seq1 = pF1KE0795.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KE0795/gi568815581f_74648847.tfa (gi568815581f:74648847_74868653), 219807 bp

>pF1KE0795 1074
>gi568815581f:74648847_74868653 (Chr17)

1-441  (100001-100441)   100% ->
442-603  (113166-113327)   100% ->
604-757  (114521-114674)   100% ->
758-798  (118090-118130)   100% ->
799-888  (119301-119390)   100% ->
889-1074  (119622-119807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGCGGACGCAGCGGCCGGGGCGCCCCTGCCCCGGCTCTGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGCGGACGCAGCGGCCGGGGCGCCCCTGCCCCGGCTCTGCTGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGAAGGGTCCGAACGGCTACGGCTTCCACCTGCACGGGGAGAAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGAAGGGTCCGAACGGCTACGGCTTCCACCTGCACGGGGAGAAGGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTTGGGCCAGTACATCCGGCTGGTGGAGCCCGGCTCGCCGGCCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTTGGGCCAGTACATCCGGCTGGTGGAGCCCGGCTCGCCGGCCGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGGGCTGCTGGCGGGGGACCGGCTGGTGGAGGTGAACGGCGAAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGGGCTGCTGGCGGGGGACCGGCTGGTGGAGGTGAACGGCGAAAACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGAAGGAGACCCACCAGCAGGTGGTGAGCCGCATCCGCGCCGCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGAAGGAGACCCACCAGCAGGTGGTGAGCCGCATCCGCGCCGCACTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACGCCGTGCGCCTGCTGGTGGTCGACCCCGAGACGGACGAGCAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACGCCGTGCGCCTGCTGGTGGTCGACCCCGAGACGGACGAGCAGCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCTCGGCGTCCAGGTCCGAGAGGAGCTGCTGCGCGCCCAGGAAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCTCGGCGTCCAGGTCCGAGAGGAGCTGCTGCGCGCCCAGGAAGCGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGGCAGGCCGAGCCGCCGGCCGCCGCCGAGGTGCAGGGGGCTGGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGGCAGGCCGAGCCGCCGGCCGCCGCCGAGGTGCAGGGGGCTGGCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAATGAGCCTCGCGAGGCCGACAAGAGCCACCCGGAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100401 AAAATGAGCCTCGCGAGGCCGACAAGAGCCACCCGGAGCAGGTA...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGCGAGCTTCGGCCTCGGCTCTGTACCATGAAGAAGGGCCCCAGTGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113166 CGCGAGCTTCGGCCTCGGCTCTGTACCATGAAGAAGGGCCCCAGTGGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGGCTTCAACCTGCACAGCGACAAGTCCAAGCCAGGCCAGTTCATCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113216 TGGCTTCAACCTGCACAGCGACAAGTCCAAGCCAGGCCAGTTCATCCGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGTGGACCCAGACTCCCCGGCTGAGGCTTCAGGGCTCCGGGCCCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113266 CAGTGGACCCAGACTCCCCGGCTGAGGCTTCAGGGCTCCGGGCCCAGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCATTGTGGAG         GTGAACGGGGTCTGCATGGAGGGGAAGCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113316 CGCATTGTGGAGGTG...CAGGTGAACGGGGTCTGCATGGAGGGGAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCATGGGGACGTGGTGTCCGCCATCAGGGCTGGCGGGGACGAGACCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114550 GCATGGGGACGTGGTGTCCGCCATCAGGGCTGGCGGGGACGAGACCAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGCTGGTGGTGGACAGGGAAACTGACGAGTTCTTCAAGAAATGCAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114600 TGCTGGTGGTGGACAGGGAAACTGACGAGTTCTTCAAGAAATGCAGAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATCCCATCTCAGGAGCACCTGAATG         GTCCCCTGCCTGTGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 114650 ATCCCATCTCAGGAGCACCTGAATGGTA...TAGGTCCCCTGCCTGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CTTCACCAATGGGGAGATACAGAAG         GAGAACAGTCGTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 118106 CTTCACCAATGGGGAGATACAGAAGGTA...CAGGAGAACAGTCGTGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCCTGGCAGAGGCAGCCTTGGAGAGCCCCAGGCCAGCCCTGGTGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119317 CCCTGGCAGAGGCAGCCTTGGAGAGCCCCAGGCCAGCCCTGGTGAGATCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCCTCCAGTGACACCAGCGAGGAG         CTGAATTCCCAAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 119367 GCCTCCAGTGACACCAGCGAGGAGGTA...CAGCTGAATTCCCAAGACAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCCCCCAAAACAGGACTCCACAGCGCCCTCGTCTACCTCCTCCTCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119639 CCCCCCAAAACAGGACTCCACAGCGCCCTCGTCTACCTCCTCCTCCGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCATCCTAGACTTCAACATCTCCCTGGCCATGGCCAAAGAGAGGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119689 CCATCCTAGACTTCAACATCTCCCTGGCCATGGCCAAAGAGAGGGCCCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CAGAAACGCAGCAGCAAACGGGCCCCGCAGATGGACTGGAGCAAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119739 CAGAAACGCAGCAGCAAACGGGCCCCGCAGATGGACTGGAGCAAGAAAAA

   1100     .    :    .
   1056 CGAACTCTTCAGCAACCTC
        |||||||||||||||||||
 119789 CGAACTCTTCAGCAACCTC