seq1 = pF1KE0736.tfa, 1269 bp
seq2 = pF1KE0736/gi568815583r_45067950.tfa (gi568815583r:45067950_45299074), 231125 bp

>pF1KE0736 1269
>gi568815583r:45067950_45299074 (Chr15)

(complement)

1-303  (100001-100303)   100% ->
304-445  (120769-120910)   100% ->
446-652  (123650-123856)   99% ->
653-793  (125359-125499)   100% ->
794-965  (126757-126928)   100% ->
966-1085  (127073-127192)   100% ->
1086-1269  (130942-131125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCAGGAGGGAGGACCCGTGAGGAGCGCCCCCTGTAGGACCGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCAGGAGGGAGGACCCGTGAGGAGCGCCCCCTGTAGGACCGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGAGGGTTCGCGGCAAGGGTCTCCGGGGCATAGGAAACGGGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGAGGGTTCGCGGCAAGGGTCTCCGGGGCATAGGAAACGGGCATCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAGGGTAGTCTGAGTTCCGCCCAGCCCCATTCCTGGATGCTCACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAGGGTAGTCTGAGTTCCGCCCAGCCCCATTCCTGGATGCTCACGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTCCCCTAAACTCCCACTGCGCTCACCGGGAGCCCATCTCATCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTCCCCTAAACTCCCACTGCGCTCACCGGGAGCCCATCTCATCATCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGCCCGTGGCTAATGGGCCAAAACAGAAGAAGAAAAGCAACTGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGCCCGTGGCTAATGGGCCAAAACAGAAGAAGAAAAGCAACTGGCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTACAACGCGCCTGCGCATTATCAGACTCAGGGACAGGCTGGAACCTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTACAACGCGCCTGCGCATTATCAGACTCAGGGACAGGCTGGAACCTCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCC         CTAGCTATCCTAGAAGACTATGCGGACCCGTTTGATGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGTA...CAGCTAGCTATCCTAGAAGACTATGCGGACCCGTTTGATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAGGAGACTGGCGAAGGCTCAGCAGGAGCTTCAGGAGCCCCAGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120807 TCAGGAGACTGGCGAAGGCTCAGCAGGAGCTTCAGGAGCCCCAGAGAAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCCTGAAAATGATGGCTACATGGAGCCCTATGAGGCTCAAAAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120857 TCCCTGAAAATGATGGCTACATGGAGCCCTATGAGGCTCAAAAGATGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCG         AGATCCGGGGCTCCAAGGAGACAGCAACTCAGCCCTT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120907 GCCGGTG...CAGAGATCCGGGGCTCCAAGGAGACAGCAACTCAGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCTCTGTATGACACACCCTATGAGCCAGAGGAGGATGGGGCCACCCCGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 123687 GCCTCTGTATGACACACCCTATGAGCCAGAGGAGGATGGGGCCACCGCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AAGGTGAGGGGGCCCCCTGGCCCCGGGAGTCCCGCCTGCCAGAGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123737 AAGGTGAGGGGGCCCCCTGGCCCCGGGAGTCCCGCCTGCCAGAGGATGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGAGGCCCCCTGAGGAGTATGACCAGCCCTGGGAGTGGAAGAAGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123787 GAGAGGCCCCCTGAGGAGTATGACCAGCCCTGGGAGTGGAAGAAGGAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GATTTCCAAAGCCTTTGCAG         TTGACATTAAGGTCATCAAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 123837 GATTTCCAAAGCCTTTGCAGGTG...CAGTTGACATTAAGGTCATCAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACCTACCTTGGCCTCCACCTGTGGGACAGCTGGACAGCAGCCCCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125380 ACCTACCTTGGCCTCCACCTGTGGGACAGCTGGACAGCAGCCCCTCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCTGATGGGGACAGGGACATCTCCGGTCCAGCCTCGCCCCTCCCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125430 CCTGATGGGGACAGGGACATCTCCGGTCCAGCCTCGCCCCTCCCTGAGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAGCCTGGAGGACAGCAGCG         CCCAGTTTGAAGGACCGGAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 125480 CAGCCTGGAGGACAGCAGCGGTG...CAGCCCAGTTTGAAGGACCGGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAGCTGCCTGTCACCTGGCCGGGAGGAGAAGGGGCGGCTACCTCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126778 AGAGCTGCCTGTCACCTGGCCGGGAGGAGAAGGGGCGGCTACCTCCCCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTCTCTGCAGGGAACCCCAAGTCAGCCAAACCCCTAAGCATGGAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126828 CTCTCTGCAGGGAACCCCAAGTCAGCCAAACCCCTAAGCATGGAGCCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAGCCCCCTGGGGGAGTGGACAGATCCAGCACTGCCTCTGGAAAACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126878 CAGCCCCCTGGGGGAGTGGACAGATCCAGCACTGCCTCTGGAAAACCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 T         CTGGTATCACGGGGCCATCAGCCGAACCGACGCCGAGAAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126928 TGTG...TAGCTGGTATCACGGGGCCATCAGCCGAACCGACGCCGAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGCTCCGGCTGTGCAAAGAGGCCAGCTACCTGGTGCGCAACAGTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127113 CTGCTCCGGCTGTGCAAAGAGGCCAGCTACCTGGTGCGCAACAGTGAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGCAAGAATGACTTCTCCCTCTCCCTCAA         GAGCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127163 CAGCAAGAATGACTTCTCCCTCTCCCTCAAGTG...CAGGAGCAGCCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GATTCATGCACATGAAGCTGTCCCGAACCAAGGAACACAAATATGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130953 GATTCATGCACATGAAGCTGTCCCGAACCAAGGAACACAAATATGTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGCCAGAACAGCCCGCCCTTCAGCAGCGTCCCTGAAATTGTGCACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131003 GGCCAGAACAGCCCGCCCTTCAGCAGCGTCCCTGAAATTGTGCACCACTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGCCAGCCGCAAGCTACCCATTAAGGGAGCCGAACACATGTCCCTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131053 TGCCAGCCGCAAGCTACCCATTAAGGGAGCCGAACACATGTCCCTGCTCT

   1300     .    :    .    :
   1247 ACCCTGTGGCCATCCGGACTCTT
        |||||||||||||||||||||||
 131103 ACCCTGTGGCCATCCGGACTCTT