seq1 = pF1KE0740.tfa, 1272 bp
seq2 = pF1KE0740/gi568815582r_3336427.tfa (gi568815582r:3336427_3540936), 204510 bp

>pF1KE0740 1272
>gi568815582r:3336427_3540936 (Chr16)

(complement)

1-33  (97784-97816)   100% ->
34-160  (100004-100130)   99% ->
161-1272  (103399-104510)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCATGCCCCCGACGCCCGAGGCCCAG         GGACCAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  97784 ATGGCGTCCATGCCCCCGACGCCCGAGGCCCAGGTG...CAGGGACCAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ACTGTTTGAGGATCTGGCTGTGTATTTTTCTCAAGAGGAGTGCGTGACTC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 ACTCTTTGAGGATCTGGCTGTGTATTTTTCTCAAGAGGAGTGCGTGACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACCCTGCCCAGAGGTCCCTCAGCAAAGATGGTACAAAAGAGTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TGCACCCTGCCCAGAGGTCCCTCAGCAAAGATGGTACAAAAGAGTCTTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGATGCGGCTTTGATGG         GAGAGGAAGGCAAGCCTGAGAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 GAGGATGCGGCTTTGATGGGTA...CAGGAGAGGAAGGCAAGCCTGAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAATCAGCAGTTAAGCCTAGAGTCTATGGAACTTGACGAGCTTGCCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103421 TAATCAGCAGTTAAGCCTAGAGTCTATGGAACTTGACGAGCTTGCCTTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAAAGTACCCCATTGCTGCACCCCTTGTCCCTTACCCAGAAAAATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103471 AAAAGTACCCCATTGCTGCACCCCTTGTCCCTTACCCAGAAAAATCCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGATGGAGTTGGAAACCCTGAAGCGAAAATATTAAGTGGAACTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103521 GAGGATGGAGTTGGAAACCCTGAAGCGAAAATATTAAGTGGAACTCCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACAAGAGAAGGGTCATCAGCCTTTTAGTTACCATTGAAAACCACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103571 TTACAAGAGAAGGGTCATCAGCCTTTTAGTTACCATTGAAAACCACACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CATTAGTAGAACTCTCTGAATATTTAGGAACCAACACACTTTCTGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103621 CATTAGTAGAACTCTCTGAATATTTAGGAACCAACACACTTTCTGAAATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTGATTCTCCCTGGGAAGGAGCCAAAAATGTGTACAAATGTCCTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103671 CTTGATTCTCCCTGGGAAGGAGCCAAAAATGTGTACAAATGTCCTGAGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGACCAAAACTTCAGCGATCATTCATACCTAGTTTTGCATCAGAAAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103721 TGACCAAAACTTCAGCGATCATTCATACCTAGTTTTGCATCAGAAAATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATTCAGGAGAGAAAAAACATAAATGTGGTGACTGTGGAAAGATCTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103771 ATTCAGGAGAGAAAAAACATAAATGTGGTGACTGTGGAAAGATCTTCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CATAGAGCCAACCTGAGGACACACAGGAGAATCCATACTGGTGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103821 CATAGAGCCAACCTGAGGACACACAGGAGAATCCATACTGGTGAGAAACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTATAAGTGTGCCAAGTGCAGTGCCAGCTTTCGCCAGCACTCTCATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103871 TTATAAGTGTGCCAAGTGCAGTGCCAGCTTTCGCCAGCACTCTCATCTAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCCGACACATGAATAGCCACGTAAAGGAGAAGCCCTATACATGTAGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103921 CCCGACACATGAATAGCCACGTAAAGGAGAAGCCCTATACATGTAGCATA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTGGTAGAGGTTTTATGTGGCTCCCAGGATTGGCACAGCATCAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103971 TGTGGTAGAGGTTTTATGTGGCTCCCAGGATTGGCACAGCATCAGAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCACAGTGCTGAAAACACCTACGAATCTACTAACTGTGATAAACATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104021 CCACAGTGCTGAAAACACCTACGAATCTACTAACTGTGATAAACATTTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ATGAGAAACCAAATCTTGCTTTGCCTGAGGAAACATTCGTATCAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104071 ATGAGAAACCAAATCTTGCTTTGCCTGAGGAAACATTCGTATCAGGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CAGTACCAGCACACTAAGTGCATGAAGAGCTTCAGGCAGTCCTTATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104121 CAGTACCAGCACACTAAGTGCATGAAGAGCTTCAGGCAGTCCTTATATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGCCCTTTCCGAGAAGAGCCACGACGAGGACTCTGAACGCTGCAGCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104171 TGCCCTTTCCGAGAAGAGCCACGACGAGGACTCTGAACGCTGCAGCGATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATGGGGACAATTTCTTCTCATTCTCAAAATTCAAGCCCTTACAGTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104221 ATGGGGACAATTTCTTCTCATTCTCAAAATTCAAGCCCTTACAGTGTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GACTGTGACATGACCTTTCCTTGTTTCTCTGAGCTTATTTCCCATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104271 GACTGTGACATGACCTTTCCTTGTTTCTCTGAGCTTATTTCCCATCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CATTCATACAGAGGAAAGGCCCCATAAGTGCAAAACATGCGAGGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104321 CATTCATACAGAGGAAAGGCCCCATAAGTGCAAAACATGCGAGGAAAGTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TTGCTTTGGACTCAGAACTTGCATGCCACCAGAAGAGCCACATGCTAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104371 TTGCTTTGGACTCAGAACTTGCATGCCACCAGAAGAGCCACATGCTAGCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GAACCTTTTAAATGTACCGTGTGTGGGAAAACTTTCAAGTCGAATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104421 GAACCTTTTAAATGTACCGTGTGTGGGAAAACTTTCAAGTCGAATTTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TCTCATTACTCATAAGCGAACTCACATAAAAAACACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104471 TCTCATTACTCATAAGCGAACTCACATAAAAAACACCACG