTA