seq1 = pF1KE0703.tfa, 879 bp
seq2 = pF1KE0703/gi568815596r_121627727.tfa (gi568815596r:121627727_121836850), 209124 bp

>pF1KE0703 879
>gi568815596r:121627727_121836850 (Chr2)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-243  (101101-101238)   100% ->
244-352  (104647-104755)   100% ->
353-564  (105747-105958)   100% ->
565-624  (108315-108374)   100% ->
625-693  (108495-108563)   100% ->
694-879  (108939-109124)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTTTTTCTGGCCCGGCTGGGCCAATCCTGTCGCTTAATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACTTTTTCTGGCCCGGCTGGGCCAATCCTGTCGCTTAATCCGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGATGTCGAGTTTCAAAAGGAGGTGGCGCAGGTTCGCAAGCGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGATGTCGAGTTTCAAAAGGAGGTGGCGCAGGTTCGCAAGCGCATAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAG         CGAAAAAAACAAGAACAACTTACTCCTGGAGTAGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGGTG...TAGCGAAAAAAACAAGAACAACTTACTCCTGGAGTAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGTGCGCCACCTACCTAACCTACTTGACGAAACCCAGATCTTTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101137 TATGTGCGCCACCTACCTAACCTACTTGACGAAACCCAGATCTTTTCATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTCTCCCAGTTTGGCACTGTGACACGGTTCAGGCTGTCCAGAAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101187 TTTCTCCCAGTTTGGCACTGTGACACGGTTCAGGCTGTCCAGAAGTAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GG         ACTGGAAATAGCAAAGGCTATGCATTTGTGGAGTTTGAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101237 GGGTA...CAGACTGGAAATAGCAAAGGCTATGCATTTGTGGAGTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTGAGGATGTTGCCAAAATAGTTGCTGAAACAATGAACAACTACCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104686 TCTGAGGATGTTGCCAAAATAGTTGCTGAAACAATGAACAACTACCTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGTGAAAGACTCTTGGAGT         GTCATTTTATGCCACCTGAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104736 TGGTGAAAGACTCTTGGAGTGTA...TAGGTCATTTTATGCCACCTGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGTACATAAAGAACTCTTTAAAGACTGGAATATTCCATTTAAGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105768 AAGTACATAAAGAACTCTTTAAAGACTGGAATATTCCATTTAAGCAGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCATATCCATCAGTGAAACGGTATAATCGGAATCGGACACTAACACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105818 TCATATCCATCAGTGAAACGGTATAATCGGAATCGGACACTAACACAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTACGGATGGAGGAGCGATTTAAAAAGAAAGAAAGATTACTCAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105868 GCTACGGATGGAGGAGCGATTTAAAAAGAAAGAAAGATTACTCAGGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATTAGCTAAAAAAGGAATTGACTATGATTTTCCTTCTTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 105918 AATTAGCTAAAAAAGGAATTGACTATGATTTTCCTTCTTTGGTA...AAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTTTACAGAAAACGGAAAGTATTTCAAAAACTAATCGTCAGACGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108315 ATTTTACAGAAAACGGAAAGTATTTCAAAAACTAATCGTCAGACGTCTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AAAAGGCCAG         GTTTTACGTAAGAAGAAGAAAAAAGTTTCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 108365 AAAAGGCCAGGTA...AAGGTTTTACGTAAGAAGAAGAAAAAAGTTTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTACTCTTGACACTCCTGAGAAGACTGTGGATAGCCAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 108526 GTACTCTTGACACTCCTGAGAAGACTGTGGATAGCCAGGTA...CAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CCCACACCAGTTTGTACACCAACATTTTTGGAGAGGCGAAAATCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108942 CCCACACCAGTTTGTACACCAACATTTTTGGAGAGGCGAAAATCTCAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GGCTGAACTGAATGATGATGATAAAGATGATGAAATAGTTTTCAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108992 GGCTGAACTGAATGATGATGATAAAGATGATGAAATAGTTTTCAAACAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCATATCCTGTGTAAAAGAAGAAATACAAGAGACTCAAACACCTACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109042 CCATATCCTGTGTAAAAGAAGAAATACAAGAGACTCAAACACCTACACAT

    900     .    :    .    :    .    :
    847 TCACGGAAAAAAAGACGAAGAAGCAGCAATCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 109092 TCACGGAAAAAAAGACGAAGAAGCAGCAATCAG