seq1 = pF1KE0662.tfa, 1161 bp
seq2 = pF1KE0662/gi568815591r_55981057.tfa (gi568815591r:55981057_56188941), 207885 bp

>pF1KE0662 1161
>gi568815591r:55981057_56188941 (Chr7)

(complement)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-262  (101166-101344)   100% ->
263-317  (101918-101972)   100% ->
318-383  (105227-105292)   100% ->
384-547  (105501-105664)   100% ->
548-638  (106689-106779)   100% ->
639-792  (106896-107049)   100% ->
793-918  (107187-107312)   99% ->
919-1161  (107643-107885)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGAATTATGAGCCCAAAGAGATCCTGGGCAG         GGGCGTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 TGAGAATTATGAGCCCAAAGAGATCCTGGGCAGGTA...CAGGGGCGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101174 GCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAAGGTCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101224 GTGAAGGTCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAGGTGGACATCCTGCGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101274 GCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAGGTGGACATCCTGCGCAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCAGGGCACCCCAACATCA         TACAGCTGAAGGACACTTAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101324 TCTCAGGGCACCCCAACATCAGTG...CAGTACAGCTGAAGGACACTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGACCAACACTTTCTTCTTCTTGGTGTTTGACCT         GATGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101938 GAGACCAACACTTTCTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGTA...CAGGATGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105233 GAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGAAACCAG         AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105283 AGGAAACCAGGTG...TAGAAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105532 TGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105582 CATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAG         AGGTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105632 CCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGGTC...CAGAGGTCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106697 GGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACAT         GTGGAGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 106747 GGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTG...CAGGTGGAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106904 CTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106954 CGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 107004 TGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    793      GTTTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCG
        ..>>>|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107054 ..CAGGTCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107232 GAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAG         GTGATCGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107282 GCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTA...CAGGTGATCGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107653 TGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107703 CCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107753 GCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107803 AGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :
   1129 GCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 107853 GCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC