seq1 = pF1KE0687.tfa, 1284 bp
seq2 = pF1KE0687/gi568815594r_26381641.tfa (gi568815594r:26381641_26590267), 208627 bp

>pF1KE0687 1284
>gi568815594r:26381641_26590267 (Chr4)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-364  (100784-101035)   100% ->
365-626  (104370-104631)   100% ->
627-754  (106985-107112)   100% ->
755-1284  (108098-108627)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGTGGTTGACAGCCTTCTTGTGAATGGAAGCAACATCACTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGTGGTTGACAGCCTTCTTGTGAATGGAAGCAACATCACTCCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGAACTCGGGCTCGAAAATGAGACGCTTTTCTGCTTGGATCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGAACTCGGGCTCGAAAATGAGACGCTTTTCTGCTTGGATCAGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCCTTCCAAAG         AGTGGCAGCCAGCGGTGCAGATTCTCTTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCCTTCCAAAGGTA...CAGAGTGGCAGCCAGCGGTGCAGATTCTCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACTCCTTGATATTCCTGCTCAGCGTGCTGGGAAACACGCTGGTCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100813 TACTCCTTGATATTCCTGCTCAGCGTGCTGGGAAACACGCTGGTCATCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGCTGATTCGGAACAAGCGGATGCGGACGGTCACCAACATCTTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100863 CGTGCTGATTCGGAACAAGCGGATGCGGACGGTCACCAACATCTTCCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCCCTGGCTGTCAGCGACCTCATGCTCTGTCTCTTCTGCATGCCGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100913 TCTCCCTGGCTGTCAGCGACCTCATGCTCTGTCTCTTCTGCATGCCGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACCTCATCCCCAATCTGCTCAAGGATTTCATCTTCGGGAGCGCCGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100963 AACCTCATCCCCAATCTGCTCAAGGATTTCATCTTCGGGAGCGCCGTTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGACCACCACCTACTTCATGG         GCACCTCTGTGAGTGTAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 101013 CAAGACCACCACCTACTTCATGGGTA...CAGGCACCTCTGTGAGTGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTACCTTTAATCTGGTAGCCATATCTCTAGAGAGATATGGTGCGATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104388 CTACCTTTAATCTGGTAGCCATATCTCTAGAGAGATATGGTGCGATTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACCCTTACAGTCCCGGGTCTGGCAGACAAAATCCCATGCTTTGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104438 AAACCCTTACAGTCCCGGGTCTGGCAGACAAAATCCCATGCTTTGAAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GATTGCTGCTACCTGGTGCCTTTCCTTTACCATCATGACTCCGTACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104488 GATTGCTGCTACCTGGTGCCTTTCCTTTACCATCATGACTCCGTACCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTTATAGCAACTTGGTGCCTTTTACCAAAAATAACAACCAGACCGCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104538 TTTATAGCAACTTGGTGCCTTTTACCAAAAATAACAACCAGACCGCGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATGTGCCGCTTTCTACTGCCAAATGATGTTATGCAGCAGTCCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104588 ATGTGCCGCTTTCTACTGCCAAATGATGTTATGCAGCAGTCCTGGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    627    GCACACATTCCTGTTACTCATCCTCTTTCTTATTCCTGGAATTGTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106982 TAGGCACACATTCCTGTTACTCATCCTCTTTCTTATTCCTGGAATTGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGATGGTGGCATATGGATTAATCTCTTTGGAACTCTACCAGGGAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107032 TGATGGTGGCATATGGATTAATCTCTTTGGAACTCTACCAGGGAATAAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTGAGGCTAGCCAGAAGAAGTCTGCTAAAG         AAAGGAAACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107082 TTTGAGGCTAGCCAGAAGAAGTCTGCTAAAGGTA...CAGAAAGGAAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAGCACCACCAGCAGCGGCAAATATGAGGACAGCGATGGGTGTTACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108108 TAGCACCACCAGCAGCGGCAAATATGAGGACAGCGATGGGTGTTACCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAAAGACCAGGCCCCCGAGGAAGCTGGAGCTCCGGCAGCTGTCCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108158 AAAAGACCAGGCCCCCGAGGAAGCTGGAGCTCCGGCAGCTGTCCACCGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCAGCAGCAGGGCCAACCGCATCCGGAGTAACAGCTCCGCAGCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108208 AGCAGCAGCAGGGCCAACCGCATCCGGAGTAACAGCTCCGCAGCCAACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GATGGCCAAGAAAAGGGTGATCCGCATGCTCATCGTCATCGTGGTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108258 GATGGCCAAGAAAAGGGTGATCCGCATGCTCATCGTCATCGTGGTCCTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCTTCCTGTGCTGGATGCCCATCTTCAGCGCCAACGCCTGGCGGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108308 TCTTCCTGTGCTGGATGCCCATCTTCAGCGCCAACGCCTGGCGGGCCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GACACCGCCTCCGCAGAGCGCCGCCTCTCAGGAACCCCCATTTCCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108358 GACACCGCCTCCGCAGAGCGCCGCCTCTCAGGAACCCCCATTTCCTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCTCCTCCTGTCCTACACCTCCTCCTGCGTCAACCCCATCATCTACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108408 CCTCCTCCTGTCCTACACCTCCTCCTGCGTCAACCCCATCATCTACTGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TCATGAACAAACGCTTCCGCCTCGGCTTCATGGCCACCTTCCCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108458 TCATGAACAAACGCTTCCGCCTCGGCTTCATGGCCACCTTCCCCTGCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CCCAATCCTGGTCCCCCAGGGGCGAGGGGAGAGGTGGGGGAGGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108508 CCCAATCCTGGTCCCCCAGGGGCGAGGGGAGAGGTGGGGGAGGAGGAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 AGGCGGGACCACAGGAGCCTCTCTGTCCAGGTTCTCGTACAGCCATATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108558 AGGCGGGACCACAGGAGCCTCTCTGTCCAGGTTCTCGTACAGCCATATGA

   1300     .    :    .    :
   1265 GTGCCTCGGTGCCACCCCAG
        ||||||||||||||||||||
 108608 GTGCCTCGGTGCCACCCCAG