seq1 = pF1KE0734.tfa, 1266 bp
seq2 = pF1KE0734/gi568815583r_64071934.tfa (gi568815583r:64071934_64400499), 328566 bp

>pF1KE0734 1266
>gi568815583r:64071934_64400499 (Chr15)

(complement)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-222  (141259-141299)   100% ->
223-292  (148919-148988)   100% ->
293-444  (183787-183938)   100% ->
445-679  (186376-186610)   100% ->
680-765  (192906-192991)   100% ->
766-850  (195551-195635)   100% ->
851-999  (195911-196059)   100% ->
1000-1107  (197311-197418)   100% ->
1108-1214  (220046-220152)   100% ->
1215-1266  (228515-228566)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCATCCTAGTAGGGAAAAGGATGAAAGACAACGGACAACTAAACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGGCACAAAGGAGTGCACACTGCTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGGCACAAAGGAGTGCACACTGCTCTCGACCATCTGGCTCCTCATCGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCTGGGGTTCTTATGGTGGGACCCAACTTCAGGGTTGGCAAGAAGATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAG         GTAAAAATCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 GGATGTGGGAACTTCGGAGAGCTCAGATTAGGTA...TAGGTAAAAATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTG         GAACCAATAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 141269 CTACACCAATGAATATGTAGCAATCAAACTGGTG...CAGGAACCAATAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148929 AATCACGTGCTCCACAGCTTCATTTAGAGTACAGATTTTATAAACAGCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCAGTGCAG         GTGAAGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 148979 GGCAGTGCAGGTA...CAGGTGAAGGTCTCCCACAGGTGTATTACTTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183818 ACCATGTGGGAAATATAATGCCATGGTGCTGGAGCTCCTTGGCCCTAGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183868 TGGAGGACTTGTTTGACCTCTGTGACCGAACATTTACTTTGAAGACGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTAATGATAGCCATCCAGCTG         CTTTCTCGAATGGAATACGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 183918 TTAATGATAGCCATCCAGCTGGTA...CAGCTTTCTCGAATGGAATACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186396 GCACTCAAAGAACCTCATTTACCGAGATGTCAAGCCAGAGAACTTCCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGGTCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186446 TTGGTCGACAAGGCAATAAGAAAGAGCATGTTATACACATTATAGACTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCGAAACCAAAAAACACATACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186496 GGACTGGCCAAGGAATACATTGACCCCGAAACCAAAAAACACATACCTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186546 TAGGGAACACAAAAGTTTAACTGGAACTGCAAGATATATGTCTATCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCATCTTGGCAAAG         AGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 186596 CGCATCTTGGCAAAGGTG...TAGAGCAAAGCCGGAGAGATGATTTGGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGGCAGCCTCCCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192932 GCCCTAGGCCATATGTTCATGTATTTCCTTCGAGGCAGCCTCCCCTGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGGACTCAAG         GCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 192982 AGGACTCAAGGTA...CAGGCTGACACATTAAAAGAGAGATATCAAAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGGTGACACCAAAAGGAATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195582 TTGGTGACACCAAAAGGAATACTCCCATTGAAGCTCTCTGTGAGAACTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCAG         AGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195632 CCAGGTG...CAGAGGAGATGGCAACCTACCTTCGATATGTCAGGCGACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195948 GGACTTCTTTGAAAAACCTGATTATGAGTATTTACGGACCCTCTTCACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 ACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACACCTTTGACTATGCCTATGATTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195998 ACCTCTTTGAAAAGAAAGGCTACACCTTTGACTATGCCTATGATTGGGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGGAGACCTATT         CCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 196048 GGGAGACCTATTGTA...TAGCCTACTCCAGTAGGGTCAGTTCACGTAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TTCTGGTGCATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197340 TTCTGGTGCATCTGCAATAACTCGAGAAAGCCACACACATAGGGATCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAG         GTGGTTAGCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 197390 CATCACAACAGCAGCCTCTTCGAAATCAGGTA...CAGGTGGTTAGCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220058 ACCAATGGAGAGCTGAATGTTGATGATCCCACGGGAGCCCACTCCAATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 ACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 220108 ACCAATCACAGCTCATGCCGAGGTGGAGGTAGTGGAGGAAGCTAAGTA..

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215     GTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 220158 .CAGGTGCTGCTGTTTCTTTAAGAGGAAAAGGAAGAAGACTGCTCAGCGC

   1350     .
   1261 CACAAG
        ||||||
 228561 CACAAG