seq1 = pF1KE0799.tfa, 1503 bp
seq2 = pF1KE0799/gi568815589r_72801211.tfa (gi568815589r:72801211_73053000), 251790 bp

>pF1KE0799 1503
>gi568815589r:72801211_73053000 (Chr9)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-171  (112749-112853)   100% ->
172-312  (121982-122122)   100% ->
313-442  (123980-124109)   100% ->
443-504  (125824-125885)   100% ->
505-633  (127389-127517)   100% ->
634-747  (128869-128982)   100% ->
748-850  (134179-134281)   100% ->
851-1035  (135897-136081)   100% ->
1036-1200  (140879-141043)   100% ->
1201-1358  (143242-143399)   100% ->
1359-1433  (146969-147043)   100% ->
1434-1503  (151721-151790)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCATCCTCAGGCACGCCAGACTTACCTGTCCTACTCACCGATTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCATCCTCAGGCACGCCAGACTTACCTGTCCTACTCACCGATTTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATTCAATATACTAAG         ATCTTCATAAACAATGAATGGCATG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GATTCAATATACTAAGGTG...CAGATCTTCATAAACAATGAATGGCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTCAGTGAGTGGCAAGAAATTTCCTGTCTTTAATCCTGCAACTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112774 ATTCAGTGAGTGGCAAGAAATTTCCTGTCTTTAATCCTGCAACTGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCTCTGCCAGGTAGAAGAAGGAGATAAG         GAGGATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112824 GAGCTCTGCCAGGTAGAAGAAGGAGATAAGGTG...CAGGAGGATGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAGGCAGTGAAGGCCGCAAGACAGGCTTTTCAGATTGGATCCCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121993 CAAGGCAGTGAAGGCCGCAAGACAGGCTTTTCAGATTGGATCCCCGTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTACTATGGATGCTTCCGAGAGGGGGCGACTATTATACAAGTTGGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122043 GTACTATGGATGCTTCCGAGAGGGGGCGACTATTATACAAGTTGGCTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAATCGAAAGAGATCGTCTGCTGCTGGCG         ACAATGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 122093 TTAATCGAAAGAGATCGTCTGCTGCTGGCGGTG...CAGACAATGGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AATGAATGGTGGAAAACTCTATTCCAATGCATATCTGAATGATTTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123991 AATGAATGGTGGAAAACTCTATTCCAATGCATATCTGAATGATTTAGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCTGCATCAAAACATTGCGCTACTGTGCAGGTTGGGCTGACAAGATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124041 GCTGCATCAAAACATTGCGCTACTGTGCAGGTTGGGCTGACAAGATCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCCGTACAATACCAATTG         ATGGAAATTTTTTTACATATAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 124091 GGCCGTACAATACCAATTGGTA...CAGATGGAAATTTTTTTACATATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAGACATGAACCTATTGGTGTATGTGGCCAAATCATTCCT         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 125846 AAGACATGAACCTATTGGTGTATGTGGCCAAATCATTCCTGTA...TAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGAATTTCCCGTTGGTTATGCTCATTTGGAAGATAGGGCCTGCACTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127390 GGAATTTCCCGTTGGTTATGCTCATTTGGAAGATAGGGCCTGCACTGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGTGGAAACACAGTGGTTGTCAAACCAGCAGAGCAAACTCCTCTCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127440 TGTGGAAACACAGTGGTTGTCAAACCAGCAGAGCAAACTCCTCTCACTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TCTCCACGTGGCATCTTTAATAAAAGAG         GCAGGGTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 127490 TCTCCACGTGGCATCTTTAATAAAAGAGGTA...TAGGCAGGGTTTCCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGGAGTAGTGAATATTGTTCCTGGTTATGGGCCTACAGCAGGGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128882 CTGGAGTAGTGAATATTGTTCCTGGTTATGGGCCTACAGCAGGGGCAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTTCTTCTCACATGGATATAGACAAAGTAGCCTTCACAGGATCAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128932 ATTTCTTCTCACATGGATATAGACAAAGTAGCCTTCACAGGATCAACAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 G         GTTGGCAAGTTGATCAAAGAAGCTGCCGGGAAAAGCAATC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128982 GGTA...CAGGTTGGCAAGTTGATCAAAGAAGCTGCCGGGAAAAGCAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGAAGAGGGTGACCCTGGAGCTTGGAGGAAAGAGCCCTTGCATTGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134219 TGAAGAGGGTGACCCTGGAGCTTGGAGGAAAGAGCCCTTGCATTGTGTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCTGATGCCGACT         TGGACAATGCTGTTGAATTTGCACACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 134269 GCTGATGCCGACTGTG...CAGTGGACAATGCTGTTGAATTTGCACACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGGGGTATTCTACCACCAGGGCCAGTGTTGTATAGCCGCATCCAGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135925 TGGGGTATTCTACCACCAGGGCCAGTGTTGTATAGCCGCATCCAGGATTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TTGTGGAAGAATCAATTTATGATGAGTTTGTTCGAAGGAGTGTTGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135975 TTGTGGAAGAATCAATTTATGATGAGTTTGTTCGAAGGAGTGTTGAGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCTAAGAAGTATATCCTTGGAAATCCTCTGACCCCAGGAGTCACTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136025 GCTAAGAAGTATATCCTTGGAAATCCTCTGACCCCAGGAGTCACTCAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CCCTCAG         ATTGACAAGGAACAATATGATAAAATACTTGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136075 CCCTCAGGTA...TAGATTGACAAGGAACAATATGATAAAATACTTGACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCATTGAGAGTGGGAAGAAAGAAGGGGCCAAACTGGAATGTGGAGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140913 TCATTGAGAGTGGGAAGAAAGAAGGGGCCAAACTGGAATGTGGAGGAGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 CCGTGGGGGAATAAAGGCTACTTTGTCCAGCCCACAGTGTTCTCTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140963 CCGTGGGGGAATAAAGGCTACTTTGTCCAGCCCACAGTGTTCTCTAATGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TACAGATGAGATGCGCATTGCCAAAGAGGAG         ATTTTTGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141013 TACAGATGAGATGCGCATTGCCAAAGAGGAGGTA...TAGATTTTTGGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGTGCAGCAAATCATGAAGTTTAAATCTTTAGATGACGTGATCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143252 CAGTGCAGCAAATCATGAAGTTTAAATCTTTAGATGACGTGATCAAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GCAAACAATACTTTCTATGGCTTATCAGCAGGAGTGTTTACCAAAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143302 GCAAACAATACTTTCTATGGCTTATCAGCAGGAGTGTTTACCAAAGACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGATAAAGCCATAACAATCTCCTCTGCTCTGCAGGCAGGAACAGTGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 143352 TGATAAAGCCATAACAATCTCCTCTGCTCTGCAGGCAGGAACAGTGTGGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1359        GGTGAATTGCTATGGCGTGGTAAGTGCCCAGTGCCCCTTTGGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143402 A...CAGGGTGAATTGCTATGGCGTGGTAAGTGCCCAGTGCCCCTTTGGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GGATTCAAGATGTCTGGAAATGGAAGAGAACT         GGGAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 147012 GGATTCAAGATGTCTGGAAATGGAAGAGAACTGTA...TAGGGGAGAGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CGGTTTCCATGAATATACAGAGGTCAAAACAGTCACAGTGAAAATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151730 CGGTTTCCATGAATATACAGAGGTCAAAACAGTCACAGTGAAAATCTCTC

   1600     .    :
   1493 AGAAGAACTCA
        |||||||||||
 151780 AGAAGAACTCA