seq1 = pF1KE0717.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KE0717/gi568815593r_137653152.tfa (gi568815593r:137653152_137854066), 200915 bp

>pF1KE0717 915
>gi568815593r:137653152_137854066 (Chr5)

(complement)

1-915  (100001-100915)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATTCTCAGTTGTGTAAGCTGTTCATCGGCGGCCTCAATGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATTCTCAGTTGTGTAAGCTGTTCATCGGCGGCCTCAATGTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGAGTGAGTCGGGCCTGCGCGGCCACTTTGAGGCCTTTGGGACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGAGTGAGTCGGGCCTGCGCGGCCACTTTGAGGCCTTTGGGACTCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACTGCGTGGTGGTGGTGAATCCCCAGACCAAGCGCTCCCGTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGACTGCGTGGTGGTGGTGAATCCCCAGACCAAGCGCTCCCGTTGCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTCGTGACCTACTCCAATGTGGAGGAGGCGGACGCCGCCATGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTTCGTGACCTACTCCAATGTGGAGGAGGCGGACGCCGCCATGGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCGCCCCATGCCGTGGACGGCAACACTGTGGAGCTGAAGCGGGCGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCGCCCCATGCCGTGGACGGCAACACTGTGGAGCTGAAGCGGGCGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCGGGAGGATTCGGCGCGGCCCGGTGCCCACGCCAAGGTTAAGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCGGGAGGATTCGGCGCGGCCCGGTGCCCACGCCAAGGTTAAGAAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTGTCGGAGGCCTTAAAGGAGACGTGGCTGAGGGCGACCTGATCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTGTCGGAGGCCTTAAAGGAGACGTGGCTGAGGGCGACCTGATCGAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCTCGCAGTTTGGCACCGTGGAAAAGGCCGAGATTATTGCCGACAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCTCGCAGTTTGGCACCGTGGAAAAGGCCGAGATTATTGCCGACAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTCCGGCAAGAAGCGTGGATTCGGCTTCGTGTATTTCCAGAATCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTCCGGCAAGAAGCGTGGATTCGGCTTCGTGTATTTCCAGAATCACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCGGCAGACAAGGCCGCGGTGGTCAAGTTCCATCCGATTCAGGGCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCGGCAGACAAGGCCGCGGTGGTCAAGTTCCATCCGATTCAGGGCCATCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTGGAGGTGAAGAAAGCAGTCCCCAAGGAGGATATCTACTCCGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTGGAGGTGAAGAAAGCAGTCCCCAAGGAGGATATCTACTCCGGTGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGAGGCGGCTCCCGATCCTCCCGGGGCGGCCGAGGCGGCCGGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGAGGCGGCTCCCGATCCTCCCGGGGCGGCCGAGGCGGCCGGGGGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCGGTGGTCGAGACCAGAACGGCCTTTCCAAGGGCGGCGGCGGCGGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCGGTGGTCGAGACCAGAACGGCCTTTCCAAGGGCGGCGGCGGCGGTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACAGCTACGGTGGTTACGGCGGCGGCGGAGGCGGCGGCTACAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACAGCTACGGTGGTTACGGCGGCGGCGGAGGCGGCGGCTACAATGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGGAGGCGGCGGCGGCGGTTCGTCCTACGGTGGGAGCGACTACGGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGGAGGCGGCGGCGGCGGTTCGTCCTACGGTGGGAGCGACTACGGTAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCTTCGGCGGCTTCGGCAGCTACAGCCAGCATCAGTCCTCCTATGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCTTCGGCGGCTTCGGCAGCTACAGCCAGCATCAGTCCTCCTATGGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGAAGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGTAGCTGGGGCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGAAGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGTAGCTGGGGCGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCAGTAATAGTGGACCTTACAGAGGCGGCTATGGCGGTGGGGGTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCAGTAATAGTGGACCTTACAGAGGCGGCTATGGCGGTGGGGGTGGCTAT

    900     .    :    .
    901 GGAGGCAGCTCCTTC
        |||||||||||||||
 100901 GGAGGCAGCTCCTTC