seq1 = pF1KE0669.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KE0669/gi568815586r_111262681.tfa (gi568815586r:111262681_111463427), 200747 bp

>pF1KE0669 747
>gi568815586r:111262681_111463427 (Chr12)

(complement)

1-747  (100001-100747)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTGAACGAGCGCAGCCTGGCCTTCTACGCCACCTGTGACGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTGAACGAGCGCAGCCTGGCCTTCTACGCCACCTGTGACGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGACAATGCAGGCTTCCTGTACAAGAAGGGTGGGCGGCACGCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGACAATGCAGGCTTCCTGTACAAGAAGGGTGGGCGGCACGCGGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCACCGGCGCTGGTTCGTGCTGCGCGGGAACATGCTCTTCTACTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCACCGGCGCTGGTTCGTGCTGCGCGGGAACATGCTCTTCTACTTCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGCTGCCAGCCGTGAGCCCGTGGGCGTCATCATCCTGGAGGGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGCTGCCAGCCGTGAGCCCGTGGGCGTCATCATCCTGGAGGGCTGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGGAGCTGGTGGAGGCCGCCGAGGAGTTCGCCTTCGCTGTGCGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGGAGCTGGTGGAGGCCGCCGAGGAGTTCGCCTTCGCTGTGCGCTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGGGACCCGGGCGCGCACCTACGTGCTGGCCGCTGAGAGTCAGGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGGGACCCGGGCGCGCACCTACGTGCTGGCCGCTGAGAGTCAGGATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGGAGGGCTGGGTCAAGGCCCTGTCGCGTGCCAGCTTCGACTACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGGAGGGCTGGGTCAAGGCCCTGTCGCGTGCCAGCTTCGACTACCTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGTGGTGCGCGAGCTGGAGCAGCAGCTGGCGGCTGTACGTGGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGTGGTGCGCGAGCTGGAGCAGCAGCTGGCGGCTGTACGTGGCGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGGCATGGCCCTGCCCCAGCCCCAGCCCCAGTCCCTGCCCTTGCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGGCATGGCCCTGCCCCAGCCCCAGCCCCAGTCCCTGCCCTTGCCCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCCTGCCCTCTGCCCTGGCCCCAGTCCCATCCCTGCCTTCTGCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCCTGCCCTCTGCCCTGGCCCCAGTCCCATCCCTGCCTTCTGCCCCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCGGTCCCAGCCCTGCCCCTGCCCCGCCGGCCCAGTGCCCTCCCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCGGTCCCAGCCCTGCCCCTGCCCCGCCGGCCCAGTGCCCTCCCGCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGAGAATGGCTGCGCTGTCTGGAGCACTGAGGCCACCTTCAGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGAGAATGGCTGCGCTGTCTGGAGCACTGAGGCCACCTTCAGGCCTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCGAGCCCCCTCCACCACCGCCTCGCCGCCGGGCCTCGGCACCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCGAGCCCCCTCCACCACCGCCTCGCCGCCGGGCCTCGGCACCCCACGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCCCTGGACATGGCCCCCTTCGCCCGGCTGCACGAGTGCTATGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCCCCTGGACATGGCCCCCTTCGCCCGGCTGCACGAGTGCTATGGCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    701 AGATCCGGGCCCTGCGTGGCCAGTGGCTCAGCAGCCGGGTCCAGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGATCCGGGCCCTGCGTGGCCAGTGGCTCAGCAGCCGGGTCCAGCCC