seq1 = pF1KE0611.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KE0611/gi568815579f_1170934.tfa (gi568815579f:1170934_1372051), 201118 bp

>pF1KE0611 516
>gi568815579f:1170934_1372051 (Chr19)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-210  (100207-100313)   100% ->
211-349  (100396-100534)   100% ->
350-431  (100618-100699)   100% ->
432-502  (101048-101118)   98% ->
503-516  (101494-101507)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCAGATGAAGGCAAACTTTTTGTTGGAGGGCTGAGTTTTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCAGATGAAGGCAAACTTTTTGTTGGAGGGCTGAGTTTTGACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAATGAGCAGTCGCTGGAGCAGGTCTTCTCAAAGTACGGACAGATCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAATGAGCAGTCGCTGGAGCAGGTCTTCTCAAAGTACGGACAGATCTCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAG         TGGTGGTTGTGAAAGACAGGGAGACCCAGAGATCTCGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGTG...CAGTGGTGGTTGTGAAAGACAGGGAGACCCAGAGATCTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGATTTGGGTTTGTCACCTTTGAGAACATTGACGACGCTAAGGATGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100245 GGATTTGGGTTTGTCACCTTTGAGAACATTGACGACGCTAAGGATGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGGCCATGAATGGGAAG         TCTGTAGATGGACGGCAGATCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100295 GATGGCCATGAATGGGAAGGTG...CAGTCTGTAGATGGACGGCAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAGTAGACCAGGCAGGCAAGTCGTCAGACAACCGATCCCGTGGGTACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100418 GAGTAGACCAGGCAGGCAAGTCGTCAGACAACCGATCCCGTGGGTACCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGTGGCTCTGCCGGGGGCCGGGGCTTCTTCCGTGGGGGCCGAGGACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100468 GGTGGCTCTGCCGGGGGCCGGGGCTTCTTCCGTGGGGGCCGAGGACGGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCGTGGGTTCTCTAGAG         GAGGAGGGGACCGAGGCTATGGGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100518 CCGTGGGTTCTCTAGAGGTG...CAGGAGGAGGGGACCGAGGCTATGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGAACCGGTTCGAGTCCAGGAGTGGGGGCTACGGAGGCTCCAGAGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100642 GGAACCGGTTCGAGTCCAGGAGTGGGGGCTACGGAGGCTCCAGAGACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATAGCAG         CCGGAGTCAGAGTGGTGGCTACAGTGACCGGAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100692 TATAGCAGGTG...CAGCCGGAGTCAGAGTGGTGGCTACAGTGACCGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTCGGGCGGGTCCTACAGAGACAGTTACGACAGTTACG         CTA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||>>>...>>>|||
 101081 CTCGGGCGGGTCCTACAGAGACAGTTATGACAGTTACGGTA...CAGCTA

    550     .    :
    506 CACACAACGAG
        |||||||||||
 101497 CACACAACGAG