seq1 = pF1KE0779.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KE0779/gi568815579r_55429736.tfa (gi568815579r:55429736_55636294), 206559 bp

>pF1KE0779 1044
>gi568815579r:55429736_55636294 (Chr19)

(complement)

1-253  (100001-100253)   99% ->
254-456  (104950-105152)   99% ->
457-1044  (105972-106559)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGGCAAACAGTCTGAGGAAGGGCCGGCGGAGGCAGGGGCTTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGGCAAACAGTCTGAGGAAGGGCCGGCGGAGGCAGGGGCTTCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACAGCGAGGAGGAGGGTCTGGGCGGCCTGACATTAGAGGAGCTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACAGCGAGGAGGAGGGTCTGGGCGGCCTGACATTAGAGGAGCTCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCCAGGAGGCTGCCCGCGCGCTGGAGGACATGATGACGCTGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCCAGGAGGCTGCCCGCGCGCTGGAGGACATGATGACGCTGAGTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGACCCTGGTCCGAGCCGAGGTGGACGAGCTCTACGAGGAAGTGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGACCCTGGTCCGAGCCGAGGTGGACGAGCTCTACGAGGAAGTGCGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGGCCAGGGTCGCTATGGCCGCGTCCTTCTGGTCACCCATCGTCAGA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGGCCAGGGTTGCTATGGCCGCGTCCTTCTGGTCACCCATCGTCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAG         GCACACCCCTGGCACTGAAGCAGCTCCCGAAACCCCGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGGTA...CAGGCACACCCCTGGCACTGAAGCAGCTCCCGAAACCCCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACGTCCCTCCGTGGCTTCCTGTACGAGTTCTGTGTGGGGCTCTCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104988 ACGTCCCTCCGTGGCTTCCTGTACGAGTTCTGTGTGGGGCTCTCGCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCGCACTCAGCCATCGTGACGGCCTACGGCATTGGCATCGAGTCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105038 CGCGCACTCAGCCATCGTGACGGCCTACGGCATTGGCATCGAGTCGGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTCCTACAGCTTCCTGACGGAGCCCGTCCTGCATGGGGACCTCATGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 105088 ACTCCTACAGCTTCCTGACGGAGCCCGTCCTGCACGGGGACCTCATGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCATCCAGCCCAAG         GTGGGCCTCCCGCAGCCCGCGGTGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105138 TTCATCCAGCCCAAGGTG...CAGGTGGGCCTCCCGCAGCCCGCGGTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGCTGCGCCGCCCAGCTGGCCTCCGCCCTGGAGTACATCCACGCCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105998 CCGCTGCGCCGCCCAGCTGGCCTCCGCCCTGGAGTACATCCACGCCCGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCCTGGTGTACCGGGACCTGAAGCCGGAGAACGTCCTGGTGTGCGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106048 GCCTGGTGTACCGGGACCTGAAGCCGGAGAACGTCCTGGTGTGCGACCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCTGCCGGCGCTTCAAGCTGACCGACTTCGGCCACACGAGGCCTCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106098 GCCTGCCGGCGCTTCAAGCTGACCGACTTCGGCCACACGAGGCCTCGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GACGCTGCTGCGCCTGGCCGGGCCGCCCATCCCCTACACGGCCCCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106148 GACGCTGCTGCGCCTGGCCGGGCCGCCCATCCCCTACACGGCCCCCGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCTGCGCGCCCCCGCCGCTCCCCGAGGGCCTGCCCATTCAGCCCGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106198 TCTGCGCGCCCCCGCCGCTCCCCGAGGGCCTGCCCATTCAGCCCGCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GACGCCTGGGCGCTGGGCGTCCTGCTCTTCTGCCTCCTCACGGGCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106248 GACGCCTGGGCGCTGGGCGTCCTGCTCTTCTGCCTCCTCACGGGCTACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCCCTGGGACCGGCCCCTGGCCGAGGCCGACCCCTTCTACGAGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106298 CCCCTGGGACCGGCCCCTGGCCGAGGCCGACCCCTTCTACGAGGACTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TCATCTGGCAGGCGTCGGGCCAGCCCCGGGACCGCCCTCAGCCCTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106348 TCATCTGGCAGGCGTCGGGCCAGCCCCGGGACCGCCCTCAGCCCTGGTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GGCCTGGCCCCCGCGGCCGACGCGCTTCTGCGGGGGCTGCTGGACCCTCA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106398 GGCCTGGCCGCCGCGGCCGACGCGCTTCTGCGGGGGCTGCTGGACCCTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCCCCGAAGGAGGAGCGCTGTGATCGCCATCAGGGAGCACCTGGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106448 CCCCCGAAGGAGGAGCGCTGTGATCGCCATCAGGGAGCACCTGGGGCGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CCTGGAGGCAGCGGGAGGGCGAGGCGGAGGCAGTGGGAGCGGTGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106498 CCTGGAGGCAGCGGGAGGGCGAGGCGGAGGCAGTGGGAGCGGTGGAAGAG

   1050     .    :
   1033 GAGGCTGGGCAG
        ||||||||||||
 106548 GAGGCTGGGCAG