seq1 = pF1KE0639.tfa, 642 bp
seq2 = pF1KE0639/gi568815583r_74740469.tfa (gi568815583r:74740469_74943105), 202637 bp

>pF1KE0639 642
>gi568815583r:74740469_74943105 (Chr15)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-243  (100686-100826)   100% ->
244-364  (100911-101031)   100% ->
365-469  (101597-101701)   100% ->
470-642  (102465-102637)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGGCCCGGCTGGGGTCCCCCGCGCCTGGACGGCTTCATCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGGCCCGGCTGGGGTCCCCCGCGCCTGGACGGCTTCATCCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGCGCCTGGGCAGCGGCACGTACGCCACGGTGTACAAGGCCTACGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGCGCCTGGGCAGCGGCACGTACGCCACGGTGTACAAGGCCTACGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         AAGGACACTCGTGAAGTGGTAGCCATAAAGTGTGTAGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTG...CAGAAGGACACTCGTGAAGTGGTAGCCATAAAGTGTGTAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAAAAGTCTGAACAAGGCATCGGTGGAGAACCTCCTCACGGAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100725 AAGAAAAGTCTGAACAAGGCATCGGTGGAGAACCTCCTCACGGAGATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATCCTCAAGGGCATTCGACATCCCCACATTGTGCAGCTGAAAGACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100775 GATCCTCAAGGGCATTCGACATCCCCACATTGTGCAGCTGAAAGACTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AG         TGGGACAGTGACAATATCTACCTCATCATGGAGTTTTGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100825 AGGTG...CAGTGGGACAGTGACAATATCTACCTCATCATGGAGTTTTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGGGGGCGACCTGTCTCGCTTCATCCATACCCGCAGGATTCTGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100950 GCAGGGGGCGACCTGTCTCGCTTCATCCATACCCGCAGGATTCTGCCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGGTGGCGCGTGTCTTCATGCAGCAATTAG         CTAGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101000 GAAGGTGGCGCGTGTCTTCATGCAGCAATTAGGTA...CAGCTAGCGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCAATTCCTGCATGAACGGAATATCTCTCACCTGGATCTGAAGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101606 TGCAATTCCTGCATGAACGGAATATCTCTCACCTGGATCTGAAGCCACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACATTCTACTGAGCTCCTTGGAGAAGCCCCACCTAAAACTGGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101656 AACATTCTACTGAGCTCCTTGGAGAAGCCCCACCTAAAACTGGCAGGTC.

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    470      ACTTTGGTTTCGCACAACACATGTCCCCGTGGGATGAGAAGCACG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 ..CAGACTTTGGTTTCGCACAACACATGTCCCCGTGGGATGAGAAGCACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCTCCGTGGCTCCCCCCTCTACATGGCCCCCGAGATGGTGTGCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102510 TGCTCCGTGGCTCCCCCCTCTACATGGCCCCCGAGATGGTGTGCCAGCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGTATGACGCCCGCGTGGACCTCTGGTCCATGGGGGTCATCCTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102560 CAGTATGACGCCCGCGTGGACCTCTGGTCCATGGGGGTCATCCTGTATGG

    650     .    :    .    :    .
    615 TGAGACCTCTTTTCCCTGCTTCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 102610 TGAGACCTCTTTTCCCTGCTTCTCACCC