seq1 = pF1KE0760.tfa, 1296 bp
seq2 = pF1KE0760/gi568815579r_36791495.tfa (gi568815579r:36791495_37015167), 223673 bp

>pF1KE0760 1296
>gi568815579r:36791495_37015167 (Chr19)

(complement)

1-38  (100001-100038)   100% ->
39-96  (100146-100203)   100% ->
97-223  (106709-106835)   100% ->
224-319  (107144-107239)   100% ->
320-1296  (122697-123673)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCATTCTCCTCTGATCTCCATTCCTCATGTGTG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100001 ATGCCCCATTCTCCTCTGATCTCCATTCCTCATGTGTGGTG...CAGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCACCCAGAAGAGGAGGAAAGAATGCATGATGAACTTCTACAAGCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 TCACCCAGAAGAGGAGGAAAGAATGCATGATGAACTTCTACAAGCAGTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAAG         GGGCCGGTGATGTTCAGGGATGTTTCCATAGACTTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100199 CCAAGGTG...CAGGGGCCGGTGATGTTCAGGGATGTTTCCATAGACTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTCAAGAGGAATGGGAATGCCTGGACGCTGATCAGATGAATTTATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106745 TCTCAAGAGGAATGGGAATGCCTGGACGCTGATCAGATGAATTTATACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGAAGTGATGTTGGAGAATTTCAGCAACCTGGTTTCAGTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 106795 AGAAGTGATGTTGGAGAATTTCAGCAACCTGGTTTCAGTGGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GACTTTCCAATTCTAAGCCAGCTGTGATCTCCTTATTGGAACAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107144 GACTTTCCAATTCTAAGCCAGCTGTGATCTCCTTATTGGAACAAGGAAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGCCCTGGATGGTTGATAGAGAGCTGACTAGAGGCCTGTGTTCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107194 GAGCCCTGGATGGTTGATAGAGAGCTGACTAGAGGCCTGTGTTCAGGTA.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    320      ATCTGGAATCAATGTGTGAGACCAAAATATTATCTCTAAAGAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107244 ..CAGATCTGGAATCAATGTGTGAGACCAAAATATTATCTCTAAAGAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GACATTTCAGTCAAGTAATAATTACCCGTGAAGACATGTCTACTTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122742 GACATTTCAGTCAAGTAATAATTACCCGTGAAGACATGTCTACTTTTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGCCCACATTTCTTATTCCACCTCAAAAAACTATGAGTGAAGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122792 CAGCCCACATTTCTTATTCCACCTCAAAAAACTATGAGTGAAGAGAAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATGGGAATGTAAGATATGTGGAAAGACCTTTAATCAAAACTCACAATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122842 ATGGGAATGTAAGATATGTGGAAAGACCTTTAATCAAAACTCACAATTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCCAACATCAGAGAATTCATTTTGGTGAAAAACACTATGAATCTAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122892 TCCAACATCAGAGAATTCATTTTGGTGAAAAACACTATGAATCTAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATGGGAAGTCCTTTAGTCGTGGCTCACTCGTTACTCGACATCAGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122942 TATGGGAAGTCCTTTAGTCGTGGCTCACTCGTTACTCGACATCAGAGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TCACACTGGTAAAAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAAGGCTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122992 TCACACTGGTAAAAAACCCTATGAATGTAAGGAATGTGGCAAGGCTTTTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTGTAGTTCATATTTTTCTCAACATCAGAGGATTCACACTGGTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123042 GTTGTAGTTCATATTTTTCTCAACATCAGAGGATTCACACTGGTGAGAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCCTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATTGCTCAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123092 CCCTATGAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCCTTTAAGTATTGCTCAAACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAATGATCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123142 TAATGATCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAACCCTATGAATGTAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TATGTGGAAAAGCCTTTACTAAAAGTTCACAACTTTTTCTACATCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123192 TATGTGGAAAAGCCTTTACTAAAAGTTCACAACTTTTTCTACATCTGAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATTCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123242 ATTCATACTGGTGAGAAACCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TACTCAACACTCAAGGCTTATTCAGCATCAGAGAATGCATACTGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123292 TACTCAACACTCAAGGCTTATTCAGCATCAGAGAATGCATACTGGTGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAGGCCTTTAATAGTGCCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123342 AACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAGGCCTTTAATAGTGCCTCAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CTTACTAACCATCACAGAATTCATGCTGGTGAGAAGCTCTATGAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123392 CTTACTAACCATCACAGAATTCATGCTGGTGAGAAGCTCTATGAATGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 AGAATGTAGAAAGGCCTTTATTCAGAGCTCAGAACTTATTCAACATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123442 AGAATGTAGAAAGGCCTTTATTCAGAGCTCAGAACTTATTCAACATCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GAATCCATACAGATGAAAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123492 GAATCCATACAGATGAAAAACCATATGAATGTAATGAATGTGGGAAGGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TTTAATAAAGGCTCAAATCTTACTCGACATCAGAGAATTCACACTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123542 TTTAATAAAGGCTCAAATCTTACTCGACATCAGAGAATTCACACTGGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GAAACCCTATGACTGTAAGGAATGTGGAAAGGCTTTTGGTAGTCGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123592 GAAACCCTATGACTGTAAGGAATGTGGAAAGGCTTTTGGTAGTCGCTCTG

   1300     .    :    .    :    .    :
   1265 ACCTCATTCGCCATGAGGGAATTCATACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 123642 ACCTCATTCGCCATGAGGGAATTCATACTGGT