seq1 = pF1KE0666.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KE0666/gi568815585r_19630238.tfa (gi568815585r:19630238_19882649), 252412 bp

>pF1KE0666 1071
>gi568815585r:19630238_19882649 (Chr13)

(complement)

1-264  (100001-100264)   100% ->
265-566  (110107-110408)   100% ->
567-662  (123232-123327)   100% ->
663-859  (131183-131379)   100% ->
860-944  (141001-141085)   100% ->
945-1050  (152306-152411)   100% ->
1051-1071  (204827-204847)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTCGCTCTTGCCGGGGAGCCGGCACCGCCCGCGCCCGCGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTCGCTCTTGCCGGGGAGCCGGCACCGCCCGCGCCCGCGCCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGACCACCCGGACGAGGAGATGGGGTTCACTATCGACATCAAGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGACCACCCGGACGAGGAGATGGGGTTCACTATCGACATCAAGAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCAAGCCGGGCGAGAAGACGTACACGCAGCGCTGCCGCCTCTTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTCAAGCCGGGCGAGAAGACGTACACGCAGCGCTGCCGCCTCTTCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAAATCTGCCCACCGACATCACGGAGGAGGACTTCAAGAGGCTCTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAAATCTGCCCACCGACATCACGGAGGAGGACTTCAAGAGGCTCTTCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGCTATGGCGAGCCCAGCGAAGTCTTCATCAACCGGGACCGTGGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGCTATGGCGAGCCCAGCGAAGTCTTCATCAACCGGGACCGTGGCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCATCCGCTTG         GAATCCAGAACCCTGGCTGAAATTGCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCATCCGCTTGGTG...AAGGAATCCAGAACCCTGGCTGAAATTGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGCAGAGCTGGACGGCACCATTCTCAAGAGCAGACCTCTACGGATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110134 AAAGCAGAGCTGGACGGCACCATTCTCAAGAGCAGACCTCTACGGATTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTCGCTACACATGGAGCAGCCTTGACTGTCAAGAACCTTTCTCCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110184 CTTCGCTACACATGGAGCAGCCTTGACTGTCAAGAACCTTTCTCCAGTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTCCAATGAGCTGCTAGAGCAAGCATTTTCTCAGTTTGGTCCAGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110234 TTTCCAATGAGCTGCTAGAGCAAGCATTTTCTCAGTTTGGTCCAGTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAGCTGTTGTGGTTGTGGATGATCGCGGTAGAGCTACAGGAAAAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110284 AAAGCTGTTGTGGTTGTGGATGATCGCGGTAGAGCTACAGGAAAAGGTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGTAGAGTTTGCAGCAAAACCTCCTGCACGAAAGGCTCTGGAAAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110334 TGTAGAGTTTGCAGCAAAACCTCCTGCACGAAAGGCTCTGGAAAGATGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GTGATGGGGCATTCTTGCTAACAAC         GACCCCTCGTCCAGTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110384 GTGATGGGGCATTCTTGCTAACAACGTA...CAGGACCCCTCGTCCAGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 ATTGTGGAACCCATGGAGCAGTTTGATGATGAAGATGGCTTGCCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123248 ATTGTGGAACCCATGGAGCAGTTTGATGATGAAGATGGCTTGCCAGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCTGATGCAGAAAACTCAACAATATCATAA         GGAAAGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 123298 GCTGATGCAGAAAACTCAACAATATCATAAGTA...TAGGGAAAGAGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AACCACCACGTTTTGCTCAACCTGGGACATTTGAATTTGAGTATGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131194 AACCACCACGTTTTGCTCAACCTGGGACATTTGAATTTGAGTATGCATCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGATGGAAGGCTCTTGATGAAATGGAAAAGCAGCAGCGTGAGCAGGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131244 CGATGGAAGGCTCTTGATGAAATGGAAAAGCAGCAGCGTGAGCAGGTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TAGAAACATCAGAGAAGCCAAAGAGAAACTGGAGGCAGAAATGGAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131294 TAGAAACATCAGAGAAGCCAAAGAGAAACTGGAGGCAGAAATGGAAGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CTAGGCATGAACACCAATTAATGCTAATGAGGCAAG         ATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 131344 CTAGGCATGAACACCAATTAATGCTAATGAGGCAAGGTA...TAGATCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ATGAGGCGTCAAGAAGAACTCAGACGCTTGGAAGAACTCAGAAACCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141006 ATGAGGCGTCAAGAAGAACTCAGACGCTTGGAAGAACTCAGAAACCAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTTGCAAAAACGGAAGCAAATACAACTAAG         ACATGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 141056 GTTGCAAAAACGGAAGCAAATACAACTAAGGTA...CAGACATGAAGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGCATCGGCGGCGTGAGGAAGAAATGATCCGACACAGAGAACAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152317 AGCATCGGCGGCGTGAGGAAGAAATGATCCGACACAGAGAACAGGAGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGAGGCGACAGCAAGAGGGCTTTAAGCCAAACTACATGGAAAAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 152367 CTGAGGCGACAGCAAGAGGGCTTTAAGCCAAACTACATGGAAAATGTA..

   1100     .    :    .    :    .
   1051     GGTGATAAAAGAAAATGTGGC
        .>>>|||||||||||||||||||||
 152417 .TAGGGTGATAAAAGAAAATGTGGC