seq1 = pF1KE0681.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KE0681/gi568815588r_20685750.tfa (gi568815588r:20685750_21273833), 588084 bp

>pF1KE0681 810
>gi568815588r:20685750_21273833 (Chr10)

(complement)

1-69  (100001-100069)   100% ->
70-164  (101357-101451)   100% ==
350-529  (460890-461065)   97% ->
530-636  (486526-486632)   100% ->
637-810  (487911-488084)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCCCAGTGCGCCCGTTGCGGAAAAGTCGTGTATCCCACCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCCCCAGTGCGCCCGTTGCGGAAAAGTCGTGTATCCCACCGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCAACTGCCTGGATAAG         TATTGGCATAAAGGATGTTTCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100051 AGTCAACTGCCTGGATAAGGTG...CAGTATTGGCATAAAGGATGTTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTGTGAGGTCTGCAAGATGGCACTCAACATGAACAACTACAAAGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101379 ATTGTGAGGTCTGCAAGATGGCACTCAACATGAACAACTACAAAGGCTAT

    150     .    :    .    :
    142 GAAAAGAAGCCCTATTGTAATGC
        |||||||||||||||||||||||
 101429 GAAAAGAAGCCCTATTGTAATGC

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350 TCAGTAATGTAAAATACCATGAAGATTTTGAAAAAACAAAGGGGAGAGGC
        ||||----||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460890 TCAG    GTAAAATACCATGAAGATTTTGAAAAAACAAAGGGGAGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    400 TTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGAAGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460936 TTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGAAGAACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    450 CCAGGTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460986 CCAGGTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    500 AGATGGACAGGAGACCTGGAATCATTGTTG         CACCTGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 461036 AGATGGACAGGAGACCTGGAATCATTGTTGGTA...CAGCACCTGTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    541 CCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCAAGGCTATGGCTACATGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 486537 CCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCAAGGCTATGGCTACATGCACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    591 GACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 486587 GACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTAGTA.

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    637      AGGACCTACCGAGCCATGTACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 486637 ..CAGAGGACCTACCGAGCCATGTACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682 GAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAACGTGCAGCCTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 487956 GAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAACGTGCAGCCTATTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    732 CGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACAGGGAGAACAGGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 488006 CGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACAGGGAGAACAGGAATGC

    450     .    :    .    :    .
    782 TCCCAGCGAATTACATTGAGTTTGTTAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 488056 TCCCAGCGAATTACATTGAGTTTGTTAAT