seq1 = pF1KE0695.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KE0695/gi568815581r_35818345.tfa (gi568815581r:35818345_36030727), 212383 bp

>pF1KE0695 852
>gi568815581r:35818345_36030727 (Chr17)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-276  (100473-100652)   100% ->
277-399  (105091-105213)   100% ->
400-568  (105956-106124)   100% ->
569-667  (108053-108151)   100% ->
668-753  (110456-110541)   100% ->
754-852  (112285-112383)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGTTGGTACCTTTTGCGGTTCCCATCGAGAGTGACAAAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGTTGGTACCTTTTGCGGTTCCCATCGAGAGTGACAAAACCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTAGTGTGGGAGCTGAGCTCCGGACCCACGGCCGAGGCTTTGCAT    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GCTAGTGTGGGAGCTGAGCTCCGGACCCACGGCCGAGGCTTTGCATGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      CATTCTCTGTTCACAGCATTTTCTCAGTTTGGCCTTCTGTATTCA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGCATTCTCTGTTCACAGCATTTTCTCAGTTTGGCCTTCTGTATTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTCCGGGTCTTCCCAAATGCTGCAGTGGCCCATCCTGGTTTCTATGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100518 GTCCGGGTCTTCCCAAATGCTGCAGTGGCCCATCCTGGTTTCTATGCCGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATTAAGTTTTATTCTGCAAGGGCTGCCCACAGAGCCCAAAAGGCATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100568 CATTAAGTTTTATTCTGCAAGGGCTGCCCACAGAGCCCAAAAGGCATGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCGGAAGCAGCTTTTTCAGAAATCTCCAGTCAAG         GTTCGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100618 ACCGGAAGCAGCTTTTTCAGAAATCTCCAGTCAAGGTG...TAGGTTCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTGGCACCAGACATAAGGCAGTTCAACATCAAGCCCTTGCCCTGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105097 CTTGGCACCAGACATAAGGCAGTTCAACATCAAGCCCTTGCCCTGAACAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCCAAATGCCAAGAACTGGCGAATTACTACTTTGGTTTCAATGGGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105147 TTCCAAATGCCAAGAACTGGCGAATTACTACTTTGGTTTCAATGGGTGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAAAAGGATCATCAAG         CTTCAGGAGCTTTCTGACCTTGAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105197 CCAAAAGGATCATCAAGGTA...CAGCTTCAGGAGCTTTCTGACCTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAAGGGAAAATGAAGATAGCATGGTGCCACTTCCGAAGCAAAGCCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 GAAAGGGAAAATGAAGATAGCATGGTGCCACTTCCGAAGCAAAGCCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCTTCTGTGCTTTAGAAGTGGTGTTGCCATCCTGTGATTGCAGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106030 GTTCTTCTGTGCTTTAGAAGTGGTGTTGCCATCCTGTGATTGCAGGAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGGCATTGGCTTGGTGGAGGAGCCTATGGATAAGGTGGAGGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 106080 CTGGCATTGGCTTGGTGGAGGAGCCTATGGATAAGGTGGAGGAAGGTC..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569     GACCATTATCATTCCTTATGAAAAGGAAGACAGCCCAGAAGCTTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106130 .TAGGACCATTATCATTCCTTATGAAAAGGAAGACAGCCCAGAAGCTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TATTCAGAAGGCTTTGTCAGATGCATTCCAGAAACTGTTGATTGTTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108099 TATTCAGAAGGCTTTGTCAGATGCATTCCAGAAACTGTTGATTGTTGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TAG         AAAGTGGTAAAATAGCTGTGGAGTACAGACCCAGTGAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108149 TAGGTA...CAGAAAGTGGTAAAATAGCTGTGGAGTACAGACCCAGTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACATCGTAGGTGTCAGATGCGAAGAAGAACTACACGGTTTAATTCAA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 110494 GACATCGTAGGTGTCAGATGCGAAGAAGAACTACACGGTTTAATTCAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    754        GTCCCTTGCTCTCCCTGGAAGCAGTATGGCCAAGAGGAGGAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110544 A...CAGGTCCCTTGCTCTCCCTGGAAGCAGTATGGCCAAGAGGAGGAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGTATCTCTCGGATTTCAGCTTGGAGGAGGAAGAGTTCAGGCTGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112328 GGTATCTCTCGGATTTCAGCTTGGAGGAGGAAGAGTTCAGGCTGCCAGAA

    900     .
    847 CTTGAC
        ||||||
 112378 CTTGAC