seq1 = pF1KE0716.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KE0716/gi568815590r_21809314.tfa (gi568815590r:21809314_22013601), 204288 bp

>pF1KE0716 1236
>gi568815590r:21809314_22013601 (Chr8)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-345  (101092-101373)   100% ->
346-433  (101614-101701)   100% ->
434-618  (102745-102929)   100% ->
619-1236  (103671-104288)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACGGGGCAGTGAAACAAGGCTTCTTGTATCTTCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGACGGGGCAGTGAAACAAGGCTTCTTGTATCTTCAGCAGCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGTTTGGAAAG         AAATGGCGCCGCTTCGGCGCCTCACTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGTTTGGAAAGGTA...CAGAAATGGCGCCGCTTCGGCGCCTCACTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGGAGGGTCGGACTGCGCCTTGGCCCGGCTGGAGCTGCAGGAGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101120 ATGGAGGGTCGGACTGCGCCTTGGCCCGGCTGGAGCTGCAGGAGGGCCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGAAGCCTCGTCGGTGTGAGGCTGCCCGGAAGGTCATCCGCCTCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101170 GAGAAGCCTCGTCGGTGTGAGGCTGCCCGGAAGGTCATCCGCCTCAGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCCTGCGGGTGGCCGAGGCCGGCGGAGAGGCCAGCAGCCCCCGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101220 CTGCCTGCGGGTGGCCGAGGCCGGCGGAGAGGCCAGCAGCCCCCGGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGTGCCTTCTTCCTGGAGACCAAGGAGCGCCTGTACCTCCTGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101270 CCAGTGCCTTCTTCCTGGAGACCAAGGAGCGCCTGTACCTCCTGGCGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGCAGCGGAGCGCGGCGACTGGGTGCAGGCCATCTGCCTCCTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101320 CCTGCAGCGGAGCGCGGCGACTGGGTGCAGGCCATCTGCCTCCTGGCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCC         GGGCAGAGGAAGGAGCTCTCGGGGCCAGAGGGAAAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101370 CCCCGTG...TAGGGGCAGAGGAAGGAGCTCTCGGGGCCAGAGGGAAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGAGCCGGCCCTGCATGGAGGAAAATGAATTGTACAGCAGCGCAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AGAGCCGGCCCTGCATGGAGGAAAATGAATTGTACAGCAGCGCAGTCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 G         TCGGCCCCCACAAGGAATTTGCTGTGACCATGAGACCTAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GGTG...CAGTCGGCCCCCACAAGGAATTTGCTGTGACCATGAGACCTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGAAGCCAGTGAGAGGTGCCACCTGCGGGGGTCCTATACCCTCCGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102785 AGAAGCCAGTGAGAGGTGCCACCTGCGGGGGTCCTATACCCTCCGGGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGAGAGTGCCCTGGAGCTGTGGGGTGGGCCCGAGCCAGGGACCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102835 GGGAGAGTGCCCTGGAGCTGTGGGGTGGGCCCGAGCCAGGGACCCAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACGACTGGCCCTACAGGTTTCTGCGGCGCTTTGGGCGGGACAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102885 TACGACTGGCCCTACAGGTTTCTGCGGCGCTTTGGGCGGGACAAGGTG..

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    619     GTAACCTTTTCCTTTGAGGCAGGCCGTCGCTGCGTCTCTGGAGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102935 .CAGGTAACCTTTTCCTTTGAGGCAGGCCGTCGCTGCGTCTCTGGAGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCAACTTTGAGTTCGAAACCCGGCAAGGCAATGAGATCTTCTTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103717 GCAACTTTGAGTTCGAAACCCGGCAAGGCAATGAGATCTTCTTGGCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAAGAGGCCATCTCTGCCCAGAAGAATGCTGCACCCGCTACACCCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103767 GAAGAGGCCATCTCTGCCCAGAAGAATGCTGCACCCGCTACACCCCAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCAGCCAGCCACAATCCCCGCGTCGCTGCCCCGGCCTGATAGCCCCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103817 GCAGCCAGCCACAATCCCCGCGTCGCTGCCCCGGCCTGATAGCCCCTACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTCGGCCGCATGACTCACTGCCGCCGCCTTCACCCACCACACCGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103867 CTCGGCCGCATGACTCACTGCCGCCGCCTTCACCCACCACACCGGTGCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GCTCCACGGCCTCGGGGCCAGGAGGGGGAGTATGCCGTGCCCTTCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103917 GCTCCACGGCCTCGGGGCCAGGAGGGGGAGTATGCCGTGCCCTTCGATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGTGGCCCGTTCCTTGGGGAAGAACTTCAGGGGCATCTTGGCAGTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103967 GGTGGCCCGTTCCTTGGGGAAGAACTTCAGGGGCATCTTGGCAGTCCCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CTCAGCTCCTGGCCGACCCTCTGTACGACAGCATTGAGGAGACCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104017 CTCAGCTCCTGGCCGACCCTCTGTACGACAGCATTGAGGAGACCCTGCCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCTCGACCTGACCACATATACGATGAGCCCGAGGGAGTGGCTGCCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104067 CCTCGACCTGACCACATATACGATGAGCCCGAGGGAGTGGCTGCCCTGTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCTCTATGACAGCCCGCAGGAGCCCCGGGGTGAGGCATGGAGGAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104117 CCTCTATGACAGCCCGCAGGAGCCCCGGGGTGAGGCATGGAGGAGGCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CGACAGCTGACAGGGACCCTGCTGGCCTCCAGCATGTCCAGCCAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104167 CGACAGCTGACAGGGACCCTGCTGGCCTCCAGCATGTCCAGCCAGCCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CAGGATTTCTCTGCTTCTGGCTGGCAGCCAGGAACTGAGTATGACAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104217 CAGGATTTCTCTGCTTCTGGCTGGCAGCCAGGAACTGAGTATGACAATGT

   1250     .    :    .    :
   1215 TGTACTAAAGAAAGGCCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||
 104267 TGTACTAAAGAAAGGCCCAAAG