seq1 = pF1KE0708.tfa, 1221 bp
seq2 = pF1KE0708/gi568815579r_57708043.tfa (gi568815579r:57708043_57913423), 205381 bp

>pF1KE0708 1221
>gi568815579r:57708043_57913423 (Chr19)

(complement)

1-33  (98681-98713)   100% ->
34-160  (100004-100130)   100% ->
161-1221  (104321-105381)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGGCCGCGCTAAGGTTCCCCGTTCAG         GGCACAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  98681 ATGGCGGCGGCCGCGCTAAGGTTCCCCGTTCAGGTA...CAGGGCACAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACTTTTGAAGACGTGGCTGTGAAATTTACCCAGGAGGAATGGAATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 GACTTTTGAAGACGTGGCTGTGAAATTTACCCAGGAGGAATGGAATCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTAGTGAGGCTCAGAGATGCCTGTACCGTGATGTGACGCTGGAGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 TTAGTGAGGCTCAGAGATGCCTGTACCGTGATGTGACGCTGGAGAACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCACTTATGTCCTCCCTGG         GTTGTTGGTGTGGAGTGGAAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100112 GCACTTATGTCCTCCCTGGGTA...CAGGTTGTTGGTGTGGAGTGGAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAGGCGGCACCTTCTAAGCAGAGTATTTATATACAAAGAGAGACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104343 TGAGGCGGCACCTTCTAAGCAGAGTATTTATATACAAAGAGAGACTCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCAGGACTCCTATGGCAGGTGTGTCTCCCAAGAAGGCCCACCCCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104393 TCAGGACTCCTATGGCAGGTGTGTCTCCCAAGAAGGCCCACCCCTGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGTGTGGCCCGATCTTGGGAGACATTTTGCATGTGGCAGATCATCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104443 ATGTGTGGCCCGATCTTGGGAGACATTTTGCATGTGGCAGATCATCAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACACATCACAAGCAGAAACTGCACAGGTGTGAGGCCTGGGGGAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104493 AACACATCACAAGCAGAAACTGCACAGGTGTGAGGCCTGGGGGAATAAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGTATGACAGTGGAAACTTTCATCAGCACCAGAATGAGCACATTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104543 TGTATGACAGTGGAAACTTTCATCAGCACCAGAATGAGCACATTGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACCCTACAGAGGGAGTGTTGAGGAGGCGTTGTTTGCGAAGAGGTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104593 AAACCCTACAGAGGGAGTGTTGAGGAGGCGTTGTTTGCGAAGAGGTGTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTGCATGTGTCAGGGGAGTCATCTGTCTTCAGTGAGAGTGGGAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104643 GTTGCATGTGTCAGGGGAGTCATCTGTCTTCAGTGAGAGTGGGAAAGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTTGCTCAGGTCAGGATTACTCCAGCAAGAGGCCACTCACACTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104693 TTTTGCTCAGGTCAGGATTACTCCAGCAAGAGGCCACTCACACTGGGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCAAACAGCAAAACTGAGTGTGTGTCTCTGTTTCATGGGGGAAAAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104743 TCAAACAGCAAAACTGAGTGTGTGTCTCTGTTTCATGGGGGAAAAAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TTACAGCTGTGGAGGATGCATGAAACATTTTAGCACCAAAGATATACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104793 TTACAGCTGTGGAGGATGCATGAAACATTTTAGCACCAAAGATATACTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTCAGCACGAGAGACTGCTCCCTACAGAAGAACCTTCTGTGTGGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104843 GTCAGCACGAGAGACTGCTCCCTACAGAAGAACCTTCTGTGTGGTGTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGTGGGAAATCCTCTAGCAAATATGACAGCTTCAGTAATCATCAAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104893 TGTGGGAAATCCTCTAGCAAATATGACAGCTTCAGTAATCATCAAGGAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TCACACTAGAGAAAAACCTTATACGTGTGGGATATGTGGGAAATTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104943 TCACACTAGAGAAAAACCTTATACGTGTGGGATATGTGGGAAATTATTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACAGTAAGTCCCACCTCCTTGTACACCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104993 ACAGTAAGTCCCACCTCCTTGTACACCAGAGAATTCACACTGGAGAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CCATATGAGTGTGAGGTTTGTCAGAAATTTTTTAGGCACAAGTACCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105043 CCATATGAGTGTGAGGTTTGTCAGAAATTTTTTAGGCACAAGTACCACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CATTGCACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATATGAATGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105093 CATTGCACACCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAGGCCATATGAATGCAGTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATTGTGGGAAGTCATTTACCCACAGCTCTACATTCCGTGTTCATAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105143 ATTGTGGGAAGTCATTTACCCACAGCTCTACATTCCGTGTTCATAAGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GTTCACACTGGTCAGAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105193 GTTCACACTGGTCAGAAGCCTTATGAGTGCAGTGAATGTGGGAAATCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGCCGAAAGCTCCAGTCTCACTAAACACAGGAGAGTTCACACTGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105243 TGCCGAAAGCTCCAGTCTCACTAAACACAGGAGAGTTCACACTGGAGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AGCCTTACGGGTGCAGTGAATGTGAAAAAAAATTTAGGCAAATCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105293 AGCCTTACGGGTGCAGTGAATGTGAAAAAAAATTTAGGCAAATCTCTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1183 CTTCGTCATCATCAGAGAGTTCACAAAAGAAAGGGCTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105343 CTTCGTCATCATCAGAGAGTTCACAAAAGAAAGGGCTTA