seq1 = pF1KE0673.tfa, 783 bp
seq2 = pF1KE0673/gi568815592r_88998581.tfa (gi568815592r:88998581_89217887), 219307 bp

>pF1KE0673 783
>gi568815592r:88998581_89217887 (Chr6)

(complement)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-165  (110630-110729)   100% ->
166-274  (112354-112461)   97% ->
275-416  (112628-112769)   100% ->
417-783  (118941-119307)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCGCTACACGAGGCCCCCCAACACCTCCCTGTTCATCAGGAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCGCTACACGAGGCCCCCCAACACCTCCCTGTTCATCAGGAACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGACGCCACCAG         GCCTGAGGACTTGCGCCGTGAGTTTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGACGCCACCAGGTG...CAGGCCTGAGGACTTGCGCCGTGAGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTCGATATGGCCCTATAGTAGACGTTTACATTCCACTTGACTTCTACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110656 GTCGATATGGCCCTATAGTAGACGTTTACATTCCACTTGACTTCTACACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGCCGCCCAAGAGGATTTGCTTAT         GTTCA ATTTGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>--|||-|||||||||||
 110706 CGCCGCCCAAGAGGATTTGCTTATGTT...TAG  TCATATTTGAAGATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 TTCGAGATGCTGAAGATGCTCTTTATAACCTCAATAGAAAGTGGGTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112369 TTCGAGATGCTGAAGATGCTCTTTATAACCTCAATAGAAAGTGGGTATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 GGCCGTCAGATTGAAATACAGTTTGCACAAGGTGATCGCAAAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112419 GGCCGTCAGATTGAAATACAGTTTGCACAAGGTGATCGCAAAAGTA...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    275   CACCAGGCCAAATGAAATCAAAAGAACGTCATCCTTGTTCTCCAAGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112626 AGCACCAGGCCAAATGAAATCAAAAGAACGTCATCCTTGTTCTCCAAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    323 ATCACAGGAGATCAAGAAGCCCCAGCCAAAGAAGAACTCGAAGTAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112676 ATCACAGGAGATCAAGAAGCCCCAGCCAAAGAAGAACTCGAAGTAGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    373 TCTTCATGGGGAAGAAATAGGAGGCGGTCAGACAGCCTTAAAGA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 112726 TCTTCATGGGGAAGAAATAGGAGGCGGTCAGACAGCCTTAAAGAGTG...

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    417    GTCTCGACACAGGCGATTTTCTTATAGCCAGTCTAAATCTCGTTCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118938 CAGGTCTCGACACAGGCGATTTTCTTATAGCCAGTCTAAATCTCGTTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    464 AATCATTACCAAGGCGGTCTACCTCAGCAAGGCAGTCAAGAACTCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118988 AATCATTACCAAGGCGGTCTACCTCAGCAAGGCAGTCAAGAACTCCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514 AGGAATTTTGGCTCTAGAGGACGGTCAAGGTCCAAGTCCTTACAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119038 AGGAATTTTGGCTCTAGAGGACGGTCAAGGTCCAAGTCCTTACAAAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    564 GTCCAAGTCAATAGGAAAATCACAGTCAAGTTCACCTCAAAAGCAGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119088 GTCCAAGTCAATAGGAAAATCACAGTCAAGTTCACCTCAAAAGCAGACTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614 GCTCAGGAACAAAATCAAGATCACATGGAAGACATTCTGACTCAATAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119138 GCTCAGGAACAAAATCAAGATCACATGGAAGACATTCTGACTCAATAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664 AGATCCCCGTGTAAATCTCCCAAAGGGTATACCAATTCTGAAACTAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119188 AGATCCCCGTGTAAATCTCCCAAAGGGTATACCAATTCTGAAACTAAAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    714 ACAAACAGCAAAGCATTCTCATTTTCGGTCACATTCCAGATCTCGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119238 ACAAACAGCAAAGCATTCTCATTTTCGGTCACATTCCAGATCTCGAAGTT

    800     .    :    .    :
    764 ATCGTCATAAAAACAGTTGG
        ||||||||||||||||||||
 119288 ATCGTCATAAAAACAGTTGG