seq1 = pF1KE0621.tfa, 570 bp
seq2 = pF1KE0621/gi568815589r_122141887.tfa (gi568815589r:122141887_122361492), 219606 bp

>pF1KE0621 570
>gi568815589r:122141887_122361492 (Chr9)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-240  (109520-109646)   100% ->
241-327  (113889-113975)   100% ->
328-413  (116152-116237)   100% ->
414-570  (119450-119606)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCAGAAACCAAAACTCTTCCCCTGGAGAATGCATCCATCCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCAGAAACCAAAACTCTTCCCCTGGAGAATGCATCCATCCTTTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGGGCTCTCTGCAGGAAGGACACCGATTATGGATTGGCAACCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGGGCTCTCTGCAGGAAGGACACCGATTATGGATTGGCAACCTGGACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAAAATTACCGA         ATACCACCTCCTCAAGCTCCTCCAGAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAAAATTACCGAGTA...CAGATACCACCTCCTCAAGCTCCTCCAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGGCAAGGTAAAGCAGTTTGACTTCCTCTTCCACAAGTCAGGTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109548 TTTGGCAAGGTAAAGCAGTTTGACTTCCTCTTCCACAAGTCAGGTGCTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGGGACAGCCTCGAGGCTACTGTTTTGTTAACTTTGAAACTAAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 109598 GGAGGGACAGCCTCGAGGCTACTGTTTTGTTAACTTTGAAACTAAGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241         GAAGCAGAGCAAGCCATCCAGTGTCTCAATGGCAAGTTGGCC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 TA...CAGGAAGCAGAGCAAGCCATCCAGTGTCTCAATGGCAAGTTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGTCCAAGAAGCTGGTGGTGCGATGGGCACATGCTCAAGTAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 113931 CTGTCCAAGAAGCTGGTGGTGCGATGGGCACATGCTCAAGTAAAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     AGATATGATCATAACAAGAATGATAAGATTCTTCCAATCAGTCTCG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113981 .CAGAGATATGATCATAACAAGAATGATAAGATTCTTCCAATCAGTCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCATCCTCAAGCACTGAGCCTACTCAGTCTAACCTAAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 116198 AGCCATCCTCAAGCACTGAGCCTACTCAGTCTAACCTAAGGTA...CAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTCACTGCAAAGATAAAAGCCATTGAAGCAAAACTGAAAATGATGGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119451 GTCACTGCAAAGATAAAAGCCATTGAAGCAAAACTGAAAATGATGGCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAATCCTGATGCAGAGTATCCAGCAGCGCCTGTTTATTCCTACTTTAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119501 AAATCCTGATGCAGAGTATCCAGCAGCGCCTGTTTATTCCTACTTTAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CACCAGATAAAAAAAGGACTACTCCATATTCTAGAACAGCATGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119551 CACCAGATAAAAAAAGGACTACTCCATATTCTAGAACAGCATGGAAATCT

    600     .
    565 CGAAGA
        ||||||
 119601 CGAAGA