seq1 = pF1KE0769.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KE0769/gi568815597r_20621795.tfa (gi568815597r:20621795_20826057), 204263 bp

>pF1KE0769 1017
>gi568815597r:20621795_20826057 (Chr1)

(complement)

1-138  (100001-100138)   100% ->
139-378  (101423-101662)   99% ->
379-547  (101807-101975)   100% ->
548-656  (102324-102432)   100% ->
657-816  (103143-103302)   100% ->
817-1017  (104063-104263)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCATGCCCTGAGGCGCATACTCTACTCCACCTGGTGCCCTGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCATGCCCTGAGGCGCATACTCTACTCCACCTGGTGCCCTGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCAGTTTGCCTTCATGGCTCGAAACCCACGGAGCCCAGCCAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCAGTTTGCCTTCATGGCTCGAAACCCACGGAGCCCAGCCAGCAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCTGCCACCTCTTTGTGGGCAGCCAGCCAGGAGAG         GTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100101 TCTTCTGCCACCTCTTTGTGGGCAGCCAGCCAGGAGAGGTA...CAGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGATCCTGCACCTGCTGCTGTGCCGCTCTTTCCAGCTGGCTTACCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101426 CAGATCCTGCACCTGCTGCTGTGCCGCTCTTTCCAGCTGGCTTACCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGCACCCTGAGGAGCGGGCACAGCCAGAGCCCTGCCCAGGGCCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101476 GCAGCACCCTGAGGAGCGGGCACAGCCAGAGCCCTGCCCAGGGCCCACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGAGGTGCCCCTGAAGCCACTGTCCAGCTCTGGGGGCCTGGTGCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101526 GGGAGGTGCCCCTGAAGCCACTGTCCAGCTCTGGGGGCCTGGTGCGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCTTCGGCCGTGATCAACTCTCTCAGAACGTCCATGCCCTGGTCTCCTT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101576 CCCTTCGGCCGTGATCAGCTCTCTCAGAACGTCCATGCCCTGGTCTCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCGGCGGCTGCCAGCAGAGGGGCTGGTGGGCAGTGGG         AAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101626 TCGGCGGCTGCCAGCAGAGGGGCTGGTGGGCAGTGGGGTA...TAGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCTGCCAGAGTCGGAAGGCCGTGCCCGCCATGCCCGCCTGGGGAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101811 AGCTGCCAGAGTCGGAAGGCCGTGCCCGCCATGCCCGCCTGGGGAATCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TACTGCTCGCCCACGCTGGTGCGCAAGAAGGCCATTCGCAGCAAGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101861 TACTGCTCGCCCACGCTGGTGCGCAAGAAGGCCATTCGCAGCAAGGTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGCTCGGGGGCCTACCGCGGCTGCACCTATGAGACCCAGCTGCAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101911 CCGCTCGGGGGCCTACCGCGGCTGCACCTATGAGACCCAGCTGCAGCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CGGCTCGGGAGGCCT         TTCCTGCCGCATGGGAGGCATGGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101961 CGGCTCGGGAGGCCTGTG...CAGTTCCTGCCGCATGGGAGGCATGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGGGGTCCTGGTGGCCACTCGTGCCTGGTGGAGAGCGAGGGCAGCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102350 CGGGGTCCTGGTGGCCACTCGTGCCTGGTGGAGAGCGAGGGCAGCCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAGAACATCTGGGCCTTCGCTGGCATCTCCAG         GCCCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102400 GGAGAACATCTGGGCCTTCGCTGGCATCTCCAGGTA...TAGGCCCTGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCTGGCCCTGTTGCGGAGAGACGTGCTGGGGGCCTTCCTGCTGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103151 CCCTGGCCCTGTTGCGGAGAGACGTGCTGGGGGCCTTCCTGCTGTGGCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGCTGGGTGCTAGCGGCCAGTGGTGTCTGTCCGTGCGCACGCAGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103201 GAGCTGGGTGCTAGCGGCCAGTGGTGTCTGTCCGTGCGCACGCAGTGCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGTGGTGCCCCACCAGGTCTTCCGGAACCACCTGGGCCGCTACTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103251 CGTGGTGCCCCACCAGGTCTTCCGGAACCACCTGGGCCGCTACTGCTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AG         CACCTGCCGGCAGAGTTCCCCAGCCTGGAGGCTCTGGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103301 AGGTA...TAGCACCTGCCGGCAGAGTTCCCCAGCCTGGAGGCTCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGAACCACGCGGTTACTGAACGTAGCCTCTTCTGTCCCCTCGACATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104102 GAGAACCACGCGGTTACTGAACGTAGCCTCTTCTGTCCCCTCGACATGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCGCCTGAACCCCACCTACGAGGAGCAGGACTGTGGGCCCCCAGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104152 CCGCCTGAACCCCACCTACGAGGAGCAGGACTGTGGGCCCCCAGGCAGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGCCCCGGACTCTCCGGCCCCTCAGCCATGCCAAGTCCGAGGCAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104202 CGCCCCGGACTCTCCGGCCCCTCAGCCATGCCAAGTCCGAGGCAGAGCTG

   1050     .    :
   1006 CAGGGCCTGGGC
        ||||||||||||
 104252 CAGGGCCTGGGC