seq1 = pF1KE0645.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KE0645/gi568815581r_18921962.tfa (gi568815581r:18921962_19146926), 224965 bp

>pF1KE0645 651
>gi568815581r:18921962_19146926 (Chr17)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-176  (105023-105120)   100% ->
177-299  (110847-110969)   100% ->
300-468  (122544-122712)   100% ->
469-651  (124783-124965)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCCGTGGCCCTGTACAGCTTTCAGGCTACAGAGAGCGACGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTCCGTGGCCCTGTACAGCTTTCAGGCTACAGAGAGCGACGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCTTCAACAAGGGAGACACACTCAAG         ATCCTGAACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GGCCTTCAACAAGGGAGACACACTCAAGGTA...CAGATCCTGAACATGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGATGACCAGAACTGGTACAAGGCCGAGCTCCGGGGTGTCGAGGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105036 AGGATGACCAGAACTGGTACAAGGCCGAGCTCCGGGGTGTCGAGGGATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTCCCAAGAACTACATCCGCGTCAAGCCCCATCC         GTGGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105086 ATTCCCAAGAACTACATCCGCGTCAAGCCCCATCCGTG...CAGGTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTCGGGCAGGATTTCCCGGCAGCTGGCCGAAGAGATTCTGATGAAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110853 CTCGGGCAGGATTTCCCGGCAGCTGGCCGAAGAGATTCTGATGAAGCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCATCTGGGAGCCTTCCTGATCCGGGAGAGTGAGAGCTCCCCAGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110903 ACCATCTGGGAGCCTTCCTGATCCGGGAGAGTGAGAGCTCCCCAGGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCTCTGTGTCTGTGAA         CTATGGAGACCAGGTGCAGCACTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110953 TTCTCTGTGTCTGTGAAGTG...TAGCTATGGAGACCAGGTGCAGCACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGGTGCTGCGTGAGGCCTCGGGGAAGTACTTCCTGTGGGAGGAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122568 CAAGGTGCTGCGTGAGGCCTCGGGGAAGTACTTCCTGTGGGAGGAGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCAACTCCCTCAACGAGCTGGTCGACTTCTACCGCACCACCACCATCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122618 TCAACTCCCTCAACGAGCTGGTCGACTTCTACCGCACCACCACCATCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGAAGCGGCAGATCTTCCTGCGCGACGAGGAGCCCTTGCTCAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 122668 AAGAAGCGGCAGATCTTCCTGCGCGACGAGGAGCCCTTGCTCAAGGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     TCACCTGGGGCCTGCTTTGCCCAGGCCCAGTTTGACTTCTCAGCCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122718 .CAGTCACCTGGGGCCTGCTTTGCCCAGGCCCAGTTTGACTTCTCAGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGACCCCTCGCAGCTCAGCTTCCGCCGTGGCGACATCATTGAGGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124829 AGGACCCCTCGCAGCTCAGCTTCCGCCGTGGCGACATCATTGAGGTCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGCGCCCAGACCCCCACTGGTGGCGGGGCCGGTCCTGCGGGCGCGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124879 GAGCGCCCAGACCCCCACTGGTGGCGGGGCCGGTCCTGCGGGCGCGTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .
    615 CTTCTTCCCACGGAGTTACGTGCAGCCCGTGCACCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124929 CTTCTTCCCACGGAGTTACGTGCAGCCCGTGCACCTG