seq1 = pF1KE0768.tfa, 1314 bp
seq2 = pF1KE0768/gi568815586r_48242976.tfa (gi568815586r:48242976_48448118), 205143 bp

>pF1KE0768 1314
>gi568815586r:48242976_48448118 (Chr12)

(complement)

1-17  (98057-98073)   100% ->
18-226  (100004-100212)   100% ->
227-318  (100776-100867)   100% ->
319-448  (102645-102774)   100% ->
449-562  (103407-103520)   100% ->
563-1314  (104392-105143)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGCTGAGGACAG         GTCACAATTTGGGTCTGCAGCAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  98057 ATGCAAGCTGAGGACAGGTA...CAGGTCACAATTTGGGTCTGCAGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AATGCTTTCAGAACAGACAGCAGCGCTGGGGACAGGATGGGAATCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100028 AATGCTTTCAGAACAGACAGCAGCGCTGGGGACAGGATGGGAATCAATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGTACAGCTGGATGGAGCAGAGCCCCAGGTGGAAAGGGGAAGCCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100078 ATGTACAGCTGGATGGAGCAGAGCCCCAGGTGGAAAGGGGAAGCCAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCGGCCATGGAGAACAGTACCAGGACCTCTGGAGCACCTGTGCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100128 GAGCGGCCATGGAGAACAGTACCAGGACCTCTGGAGCACCTGTGCTGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTTGAAGAGGAGCCACAGTCCCTTCAGGAGAAGG         CTCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100178 CCTTGAAGAGGAGCCACAGTCCCTTCAGGAGAAGGGTG...CAGCTCAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCTCCCTGGGTTCCTGCAATTCCCCAGGAGGGGAACACTGGAGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100782 CTGCTCCCTGGGTTCCTGCAATTCCCCAGGAGGGGAACACTGGAGACTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGATGGCAGCTGCACTTCTTGCGGCTGGATCACAG         GGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100832 GAGATGGCAGCTGCACTTCTTGCGGCTGGATCACAGGTG...CAGGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTAACCATCAAGGATGTGTCACTGTGCTTCTCTCAGGAGGAGTGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102650 GGTAACCATCAAGGATGTGTCACTGTGCTTCTCTCAGGAGGAGTGGCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTGGACCCCTCTCAGACAGACTTTTATGGAGAATATGTCATGCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102700 GCCTGGACCCCTCTCAGACAGACTTTTATGGAGAATATGTCATGCAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACTGTGGGATAGTAGTCTCTCTGA         GATTTCCAATTCCCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102750 AACTGTGGGATAGTAGTCTCTCTGAGTA...CAGGATTTCCAATTCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACTGGACATGCTTTCTCAACTAGAAGGAGGAGAAGAACAATGGGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103423 ACTGGACATGCTTTCTCAACTAGAAGGAGGAGAAGAACAATGGGTCCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCCCCAGGACTTAGAGGAGAGGGACATTCTGAGGGTCACATATACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103473 ACCCCCAGGACTTAGAGGAGAGGGACATTCTGAGGGTCACATATACAGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    563        GAGATGGAAGTGAACATGAGGGGGATACCCCTGAACTAGAAGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103523 A...CAGGAGATGGAAGTGAACATGAGGGGGATACCCCTGAACTAGAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAACCTCCCAGAATGTTATCCAGCGTGTCTGAAGATACTGTTCTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104435 AGAACCTCCCAGAATGTTATCCAGCGTGTCTGAAGATACTGTTCTCTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ACCCGGAGCATGATGAGAGCTGGGATTCCATGCCCAGCAGCTCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104485 ACCCGGAGCATGATGAGAGCTGGGATTCCATGCCCAGCAGCTCCAGAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGCTCCTGGGGCCCCCTTTTCTTCAGGAAGATAGTTTCTCAAACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104535 ATGCTCCTGGGGCCCCCTTTTCTTCAGGAAGATAGTTTCTCAAACCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GTGTAGCACAGAGATGGATTCCCTGTTAAGACCCCACACATGCCCCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104585 GTGTAGCACAGAGATGGATTCCCTGTTAAGACCCCACACATGCCCCCAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTGGGAAACAGTTTGTATGGGGTTCCCACCTTGCCAGGCATCAACAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104635 GTGGGAAACAGTTTGTATGGGGTTCCCACCTTGCCAGGCATCAACAAACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CACACTGGGGAGAGACCCTACAGCTGCCTCAAGTGTGAGAAGACCTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104685 CACACTGGGGAGAGACCCTACAGCTGCCTCAAGTGTGAGAAGACCTTTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCGAAGACATCACCTCATCAGGCACCAGAAAACCCACCTACATGACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104735 GCGAAGACATCACCTCATCAGGCACCAGAAAACCCACCTACATGACAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCAGCAGGTGCTCTGAGTGTGGTAAGAATTTCCGATGCAACTCCCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104785 CCAGCAGGTGCTCTGAGTGTGGTAAGAATTTCCGATGCAACTCCCATCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCCAGCCACCAGAGAGTGCATGCAGAAGGCAAATCCTGCAAAGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104835 GCCAGCCACCAGAGAGTGCATGCAGAAGGCAAATCCTGCAAAGGCCAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGTTGGAGAGAGCCCTGGCACAAGGAAACGGCAGCGTGCCCCACCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104885 GGTTGGAGAGAGCCCTGGCACAAGGAAACGGCAGCGTGCCCCACCAGTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAAAGTGTCACGTGTGCACTGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCCGAAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104935 CAAAGTGTCACGTGTGCACTGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCCGAAGGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CACCTTGTGAGACACTGGCTGACCCACACTGGGGAGAAGCCCTTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104985 CACCTTGTGAGACACTGGCTGACCCACACTGGGGAGAAGCCCTTCCAGTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CCCTCGCTGTGAGAAGAGCTTTGGCCGAAAACATCACCTGGACAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105035 CCCTCGCTGTGAGAAGAGCTTTGGCCGAAAACATCACCTGGACAGGCACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TGCTCACCCACCAGGGACAAAGTCCCCGGAACAGCTGGGACAGAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105085 TGCTCACCCACCAGGGACAAAGTCCCCGGAACAGCTGGGACAGAGGAACA

   1350     .
   1306 TCTGTCTTT
        |||||||||
 105135 TCTGTCTTT