seq1 = pF1KE0672.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KE0672/gi568815575r_153570460.tfa (gi568815575r:153570460_153773076), 202617 bp

>pF1KE0672 1029
>gi568815575r:153570460_153773076 (ChrX)

(complement)

1-68  (100001-100068)   100% ->
69-200  (100380-100511)   100% ->
201-275  (100877-100951)   100% ->
276-414  (101059-101197)   100% ->
415-538  (101405-101528)   100% ->
539-614  (101717-101792)   100% ->
615-727  (101887-101999)   100% ->
728-806  (102081-102159)   100% ->
807-894  (102246-102333)   100% ->
895-1029  (102483-102617)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGCTGCTGAAGAAACACACGGAGGACATCAGCAGCGTCTACGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGCTGCTGAAGAAACACACGGAGGACATCAGCAGCGTCTACGAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGAGAGGCTCGGCTC         GGGTGCCTTCTCCGAGGTGGTGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCGAGAGGCTCGGCTCGTG...CAGGGGTGCCTTCTCCGAGGTGGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGCCCAGGAGCGGGGCTCCGCACACCTCGTGGCCCTCAAGTGCATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100403 TGGCCCAGGAGCGGGGCTCCGCACACCTCGTGGCCCTCAAGTGCATCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAAGGCCCTCCGGGGCAAGGAGGCCCTGGTGGAGAACGAGATCGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100453 AAGAAGGCCCTCCGGGGCAAGGAGGCCCTGGTGGAGAACGAGATCGCAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTCCGTAG         GATCAGTCACCCCAACATCGTCGCTCTGGAGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100503 GCTCCGTAGGTG...CAGGATCAGTCACCCCAACATCGTCGCTCTGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTCCACGAGAGCCCTTCCCACCTCTACCTGGCCATGGAACT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100909 ATGTCCACGAGAGCCCTTCCCACCTCTACCTGGCCATGGAACTGTG...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276   GGTGACGGGTGGCGAGCTGTTTGACCGCATCATGGAGCGCGGCTCCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101057 AGGGTGACGGGTGGCGAGCTGTTTGACCGCATCATGGAGCGCGGCTCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACAGAGAAGGATGCCAGCCATCTGGTGGGTCAGGTCCTTGGCGCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101107 CACAGAGAAGGATGCCAGCCATCTGGTGGGTCAGGTCCTTGGCGCCGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTACCTGCACAGCCTGGGGATCGTGCACCGGGACCTCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101157 CCTACCTGCACAGCCTGGGGATCGTGCACCGGGACCTCAAGGTG...CAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCCGAAAACCTCCTGTATGCCACGCCCTTTGAGGACTCGAAGATCATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101405 CCCGAAAACCTCCTGTATGCCACGCCCTTTGAGGACTCGAAGATCATGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCTGACTTTGGACTCTCCAAAATCCAGGCTGGGAACATGCTAGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101455 CTCTGACTTTGGACTCTCCAAAATCCAGGCTGGGAACATGCTAGGCACCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTGTGGGACCCCTGGATATGTGG         CCCCAGAGCTCTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101505 CCTGTGGGACCCCTGGATATGTGGGTG...CAGCCCCAGAGCTCTTGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAGAAACCCTACGGGAAGGCCGTAGATGTGTGGGCCCTGGGCGTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101734 CAGAAACCCTACGGGAAGGCCGTAGATGTGTGGGCCCTGGGCGTCATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTACATCCT         GCTGTGTGGGTACCCCCCCTTCTACGACGAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101784 CTACATCCTGTG...CAGGCTGTGTGGGTACCCCCCCTTCTACGACGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCGACCCTGAGCTCTTCAGCCAGATCCTGAGGGCCAGCTATGAGTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101919 GCGACCCTGAGCTCTTCAGCCAGATCCTGAGGGCCAGCTATGAGTTTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCTCCTTTCTGGGATGACATCTCAGAATCAG         CCAAAGACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101969 TCTCCTTTCTGGGATGACATCTCAGAATCAGGTG...CAGCCAAAGACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATCCGGCACCTTCTGGAGCGAGACCCCCAGAAGAGGTTCACCTGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102091 CATCCGGCACCTTCTGGAGCGAGACCCCCAGAAGAGGTTCACCTGCCAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGGCCTTGCGGCACCTTTG         GATCTCTGGGGACACAGCCTTC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 102141 AGGCCTTGCGGCACCTTTGGTG...CAGGATCTCTGGGGACACAGCCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GACAGGGACATCTTAGGCTCTGTCAGTGAGCAGATCCGGAAGAACTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102268 GACAGGGACATCTTAGGCTCTGTCAGTGAGCAGATCCGGAAGAACTTTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCGGACACACTGGAAG         CGAGCCTTCAATGCCACCTCGTTCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 102318 TCGGACACACTGGAAGGTC...CAGCGAGCCTTCAATGCCACCTCGTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCGCCACATCCGGAAGCTGGGGCAGATCCCAGAGGGCGAGGGGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102508 TGCGCCACATCCGGAAGCTGGGGCAGATCCCAGAGGGCGAGGGGGCCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGCAGGGCATGGCCCGCCACAGCCACTCAGGCCTCCGTGCTGGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102558 GAGCAGGGCATGGCCCGCCACAGCCACTCAGGCCTCCGTGCTGGCCAGCC

   1100     .    :
   1020 CCCCAAGTGG
        ||||||||||
 102608 CCCCAAGTGG