seq1 = pF1KE0641.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KE0641/gi568815586r_42213070.tfa (gi568815586r:42213070_42424102), 211033 bp

>pF1KE0641 651
>gi568815586r:42213070_42424102 (Chr12)

(complement)

1-84  (100001-100084)   98% ->
85-113  (101657-101685)   100% ->
114-225  (106205-106316)   100% ->
226-333  (106656-106763)   100% ->
334-446  (110117-110229)   100% ->
447-522  (110338-110413)   100% ->
523-651  (110905-111033)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGTGGATTGGCTCCAAGTAAGAGCACAGTGTATGTATCCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGTGGATTGGCTCCAAGTAAGAGCACAGTGTATGTATCCAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTTTTTCCCTGACAAACAATGACTTGTATCGG         ATATTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||>>>...>>>|||||||
 100051 GCCTTTTTCCCTGACAAACAATGACTTGTACCGGGTA...CAGATATTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCAAGTATGGCAAAGTTGTAAA         GGTTACCATCATGAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101664 CCAAGTATGGCAAAGTTGTAAAGTA...AAGGGTTACCATCATGAAAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAAGATACCAGGAAGAGTAAAGGGGTTGCATTTATTTTATTTTTGGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106224 AAAGATACCAGGAAGAGTAAAGGGGTTGCATTTATTTTATTTTTGGATAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGACTCTGCACAAAACTGTACCAGGGCAATAAACAACAAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 106274 AGACTCTGCACAAAACTGTACCAGGGCAATAAACAACAAACAGGTA...T

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   TTATTTGGTAGAGTGATAAAAGCAAGCATTGCTATTGACAATGGAAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106654 AGTTATTTGGTAGAGTGATAAAAGCAAGCATTGCTATTGACAATGGAAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCAGCTGAGTTCATCCGAAGGCGAAACTACTTTGATAAATCTAAGTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106704 GCAGCTGAGTTCATCCGAAGGCGAAACTACTTTGATAAATCTAAGTGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAATGTGGG         GAAAGTGGACACTTAAGTTATGCCTGTCCGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106754 TGAATGTGGGGTA...AAGGAAAGTGGACACTTAAGTTATGCCTGTCCGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAATATGCTCGGAGAACGTGAGCCTCCAAAGAAGAAAGAAAAAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110148 AAAATATGCTCGGAGAACGTGAGCCTCCAAAGAAGAAAGAAAAAAAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAAAAGAAAGCTCCTGAACCAGAAGAAGAAAT         TGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 110198 AAAAAGAAAGCTCCTGAACCAGAAGAAGAAATGTA...AAGTGAGGAAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGAAGAAAGTGAAGATGAAGGGGAGGATCCTGCTCTTGACAGCCTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110347 AGAAGAAAGTGAAGATGAAGGGGAGGATCCTGCTCTTGACAGCCTCAGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGCCATAGCATTCCAG         CAAGCCAAAATTGAAGAAGAACAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110397 AGGCCATAGCATTCCAGGTA...CAGCAAGCCAAAATTGAAGAAGAACAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAAAAATGGAAACCCAGTTCAGGAGTCCCCTCAACATCAGATGATTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110929 AAAAAATGGAAACCCAGTTCAGGAGTCCCCTCAACATCAGATGATTCAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACGCCCAAGGATAAAGAAAAGCACATATTTCAGTGATGAGGAAGAACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110979 ACGCCCAAGGATAAAGAAAAGCACATATTTCAGTGATGAGGAAGAACTTA

    700     .
    647 GTGAT
        |||||
 111029 GTGAT