seq1 = pF1KE0629.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KE0629/gi568815586f_93472898.tfa (gi568815586f:93472898_93675176), 202279 bp

>pF1KE0629 594
>gi568815586f:93472898_93675176 (Chr12)

1-139  (100001-100139)   100% ->
140-594  (101825-102279)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCCTGCGGTGCCTTGAGCCCTCCGGGAATGGCGGGGAAGGGACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCCTGCGGTGCCTTGAGCCCTCCGGGAATGGCGGGGAAGGGACGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCCAGTGGGGGACCGCGGGGTCGGCGGAGGAGCCATCCCCGCAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCCAGTGGGGGACCGCGGGGTCGGCGGAGGAGCCATCCCCGCAGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGTCTGGCGAAGGCCCTGCGGGAGCTCGGTCAGACAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100101 CGCGTCTGGCGAAGGCCCTGCGGGAGCTCGGTCAGACAGGTA...CAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGGTACTGGGGAAGTATGACTGTTAATGAAGCCAAAGAGAAATTAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101827 TGGTACTGGGGAAGTATGACTGTTAATGAAGCCAAAGAGAAATTAAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCACCAGAAGGAACTTTCTTGATTAGAGATAGCTCGCATTCAGACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101877 GGCACCAGAAGGAACTTTCTTGATTAGAGATAGCTCGCATTCAGACTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TACTAACAATATCTGTTAAAACATCAGCTGGACCAACTAATCTTCGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101927 TACTAACAATATCTGTTAAAACATCAGCTGGACCAACTAATCTTCGAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAATACCAAGACGGAAAATTCAGATTGGACTCTATCATATGTGTCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101977 GAATACCAAGACGGAAAATTCAGATTGGACTCTATCATATGTGTCAAATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGCTTAAACAATTTGACAGTGTGGTTCATCTGATCGACTACTATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102027 CAAGCTTAAACAATTTGACAGTGTGGTTCATCTGATCGACTACTATGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGATGTGCAAGGATAAGCGGACAGGTCCAGAAGCCCCCCGGAACGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102077 AGATGTGCAAGGATAAGCGGACAGGTCCAGAAGCCCCCCGGAACGGCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTTCACCTTTATCTGACCAAACCGCTCTACACGTCAGCACCATCTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102127 GTTCACCTTTATCTGACCAAACCGCTCTACACGTCAGCACCATCTCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCATCTCTGTAGGCTCACCATTAACAAATGTACCGGTGCCATCTGGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102177 GCATCTCTGTAGGCTCACCATTAACAAATGTACCGGTGCCATCTGGGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGCCTTTACCAACAAGACTAAAAGATTACTTGGAAGAATATAAATTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102227 TGCCTTTACCAACAAGACTAAAAGATTACTTGGAAGAATATAAATTCCAG

    600 
    592 GTA
        |||
 102277 GTA