seq1 = pF1KE0764.tfa, 1311 bp
seq2 = pF1KE0764/gi568815592r_154059831.tfa (gi568815592r:154059831_154365947), 306117 bp

>pF1KE0764 1311
>gi568815592r:154059831_154365947 (Chr6)

(complement)

1-36  (100001-100036)   100% ->
37-73  (118463-118499)   100% ->
74-243  (119188-119357)   100% ->
244-317  (142705-142778)   100% ->
318-389  (144620-144691)   100% ->
390-448  (151672-151730)   100% ->
449-534  (153093-153178)   100% ->
535-907  (165908-166280)   100% ->
908-1101  (197835-198028)   100% ->
1102-1311  (205908-206117)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACATCATACATGGCTATTGATGGCAGTGCTCTT         GTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100001 ATGACATCATACATGGCTATTGATGGCAGTGCTCTTGTA...CAGGTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTGCGTCAGAAGCCCAGGAGGAAAACTCAAG         GTTTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 118468 CTTGCGTCAGAAGCCCAGGAGGAAAACTCAAGGTA...CAGGTTTTCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CGATGAGTCGGAGGAGGATATCGTGTAAAGATCTGGGCCATGCTGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119197 CGATGAGTCGGAGGAGGATATCGTGTAAAGATCTGGGCCATGCTGACTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAAGGGTGGCTGTATAAGAAAAAGGAAAAGGGAAGTTTCCTAAGCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119247 CAAGGGTGGCTGTATAAGAAAAAGGAAAAGGGAAGTTTCCTAAGCAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ATGGAAAAAGTTCTGGGTGATACTGAAGGGGTCGTCACTGTACTGGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119297 ATGGAAAAAGTTCTGGGTGATACTGAAGGGGTCGTCACTGTACTGGTATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCAATCAAATG         GCAGAGAAAGCTGATGGATTTGTCAACCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 119347 GCAATCAAATGGTG...CAGGCAGAGAAAGCTGATGGATTTGTCAACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCTGATTTCACTGTGGAAAGAGCATCTGAATGCAAGAAAAAGCA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 142735 CCTGATTTCACTGTGGAAAGAGCATCTGAATGCAAGAAAAAGCAGTA...

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    318    TGCTTTTAAGATCAGCCATCCACAGATCAAGACCTTTTATTTTGCAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144617 AAGTGCTTTTAAGATCAGCCATCCACAGATCAAGACCTTTTATTTTGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTGAGAATGTGCAGGAAATGAACGT         GTGGTTAAATAAACTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 144667 CTGAGAATGTGCAGGAAATGAACGTGTA...TAGGTGGTTAAATAAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GGATCGGCTGTAATCCATCAGGAATCCACTACAAAGGATGAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 151688 GGATCGGCTGTAATCCATCAGGAATCCACTACAAAGGATGAAGGTA...T

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    449   AATGTTACAGTGAAAGTGAACAGGAAGATCCAGAAATAGCTGCGGAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153091 AGAATGTTACAGTGAAAGTGAACAGGAAGATCCAGAAATAGCTGCGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CACCACCCCCTCCTCACGCTTCCCAGACTCAGTCTTTG         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 153141 CACCACCCCCTCCTCACGCTTCCCAGACTCAGTCTTTGGTA...TAGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GCACAGCAGGCATCTTCATCCTCACCCAGCCTGAGTGGAACGTCGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165911 GCACAGCAGGCATCTTCATCCTCACCCAGCCTGAGTGGAACGTCGTATTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TTTCTCTTCCCTGGAAAATACAGTGAAGACACCCAGCAGTTTTCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165961 TTTCTCTTCCCTGGAAAATACAGTGAAGACACCCAGCAGTTTTCCTTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 CCTTATCTAAAGAGAGACAATCCTTGCCTGACACAGTTAACAGTTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166011 CCTTATCTAAAGAGAGACAATCCTTGCCTGACACAGTTAACAGTTTGTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GCTGCTGAAGATGAGGGACAACCAATAACGTTTGCTGTGCAAGTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166061 GCTGCTGAAGATGAGGGACAACCAATAACGTTTGCTGTGCAAGTTCATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 ACCTGTACCCTCAGAGGCAGGCATCCACAAGGCCCTGGAAAACAGTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166111 ACCTGTACCCTCAGAGGCAGGCATCCACAAGGCCCTGGAAAACAGTTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCACATCAGAAAGTGGATTTTTGAACTCTTTATCTAGTGATGATACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166161 TCACATCAGAAAGTGGATTTTTGAACTCTTTATCTAGTGATGATACTTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TCATTGAGTAGCAATCATGACCATCTTACTGTCCCAGATAAGCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166211 TCATTGAGTAGCAATCATGACCATCTTACTGTCCCAGATAAGCCTGCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 ATCAAAGATCATGGACAAAG         AAGAGACAAAAGTGTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 166261 ATCAAAGATCATGGACAAAGGTA...TAGAAGAGACAAAAGTGTCTGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ATGATGAAATGGAGAAGCTGTACAAATCATTAGAGCAAGCTAGTCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197856 ATGATGAAATGGAGAAGCTGTACAAATCATTAGAGCAAGCTAGTCTATCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CCTCTTGGGGACCGACGACCTTCGACTAAAAAGGAGTTGAGAAAATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197906 CCTCTTGGGGACCGACGACCTTCGACTAAAAAGGAGTTGAGAAAATCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TGTTAAGCGGTGTAAAAATCCATCTATAAACGAGAAACTCCACAAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197956 TGTTAAGCGGTGTAAAAATCCATCTATAAACGAGAAACTCCACAAAATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAACATTGAATAGCACATTAAAG         TGTAAAGAACATGATCTG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 198006 GAACATTGAATAGCACATTAAAGGTA...CAGTGTAAAGAACATGATCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GCCATGATTAACCAGTTGCTGGATGACCCGAAGCTGACAGCCAGGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205926 GCCATGATTAACCAGTTGCTGGATGACCCGAAGCTGACAGCCAGGAAATA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CAGAGAGTGGAAAGTCATGAACACCCTGCTGATCCAGGACATCTATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205976 CAGAGAGTGGAAAGTCATGAACACCCTGCTGATCCAGGACATCTATCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AGCAGCGGGCTTCGCCTGCCCCTGATGACACTGATGACACCCCCCAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206026 AGCAGCGGGCTTCGCCTGCCCCTGATGACACTGATGACACCCCCCAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CTCAAGAAATCACCTTCTTCTCCCTCTGTTGAAAATTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206076 CTCAAGAAATCACCTTCTTCTCCCTCTGTTGAAAATTCCATT