seq1 = pF1KE0732.tfa, 1260 bp
seq2 = pF1KE0732/gi568815594r_82326062.tfa (gi568815594r:82326062_82529690), 203629 bp

>pF1KE0732 1260
>gi568815594r:82326062_82529690 (Chr4)

(complement)

1-443  (100001-100443)   100% ->
444-612  (101245-101413)   100% ->
613-774  (101512-101673)   100% ->
775-906  (102127-102258)   100% ->
907-1021  (102387-102501)   100% ->
1022-1192  (103058-103228)   100% ->
1193-1260  (103562-103629)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTCCCGCCCAGGCTTTCCCATGTGCCGCCGCCATTGTTCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTCCCGCCCAGGCTTTCCCATGTGCCGCCGCCATTGTTCCCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTCCCGCTACTTTAGCCTCCCGCAGCCTCTCCCATTGGCGGCCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTCCCGCTACTTTAGCCTCCCGCAGCCTCTCCCATTGGCGGCCGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGCGGCAGCTAGCCCCGCTCCTCCCTTCGCTCGCTCCCAGCTCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGCGGCAGCTAGCCCCGCTCCTCCCTTCGCTCGCTCCCAGCTCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCAGGGGGCGCGCCGGGCCCAGCGCCACGTCACCGCCCAGCAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCAGGGGGCGCGCCGGGCCCAGCGCCACGTCACCGCCCAGCAGCCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGATTGGCGGGCGGGGCGGCTATAAAGGGAGGGCGCAGGCGGCGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGATTGGCGGGCGGGGCGGCTATAAAGGGAGGGCGCAGGCGGCGCCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTCTTCCGCCGCCATTTTAAATCCAGCTCCATACAACGCTCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTCTTCCGCCGCCATTTTAAATCCAGCTCCATACAACGCTCCGCCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTGCTGCCGCGACCCGGACTGCGCGCCAGCACCCCCCTGCCGACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTGCTGCCGCGACCCGGACTGCGCGCCAGCACCCCCCTGCCGACAGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTCACTATGGAGGATATGAACGAGTACAGCAATATAGAGGAATTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTCACTATGGAGGATATGAACGAGTACAGCAATATAGAGGAATTCGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGGATCCAAGATCAACGCGAGCAAGAATCAGCAGGATGACGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100401 AGGGATCCAAGATCAACGCGAGCAAGAATCAGCAGGATGACGGGTA...T

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    444   TAAAATGTTTATTGGAGGCTTGAGCTGGGATACAAGCAAAAAAGATCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101243 AGTAAAATGTTTATTGGAGGCTTGAGCTGGGATACAAGCAAAAAAGATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GACAGAGTACTTGTCTCGATTTGGGGAAGTTGTAGACTGCACAATTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101293 GACAGAGTACTTGTCTCGATTTGGGGAAGTTGTAGACTGCACAATTAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGATCCAGTCACTGGGAGATCAAGAGGATTTGGATTTGTGCTTTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101343 CAGATCCAGTCACTGGGAGATCAAGAGGATTTGGATTTGTGCTTTTCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GATGCTGCTAGTGTTGATAAG         GTTTTGGAACTGAAAGAACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101393 GATGCTGCTAGTGTTGATAAGGTA...TAGGTTTTGGAACTGAAAGAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CAAACTGGATGGCAAATTGATAGATCCCAAAAGGGCCAAAGCTTTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101532 CAAACTGGATGGCAAATTGATAGATCCCAAAAGGGCCAAAGCTTTAAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GGAAAGAACCTCCCAAAAAGGTTTTTGTGGGTGGATTGAGCCCGGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101582 GGAAAGAACCTCCCAAAAAGGTTTTTGTGGGTGGATTGAGCCCGGATACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCTGAAGAACAAATTAAAGAATATTTTGGAGCCTTTGGAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101632 TCTGAAGAACAAATTAAAGAATATTTTGGAGCCTTTGGAGAGGTG...CA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    775  ATTGAAAATATTGAACTTCCCATGGATACAAAAACAAATGAAAGAAGAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102126 GATTGAAAATATTGAACTTCCCATGGATACAAAAACAAATGAAAGAAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GATTTTGTTTTATCACATATACTGATGAAGAGCCAGTAAAAAAATTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102176 GATTTTGTTTTATCACATATACTGATGAAGAGCCAGTAAAAAAATTGTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GAAAGCAGATACCATCAAATTGGTTCTGGGAAG         TGTGAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102226 GAAAGCAGATACCATCAAATTGGTTCTGGGAAGGTA...TAGTGTGAAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CAAAGTTGCACAACCCAAAGAGGTATATAGGCAGCAACAGCAACAACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102395 CAAAGTTGCACAACCCAAAGAGGTATATAGGCAGCAACAGCAACAACAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AAGGTGGAAGAGGTGCTGCAGCTGGTGGACGAGGTGGTACGAGGGGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102445 AAGGTGGAAGAGGTGCTGCAGCTGGTGGACGAGGTGGTACGAGGGGTCGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GGCCGAG         GTCAGGGCCAAAACTGGAACCAAGGATTTAATAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102495 GGCCGAGGTG...CAGGTCAGGGCCAAAACTGGAACCAAGGATTTAATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTATTATGATCAAGGATATGGAAATTACAATAGTGCCTATGGTGGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103092 CTATTATGATCAAGGATATGGAAATTACAATAGTGCCTATGGTGGTGATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AAAACTATAGTGGCTATGGCGGATATGATTATACTGGGTATAACTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103142 AAAACTATAGTGGCTATGGCGGATATGATTATACTGGGTATAACTATGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AACTATGGATATGGACAGGGATATGCAGACTACAGTG         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103192 AACTATGGATATGGACAGGGATATGCAGACTACAGTGGTA...TAGGCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 ACAGAGCACTTATGGCAAGGCATCTCGAGGGGGTGGCAATCACCAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103566 ACAGAGCACTTATGGCAAGGCATCTCGAGGGGGTGGCAATCACCAAAACA

   1300     .    :
   1247 ATTACCAGCCATAC
        ||||||||||||||
 103616 ATTACCAGCCATAC