seq1 = pF1KE0773.tfa, 1032 bp
seq2 = pF1KE0773/gi568815581r_8104874.tfa (gi568815581r:8104874_8310224), 205351 bp

>pF1KE0773 1032
>gi568815581r:8104874_8310224 (Chr17)

(complement)

1-48  (100001-100048)   100% ->
49-151  (102385-102487)   100% ->
152-206  (102600-102654)   100% ->
207-398  (102858-103049)   100% ->
399-537  (103337-103475)   100% ->
538-686  (103586-103734)   100% ->
687-861  (104835-105009)   100% ->
862-1032  (105181-105351)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGAAGGAGAACTCCTACCCCTGGCCCTACGGCCGACAGACG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGGCCCAGAAGGAGAACTCCTACCCCTGGCCCTACGGCCGACAGACGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        GCTCCATCTGGCCTGAGCACCCTGCCCCAGCGAGTCCTCCGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 A...CAGGCTCCATCTGGCCTGAGCACCCTGCCCCAGCGAGTCCTCCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGAGCCTGTCACCCCATCTGCACTTGTCCTCATGAGCCGCTCCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102428 AAGAGCCTGTCACCCCATCTGCACTTGTCCTCATGAGCCGCTCCAATGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCCCACAG         CTGCCCCTGGCCAGAAGGTGATGGAGAATAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102478 CAGCCCACAGGTA...TAGCTGCCCCTGGCCAGAAGGTGATGGAGAATAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAGTGGGACACCCGACATCTTAAC         GCGGCACTTCACAATTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102631 CAGTGGGACACCCGACATCTTAACGTA...CAGGCGGCACTTCACAATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGACTTTGAGATTGGGCGTCCTCTGGGCAAAGGCAAGTTTGGAAACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102875 ATGACTTTGAGATTGGGCGTCCTCTGGGCAAAGGCAAGTTTGGAAACGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TACTTGGCTCGGGAGAAGAAAAGCCATTTCATCGTGGCGCTCAAGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102925 TACTTGGCTCGGGAGAAGAAAAGCCATTTCATCGTGGCGCTCAAGGTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTCAAGTCCCAGATAGAGAAGGAGGGCGTGGAGCATCAGCTGCGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102975 CTTCAAGTCCCAGATAGAGAAGGAGGGCGTGGAGCATCAGCTGCGCAGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGATCGAAATCCAGGCCCACCTGCA         CCATCCCAACATCCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103025 AGATCGAAATCCAGGCCCACCTGCAGTA...CAGCCATCCCAACATCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CGTCTCTACAACTATTTTTATGACCGGAGGAGGATCTACTTGATTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103353 CGTCTCTACAACTATTTTTATGACCGGAGGAGGATCTACTTGATTCTAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTATGCCCCCCGCGGGGAGCTCTACAAGGAGCTGCAGAAGAGCTGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103403 GTATGCCCCCCGCGGGGAGCTCTACAAGGAGCTGCAGAAGAGCTGCACAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGACGAGCAGCGAACAGCCACG         ATCATGGAGGAGTTGGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103453 TTGACGAGCAGCGAACAGCCACGGTC...CAGATCATGGAGGAGTTGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATGCTCTAATGTACTGCCATGGGAAGAAGGTGATTCACAGAGACATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103604 GATGCTCTAATGTACTGCCATGGGAAGAAGGTGATTCACAGAGACATAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCCAGAAAATCTGCTCTTAGGGCTCAAGGGAGAGCTGAAGATTGCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103654 GCCAGAAAATCTGCTCTTAGGGCTCAAGGGAGAGCTGAAGATTGCTGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TCGGCTGGTCTGTGCATGCGCCCTCCCTGAG         GAGGAAGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103704 TCGGCTGGTCTGTGCATGCGCCCTCCCTGAGGTA...CAGGAGGAAGACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGTGTGGCACCCTGGACTACCTGCCCCCAGAGATGATTGAGGGGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104845 ATGTGTGGCACCCTGGACTACCTGCCCCCAGAGATGATTGAGGGGCGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GCACAATGAGAAGGTGGATCTGTGGTGCATTGGAGTGCTTTGCTATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104895 GCACAATGAGAAGGTGGATCTGTGGTGCATTGGAGTGCTTTGCTATGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCTGGTGGGGAACCCACCCTTTGAGAGTGCATCACACAACGAGACCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 TGCTGGTGGGGAACCCACCCTTTGAGAGTGCATCACACAACGAGACCTAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGCCGCATCGTCAAG         GTGGACCTAAAGTTCCCCGCTTCTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| ||
 104995 CGCCGCATCGTCAAGGTG...CAGGTGGACCTAAAGTTCCCCGCTTCCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCCCACGGGAGCCCAGGACCTCATCTCCAAACTGCTCAGGCATAACCCCT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105207 GCCCATGGGAGCCCAGGACCTCATCTCCAAACTGCTCAGGCATAACCCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CGGAACGGCTGCCCCTGGCCCAGGTCTCAGCCCACCCTTGGGTCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105257 CGGAACGGCTGCCCCTGGCCCAGGTCTCAGCCCACCCTTGGGTCCGGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    988 AACTCTCGGAGGGTGCTGCCTCCCTCTGCCCTTCAATCTGTCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105307 AACTCTCGGAGGGTGCTGCCTCCCTCTGCCCTTCAATCTGTCGCC