seq1 = pF1KE0633.tfa, 606 bp
seq2 = pF1KE0633/gi568815579r_35642601.tfa (gi568815579r:35642601_35845391), 202791 bp

>pF1KE0633 606
>gi568815579r:35642601_35845391 (Chr19)

(complement)

1-44  (100001-100044)   100% ->
45-132  (100180-100267)   100% ->
133-231  (100971-101069)   100% ->
232-307  (101247-101322)   100% ->
308-403  (101488-101583)   100% ->
404-606  (102589-102791)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAATATTTAGCTTCGATATTCGGGACTGAGAAGGACAA      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100001 ATGGCTGAATATTTAGCTTCGATATTCGGGACTGAGAAGGACAAGTG...

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     45    GGTTAACTGCTCTTTTTACTTTAAGATCGGGGTCTGCCGGCACGGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100177 CAGGGTTAACTGCTCTTTTTACTTTAAGATCGGGGTCTGCCGGCACGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCGGTGCTCCCGGCTTCACAACAAGCCGACATTCAGCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100227 ACCGGTGCTCCCGGCTTCACAACAAGCCGACATTCAGCCAGGTG...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAGGTGTTCACAGAACTGCAGGAGAAGTATGGGGAGATTGAAGAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100971 GAGGTGTTCACAGAACTGCAGGAGAAGTATGGGGAGATTGAAGAGATGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTGTGCGACAACCTTGGGGACCACCTCGTGGGCAACGTCTATGTCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101021 TGTGTGCGACAACCTTGGGGACCACCTCGTGGGCAACGTCTATGTCAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232         TTCCGGAGGGAGGAGGATGGAGAGCGGGCCGTGGCTGAACTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101071 TG...CAGTTCCGGAGGGAGGAGGATGGAGAGCGGGCCGTGGCTGAACTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGTAACCGCTGGTTCAACGGGCAGGCTGTGCACG         GGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101289 AGTAACCGCTGGTTCAACGGGCAGGCTGTGCACGGTG...CAGGGAATGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ACCCGAGGTGGCTTCTGCAACTTCATGCATCTGCGGCCCATTTCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101495 ACCCGAGGTGGCTTCTGCAACTTCATGCATCTGCGGCCCATTTCCCAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCTCCAGAGGCAGCTCTATGGGCGGGGACCCAGGCGCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101545 CCTCCAGAGGCAGCTCTATGGGCGGGGACCCAGGCGCAGGTA...CAGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CACCCCCGAGGTTCCATACTGGCCACCATCCCCGAGAGAGGAACCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102591 CACCCCCGAGGTTCCATACTGGCCACCATCCCCGAGAGAGGAACCATCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGTTCCCCTGATCACTGGCATGGCCGCTTCTGAGGCCCTGGCCCCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102641 TGTTCCCCTGATCACTGGCATGGCCGCTTCTGAGGCCCTGGCCCCCTTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCTTCACCCCCAACAGGGACAGATGTTCCTGGCAGGACCTCTCCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102691 CCTTCACCCCCAACAGGGACAGATGTTCCTGGCAGGACCTCTCCTCAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CCCCCTTCACTCTCCTGCCCCATCCTTCCCAGGCTCCCGGGCTCCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102741 CCCCCTTCACTCTCCTGCCCCATCCTTCCCAGGCTCCCGGGCTCCATAAT

    650 
    606 G
        |
 102791 G