seq1 = pF1KE0729.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE0729/gi568815579f_57131249.tfa (gi568815579f:57131249_57335414), 204166 bp

>pF1KE0729 927
>gi568815579f:57131249_57335414 (Chr19)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-104  (100494-100539)   100% ->
105-296  (100785-100976)   100% ->
297-435  (101294-101432)   100% ->
436-584  (102212-102360)   100% ->
585-759  (103636-103810)   100% ->
760-927  (103999-104166)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTCCCCCAGAGCTGTGGTGCAGCTGGGCAAAGCTCAACCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTCCCCCAGAGCTGTGGTGCAGCTGGGCAAAGCTCAACCTGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAAGAGT         TGGCTACAGCAAACCAAACAGCCCAGCAGCCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAAGAGTGTG...CAGTGGCTACAGCAAACCAAACAGCCCAGCAGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAGCCCAGCCAT         GCGGCGCCTCACAGTCGATGACTTTGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100527 GCAGCCCAGCCATGTG...CAGGCGGCGCCTCACAGTCGATGACTTTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCGGGCGTCCCCTGGGCAAGGGGAAATTTGGGAATGTGTACCTGGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100813 ATCGGGCGTCCCCTGGGCAAGGGGAAATTTGGGAATGTGTACCTGGCTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTCAAGGAAAGCCATTTCATTGTGGCCCTGAAGGTTCTCTTCAAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100863 GCTCAAGGAAAGCCATTTCATTGTGGCCCTGAAGGTTCTCTTCAAGTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGATAGAGAAGGAAGGACTGGAGCACCAGCTGCGCCGGGAAATTGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 AGATAGAGAAGGAAGGACTGGAGCACCAGCTGCGCCGGGAAATTGAGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGCTCATCTACA         ACACCCCAATATCCTGCGCCTGTATAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100963 CAGGCTCATCTACAGTA...CAGACACCCCAATATCCTGCGCCTGTATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTATTTCCATGATGCACGCCGGGTGTACCTGATTCTGGAATATGCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101321 CTATTTCCATGATGCACGCCGGGTGTACCTGATTCTGGAATATGCTCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGGTGAGCTCTACAAGGAGCTGCAGAAAAGCGAGAAATTAGATGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101371 GGGGTGAGCTCTACAAGGAGCTGCAGAAAAGCGAGAAATTAGATGAACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGCACAGCCACG         ATAATAGAGGAGTTGGCAGATGCCCTGAC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 101421 CGCACAGCCACGGTG...CAGATAATAGAGGAGTTGGCAGATGCCCTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTACTGCCATGACAAGAAAGTGATTCACAGAGATATTAAGCCAGAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102241 CTACTGCCATGACAAGAAAGTGATTCACAGAGATATTAAGCCAGAGAACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTGCTGGGGTTCAGGGGTGAGGTGAAGATTGCAGATTTTGGCTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102291 TGCTGCTGGGGTTCAGGGGTGAGGTGAAGATTGCAGATTTTGGCTGGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGCACACCCCCTCCCTGAG         GAGGAAGACAATGTGTGGGAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 102341 GTGCACACCCCCTCCCTGAGGTA...TAGGAGGAAGACAATGTGTGGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACTGGACTACTTGCCGCCAGAAATGATTGAGGGGAGAACATATGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103657 ACTGGACTACTTGCCGCCAGAAATGATTGAGGGGAGAACATATGATGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGTGGATTTGTGGTGCATTGGAGTGCTCTGCTATGAGCTGCTGGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103707 AGGTGGATTTGTGGTGCATTGGAGTGCTCTGCTATGAGCTGCTGGTGGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATCCACCCTTTGAGAGCGCCTCCCACAGTGAGACTTACAGACGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103757 TATCCACCCTTTGAGAGCGCCTCCCACAGTGAGACTTACAGACGCATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAAG         GTAGATGTGAGGTTTCCACTATCAATGCCTCTGGGGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103807 CAAGGTG...CAGGTAGATGTGAGGTTTCCACTATCAATGCCTCTGGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCCGGGACTTGATTTCCAGGCTTCTCAGATACCAGCCCTTGGAGAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104036 CCCGGGACTTGATTTCCAGGCTTCTCAGATACCAGCCCTTGGAGAGACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCCCTGGCCCAGATCCTGAAGCACCCCTGGGTTCAGGCCCACTCCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104086 CCCCTGGCCCAGATCCTGAAGCACCCCTGGGTTCAGGCCCACTCCCGAAG

    950     .    :    .    :    .    :
    897 GGTGCTGCCTCCCTGTGCTCAGATGGCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104136 GGTGCTGCCTCCCTGTGCTCAGATGGCTTCC