seq1 = pF1KE0677.tfa, 789 bp
seq2 = pF1KE0677/gi568815588r_49266119.tfa (gi568815588r:49266119_49491262), 225144 bp

>pF1KE0677 789
>gi568815588r:49266119_49491262 (Chr10)

(complement)

1-34  (95823-95856)   100% ->
35-132  (100002-100099)   100% ->
133-234  (101029-101130)   100% ->
235-413  (104405-104583)   100% ->
414-526  (104673-104785)   100% ->
527-789  (124882-125144)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTATTTCCACTGCCCGCCACAGCTAGAGG         GCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  95823 ATGTTTTATTTCCACTGCCCGCCACAGCTAGAGGGTA...TAGGCACTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AACCTTTGGCAATCACTCTTCGGGGGATTTTGATGACGGGTTTCTGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100009 AACCTTTGGCAATCACTCTTCGGGGGATTTTGATGACGGGTTTCTGCGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAAAACAGCGCCGGAACCGGACGACGTTCACTCTTCAGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100059 GAAAACAGCGCCGGAACCGGACGACGTTCACTCTTCAGCAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTGGAAGCTCTCGAGGCCGTTTTTGCCCAAACACACTATCCAGATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 CTGGAAGCTCTCGAGGCCGTTTTTGCCCAAACACACTATCCAGATGTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACCAGAGAAGAGCTCGCCATGAAAATAAACCTCACAGAAGCCAGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 CACCAGAGAAGAGCTCGCCATGAAAATAAACCTCACAGAAGCCAGAGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AG         GTTTGGTTCCAGAACAGAAGGGCCAAATGGAGGAAGACA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 AGGTA...CAGGTTTGGTTCCAGAACAGAAGGGCCAAATGGAGGAAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGAGAGGGGCCTCAGACCAGGAGCCAGGAGCCAAGGAGCCCATGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104444 GAGAGAGGGGCCTCAGACCAGGAGCCAGGAGCCAAGGAGCCCATGGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTGACACCTCCTCCAGTGAGAAACATCAACTCCCCGCCCCCTGGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104494 GGTGACACCTCCTCCAGTGAGAAACATCAACTCCCCGCCCCCTGGGGACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGCCCGGAGTAAGAAGGAGGCGCTGGAGGCCCAGCAGAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 104544 AAGCCCGGAGTAAGAAGGAGGCGCTGGAGGCCCAGCAGAGGTG...CAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTGGGGCGAACGGTAGGTCCTGCAGGGCCTTTCTTCCCCTCCTGCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104674 CTGGGGCGAACGGTAGGTCCTGCAGGGCCTTTCTTCCCCTCCTGCTTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGGACTCTCCTGAACACGGCCACCTACGCCCAGGCCTTGTCCCATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104724 GGGGACTCTCCTGAACACGGCCACCTACGCCCAGGCCTTGTCCCATGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTTCCCTCAAAG         GGGGCCCACTGTGCTCTTGCTGCGTCCCA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104774 CTTCCCTCAAAGGTG...CAGGGGGCCCACTGTGCTCTTGCTGCGTCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACCCCATGGGACTCTCCTTCCTTCCCACCTATGGCTGCCAGAGTAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124911 GACCCCATGGGACTCTCCTTCCTTCCCACCTATGGCTGCCAGAGTAACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CACGGCCAGCGTGGCCACCCTGCGCATGAAGGCCCGCGAGCACTCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124961 CACGGCCAGCGTGGCCACCCTGCGCATGAAGGCCCGCGAGCACTCAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGTCCTGCAGTCAGCCAACCTCCTGCCTTCCACCAGCAGCAGCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125011 CTGTCCTGCAGTCAGCCAACCTCCTGCCTTCCACCAGCAGCAGCCCCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCTGTCGCCAAGCCGGCGCCCCCAGATGGCAGCCAGGAAAAGACCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125061 CCTGTCGCCAAGCCGGCGCCCCCAGATGGCAGCCAGGAAAAGACCTCTCC

    800     .    :    .    :    .    :
    756 CACCAAGGAACAGAGCGAGGCAGAGAAGAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125111 CACCAAGGAACAGAGCGAGGCAGAGAAGAGTGTA