seq1 = pF1KE0693.tfa, 846 bp
seq2 = pF1KE0693/gi568815591r_23405745.tfa (gi568815591r:23405745_23621840), 216096 bp

>pF1KE0693 846
>gi568815591r:23405745_23621840 (Chr7)

(complement)

1-36  (90017-90052)   100% ->
37-170  (100001-100134)   100% ->
171-336  (105313-105478)   100% ->
337-525  (108759-108947)   100% ->
526-641  (114306-114421)   100% ->
642-770  (115575-115703)   100% ->
771-846  (116028-116099)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGATGTGGAGGAAAACAACTTCGAGGGCAGA         GAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  90017 ATGAGTGATGTGGAGGAAAACAACTTCGAGGGCAGAGTG...TAGGAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCGCTCTCAGTCAAAATCTCCAACGGGAACTCCTGCTCGTGTAAAATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100006 TCGCTCTCAGTCAAAATCTCCAACGGGAACTCCTGCTCGTGTAAAATCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGCAGGTCAGGATCTCGTAGTCCATCAAGGGTTTCCAAACACTCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100056 AGAGCAGGTCAGGATCTCGTAGTCCATCAAGGGTTTCCAAACACTCTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCATTCTCGATCAAGATCAAAATCCAG         GTCGAGGTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100106 TCCCATTCTCGATCAAGATCAAAATCCAGGTA...AAGGTCGAGGTCAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAGACATTCTCATAGACGTTACACTCGATCCAGATCCCACTCTCACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105325 GAGACATTCTCATAGACGTTACACTCGATCCAGATCCCACTCTCACTCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATAGGAGACGATCTCGAAGTAGATCATATACACCAGAATACCGGCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105375 ATAGGAGACGATCTCGAAGTAGATCATATACACCAGAATACCGGCGGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGAGCCGAAGCCATTCTCCAATGTCTAACCGGAGAAGACATACTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105425 AGGAGCCGAAGCCATTCTCCAATGTCTAACCGGAGAAGACATACTGGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGG         GCAAATCCAGATCCCAACACTTGCCTTGGAGTGTTTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105475 CAGGGTA...TAGGCAAATCCAGATCCCAACACTTGCCTTGGAGTGTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTCAGTTTGTACACAACAGAGAGGGATCTTCGTGAAGTATTTTCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108796 GCCTCAGTTTGTACACAACAGAGAGGGATCTTCGTGAAGTATTTTCTCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATGGACCATTGAGTGGTGTCAATGTGGTTTATGATCAGCGAACTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108846 TATGGACCATTGAGTGGTGTCAATGTGGTTTATGATCAGCGAACTGGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ATCTCGAGGATTTGCTTTTGTGTATTTTGAGAGAATAGATGACTCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108896 ATCTCGAGGATTTGCTTTTGTGTATTTTGAGAGAATAGATGACTCAAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AG         GCTATGGAAAGGGCAAATGGAATGGAGCTGGATGGTAGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108946 AGGTA...TAGGCTATGGAAAGGGCAAATGGAATGGAGCTGGATGGTAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGAATTCGGGTGGATTATTCTATAACCAAGAGAGCGCACACACCAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114345 AGAATTCGGGTGGATTATTCTATAACCAAGAGAGCGCACACACCAACACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGCATCTACATGGGCAGACCAACTCA         TAGTGGTGGGGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 114395 AGGCATCTACATGGGCAGACCAACTCAGTA...CAGTAGTGGTGGGGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTGGAGGAGGCGGCGGCGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGCAGACGTCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115589 GTGGAGGAGGCGGCGGCGGTGGAGGTGGAGGTGGTGGCAGACGTCGAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TCTTACTATGATAGAGGATATGATCGTGGGTATGACAGATATGAAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115639 TCTTACTATGATAGAGGATATGATCGTGGGTATGACAGATATGAAGACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGATTACCGATACAG         AAGACGATCACCTTCTCCTTATTATA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 115689 TGATTACCGATACAGGTA...CAGAAGACGATCACCTTCTCCTTATTATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GTCGATATAGATCACGATCAAGATCTCGTTCCTACAGCCCAAGACGCTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||----|||
 116054 GTCGATATAGATCACGATCAAGATCTCGTTCCTACAGCCCAAG    TAT