seq1 = pF1KE0630.tfa, 1113 bp
seq2 = pF1KE0630/gi568815582r_1879055.tfa (gi568815582r:1879055_2081179), 202125 bp

>pF1KE0630 1113
>gi568815582r:1879055_2081179 (Chr16)

(complement)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-147  (100161-100241)   100% ->
148-223  (100449-100524)   100% ->
224-401  (100636-100813)   100% ->
402-586  (100999-101183)   100% ->
587-700  (101277-101390)   100% ->
701-818  (101638-101755)   100% ->
819-1113  (101831-102125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCCCCCGATACCCAGTTTCAGTGCAAGGGGCAGCCCTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGCCCCCGATACCCAGTTTCAGTGCAAGGGGCAGCCCTGGTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCAAGAGGCTCCAA         ACGTTTGCCTTCTCTGTGCGCTGGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCAAGAGGCTCCAAGTA...CAGACGTTTGCCTTCTCTGTGCGCTGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGACGGCAGCGACACCTTCGTGCGCAGGAGTTGGGACGAATTCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100186 CAGACGGCAGCGACACCTTCGTGCGCAGGAGTTGGGACGAATTCAGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCAAG         AAGACCCTCAAGGAGACCTTCCCGGTGGAGGCGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100236 CTCAAGGTG...CAGAAGACCCTCAAGGAGACCTTCCCGGTGGAGGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCTGCTGCGGAGATCTGACCGCGTTCTCCCAAAGCTTCTCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100484 CCTGCTGCGGAGATCTGACCGCGTTCTCCCAAAGCTTCTCGGTC...AAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGCACCACTGTTGGGACGCGTGGGGCGCACGAGCCGCGGCCTGGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100636 ATGCACCACTGTTGGGACGCGTGGGGCGCACGAGCCGCGGCCTGGCGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGCAGCTGTTGGAAACCTATTCTCGGAGGCTGCTGGCGACTGCAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100686 CTGCAGCTGTTGGAAACCTATTCTCGGAGGCTGCTGGCGACTGCAGAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGTGGCACGGAGCCCGACGATCACTGGCTTCTTCGCACCGCAACCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100736 CGTGGCACGGAGCCCGACGATCACTGGCTTCTTCGCACCGCAACCCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCTGGAGCCCGCGCTGCCACCCGGCAG         CCGGGTGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100786 ACCTGGAGCCCGCGCTGCCACCCGGCAGGTG...CAGCCGGGTGATCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCCACCCCAGAGGAGCAGCCTCTTTCTCGCGCTGCGGGCCGCCTCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101012 CCCACCCCAGAGGAGCAGCCTCTTTCTCGCGCTGCGGGCCGCCTCTCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCACAGTCTGGAGGCTCAGAGCCTGCGCTGCCTGCAGCCCTTCTGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101062 CCACAGTCTGGAGGCTCAGAGCCTGCGCTGCCTGCAGCCCTTCTGTACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGACACGCGGGATAGGCCTTTTCAGGCGCAGGCCCAGGAGAGCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101112 AGGACACGCGGGATAGGCCTTTTCAGGCGCAGGCCCAGGAGAGCCTGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTGCTGCTGCGGCACCCCTCAG         GCTGGTGGCTGGTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101162 GTGCTGCTGCGGCACCCCTCAGGTA...CAGGCTGGTGGCTGGTGGAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CGAAGACCGGCAGACCGCCTGGTTTCCAGCGCCCTACCTGGAGGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101296 CGAAGACCGGCAGACCGCCTGGTTTCCAGCGCCCTACCTGGAGGAGGCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCCGGGCCAAGGCCGGGAGGGAGGCCCGTCCCTAGGGAGCAGCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101346 CCCCGGGCCAAGGCCGGGAGGGAGGCCCGTCCCTAGGGAGCAGCGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701     GTCCCCAGTTCTGTGCTTCCCGCGCCTACGAGAGCAGCCGCGCAGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101396 .CAGGTCCCCAGTTCTGTGCTTCCCGCGCCTACGAGAGCAGCCGCGCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGAGCTGTCCGTGCCCGCGGGGGCGCGCGTGCGCGTGTTGGAAACGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101684 TGAGCTGTCCGTGCCCGCGGGGGCGCGCGTGCGCGTGTTGGAAACGTCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 ACCGCGGCTGGTGGCTATGCAG         GTACGGCGACCGGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101734 ACCGCGGCTGGTGGCTATGCAGGTA...CAGGTACGGCGACCGGGCGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTACTCCCCGCGGTGCTGCTGCGGCCGGAAGGGCTGGGCGCTCTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101850 CTACTCCCCGCGGTGCTGCTGCGGCCGGAAGGGCTGGGCGCTCTCCTGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CGGGACGGGGTTCCGTGGAGGAGACGACCCGGCGGGTGAGGCCCGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101900 CGGGACGGGGTTCCGTGGAGGAGACGACCCGGCGGGTGAGGCCCGGGGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCCCTGAACCCTCCCAGGCCACCGCCCCTCCCCCCACCGTGCCCACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101950 TCCCTGAACCCTCCCAGGCCACCGCCCCTCCCCCCACCGTGCCCACCCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCTTCGCCGGGCGCCATCCAGAGCCGCTGCTGCACCGTCACACGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102000 CCTTCGCCGGGCGCCATCCAGAGCCGCTGCTGCACCGTCACACGCAGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCTGGAGCGGCGCCCACGGCGCCAGGGCCGCCCTCGAGGGTGCGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102050 CCTGGAGCGGCGCCCACGGCGCCAGGGCCGCCCTCGAGGGTGCGTGGACT

   1150     .    :    .    :    .
   1088 CTGTGCCGCACCCCACGACGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||
 102100 CTGTGCCGCACCCCACGACGGAGCAG