seq1 = pF1KE0714.tfa, 1233 bp
seq2 = pF1KE0714/gi568815579r_47701778.tfa (gi568815579r:47701778_47902983), 201206 bp

>pF1KE0714 1233
>gi568815579r:47701778_47902983 (Chr19)

(complement)

1-30  (99451-99480)   100% ->
31-1233  (100004-101206)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCAGCCTCAGGGAGCAACAGCTGCAG         GTGTGGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  99451 ATGCTCAGCCTCAGGGAGCAACAGCTGCAGGTC...CAGGTGTGGTTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GAATCGCCGCGCCAAACTAGCTCGGGAGCGGCGGCTCCAGCAGCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100015 GAATCGCCGCGCCAAACTAGCTCGGGAGCGGCGGCTCCAGCAGCAGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCGCGTCCCTGGGCAGAGAGGCCGAGGAGCCCGCGCTGCGCCCCTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100065 AGCGCGTCCCTGGGCAGAGAGGCCGAGGAGCCCGCGCTGCGCCCCTAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGCAGCCTCTGCCTCCGCACCTCAGCGGGGCCCCTCGGGAATCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100115 CCTGCAGCCTCTGCCTCCGCACCTCAGCGGGGCCCCTCGGGAATCCTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCGGCGGAACCCACGATCTGCAGCCTCCACCAGGCCTGGGGTGGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100165 AGCGGCGGAACCCACGATCTGCAGCCTCCACCAGGCCTGGGGTGGCCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTGCAGAGCCCAGAAGGGCATCCCAGCTGCCCTGAGTCCAGGCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100215 GGTGCAGAGCCCAGAAGGGCATCCCAGCTGCCCTGAGTCCAGGCCCTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCGATCCCTGCCCCAATCCCAGGCCCAGCCCAGATCCCAGGCCCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100265 CCGATCCCTGCCCCAATCCCAGGCCCAGCCCAGATCCCAGGCCCACTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGCTCAATTCCAGGCCCAATTCCAGGCCCAGCTCAGATCCCAAGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100315 TGGCTCAATTCCAGGCCCAATTCCAGGCCCAGCTCAGATCCCAAGCCCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCCAGCCCCAATCCCAGGCCCAATTTCAGGCCCAGTCCAGATCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100365 TCCCAGCCCCAATCCCAGGCCCAATTTCAGGCCCAGTCCAGATCCCAGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCATTCCGTGGCCCAATCCCAGGCCCAATTTCAGGCCCAGCCCCGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100415 CCATTCCGTGGCCCAATCCCAGGCCCAATTTCAGGCCCAGCCCCGATCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AGGCCCAATCTCAGGCCCATTCTCAGGCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100465 AGGCCCAATCTCAGGCCCATTCTCAGGCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCGATCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100515 GCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCGATCCCAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCAATCTCAGTCCCGATCCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100565 CCAATCTCAGTCCCGATCCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AATCTCAGGCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCCCAGGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100615 AATCTCAGGCCCAAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCCCAGGCCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCTCAGGCCCGAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100665 TCTCAGGCCCGAACCCAGGCCCGATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCGAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCAGGCCTGATCCCAGGCCCAATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100715 CCAGGCCTGATCCCAGGCCCAATCCCAGGCCCAATCTCAGGCCCAGGCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AATTATAGGCCCGATTCCCAGCCCAGCCCAGATCCCAGGCCCAGGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100765 AATTATAGGCCCGATTCCCAGCCCAGCCCAGATCCCAGGCCCAGGCAGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCAAGGCCCAGGTCCCATCTTAAGTCCTGGCCGGATGCGAAGCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100815 TCCAAGGCCCAGGTCCCATCTTAAGTCCTGGCCGGATGCGAAGCCCTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCACTTCCAGGCCTAGCCCCGATTTTAGGCCCAGGCTCAGGCCCAGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 TCACTTCCAGGCCTAGCCCCGATTTTAGGCCCAGGCTCAGGCCCAGGCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 AGGCTCAGTCCCAGCTCCAATCCCAGGCCCAGGATCACTCCCAGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100915 AGGCTCAGTCCCAGCTCCAATCCCAGGCCCAGGATCACTCCCAGCCCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCCCCTTATGGCCTCAGAGCCCCGATGCCTCCGACTTCTTGCCAGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100965 CCCCCTTATGGCCTCAGAGCCCCGATGCCTCCGACTTCTTGCCAGACACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CAGTTATTCCCTCACTTCACAGAGCTGCTCCTACCCCTAGACCCCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101015 CAGTTATTCCCTCACTTCACAGAGCTGCTCCTACCCCTAGACCCCTTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGGATCCTCAGTCTCCACCATGACCTCTCAGTACCAAGAAGGGGATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101065 GGGATCCTCAGTCTCCACCATGACCTCTCAGTACCAAGAAGGGGATGACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CTATGGGCAAAAAACACTCAGGGTCTCAGCCCCAAGAGGAGGGTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101115 CTATGGGCAAAAAACACTCAGGGTCTCAGCCCCAAGAGGAGGGTGGCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GTGAATGAAAATCACTCAGGCCCCAGGTTATTACTGGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101165 GTGAATGAAAATCACTCAGGCCCCAGGTTATTACTGGATTTA