seq1 = pF1KE0631.tfa, 600 bp
seq2 = pF1KE0631/gi568815575f_72903643.tfa (gi568815575f:72903643_73104242), 200600 bp

>pF1KE0631 600
>gi568815575f:72903643_73104242 (ChrX)

1-600  (100001-100600)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCCTGTACGTGGGCGACCTGCACCCTGAGGTGACCGAGGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCCTGTACGTGGGCGACCTGCACCCTGAGGTGACCGAGGCAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGTACGAGAAGTTCAGTCCAGCTGGGCCCATCCTCTCCATCCGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGTACGAGAAGTTCAGTCCAGCTGGGCCCATCCTCTCCATCCGCATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGGACAAGATCACCCGCCGCTCATTGGGCTACGCGTATGTCAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGGACAAGATCACCCGCCGCTCATTGGGCTACGCGTATGTCAACTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCAACCGGTGGACGCCAAGCGGGCCCTGGAGACCCTGAACTTTGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCAACCGGTGGACGCCAAGCGGGCCCTGGAGACCCTGAACTTTGATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATAAAGGGCAGGCCAGTGCGCATCATGTGGTCCCAGAGGGACCCGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATAAAGGGCAGGCCAGTGCGCATCATGTGGTCCCAGAGGGACCCGTCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGCAAGAGCGGGGTGGGCAACGTCTTCATCAAGAACCTGGGCAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCGCAAGAGCGGGGTGGGCAACGTCTTCATCAAGAACCTGGGCAAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCGACAACAAGGCGCTGTACAACATCTTCTCGGCGTTCGGCAACATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCGACAACAAGGCGCTGTACAACATCTTCTCGGCGTTCGGCAACATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCCTGCAAAGTGGCCTGTGACGAAAAGGGGCCCAAGGGCTACGGGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCCTGCAAAGTGGCCTGTGACGAAAAGGGGCCCAAGGGCTACGGGTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCACTTCCAAAAGCAGGAATCTGCGGAGCGGGCCATCGATGTGATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCACTTCCAAAAGCAGGAATCTGCGGAGCGGGCCATCGATGTGATGAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCATGTTCCTGAACTACCGCAAAATTTTCGTCGGGAGATTCAAGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCATGTTCCTGAACTACCGCAAAATTTTCGTCGGGAGATTCAAGTCGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAAAGAACGAGAGGCCGAAAGGGGAGCCTGGGCCAGGCAGTCCACTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAAAGAACGAGAGGCCGAAAGGGGAGCCTGGGCCAGGCAGTCCACTAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGACGTCAAGGATTTCGAGGAAGACACCGACGAGGAGGCCACCTTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGACGTCAAGGATTTCGAGGAAGACACCGACGAGGAGGCCACCTTGCGA