seq1 = pF1KE0604.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KE0604/gi568815591r_26570103.tfa (gi568815591r:26570103_26964429), 394327 bp

>pF1KE0604 1077
>gi568815591r:26570103_26964429 (Chr7)

(complement)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-173  (109540-109645)   100% ->
174-199  (110268-110293)   100% ->
200-307  (120293-120400)   100% ->
308-385  (224466-224543)   100% ->
386-469  (225552-225635)   100% ->
470-594  (237424-237548)   100% ->
595-658  (238444-238507)   100% ->
659-796  (238865-239002)   100% ->
797-874  (274068-274145)   100% ->
875-987  (279582-279694)   100% ->
988-1077  (294238-294327)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCAACCCCAGCAGCACCTCCTCTCCCTACCCCCTCCCTGAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCAACCCCAGCAGCACCTCCTCTCCCTACCCCCTCCCTGAGGAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGGAACCTGTTGGCAG         ATGTTGAAACATTTGTAGCAGATA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGGAACCTGTTGGCAGGTA...TAGATGTTGAAACATTTGTAGCAGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TACTGAAAGGAGAAAATTTATCCAAGAAAGCAAAGGAAAAGAGAGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109564 TACTGAAAGGAGAAAATTTATCCAAGAAAGCAAAGGAAAAGAGAGAATCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTATTAAGAAGATAAAAGATGTAAAGTCTAT         CTATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109614 CTTATTAAGAAGATAAAAGATGTAAAGTCTATGTA...TAGCTATCTTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAATTTCAAGACAAAG         GTGATGCAGAAGATGGGGAAGAAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 110277 GGAATTTCAAGACAAAGGTA...CAGGTGATGCAGAAGATGGGGAAGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATGATGACCCTTTTGCTGGGCCTCCAGACACTATTTCATTAGCCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120317 ATGATGACCCTTTTGCTGGGCCTCCAGACACTATTTCATTAGCCTCAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CGATATGATAAAGACGATGAAGCCCCCTCTGATG         GAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 120367 CGATATGATAAAGACGATGAAGCCCCCTCTGATGGTA...TAGGAGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GTTTCCTCCAATTGCAGCACAAGACCTTCCTTTTGTTCTAAAGGCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224473 GTTTCCTCCAATTGCAGCACAAGACCTTCCTTTTGTTCTAAAGGCTGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACCTTGAAAAACGCAGAAAAG         ATCACAGCTTTCTGGGATTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 224523 ACCTTGAAAAACGCAGAAAAGGTA...CAGATCACAGCTTTCTGGGATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GAATGGCAGAAACGGTGGTGTGCTCTCAGTAAAACGGTATTCTATTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225572 GAATGGCAGAAACGGTGGTGTGCTCTCAGTAAAACGGTATTCTATTATTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TGGAAGTGATAAAG         ACAAACAACAGAAAGGTGAATTTGCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 225622 TGGAAGTGATAAAGGTA...CAGACAAACAACAGAAAGGTGAATTTGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TAGATGGCTACAGTGTCAGAATGAATAACACTCTAAGAAAGGATGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237451 TAGATGGCTACAGTGTCAGAATGAATAACACTCTAAGAAAGGATGGAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAAGATTGCTGTTTTGAAATCTCTGCTCCTGATAAACGTATATATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 237501 AAAGATTGCTGTTTTGAAATCTCTGCTCCTGATAAACGTATATATCAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    595        TTTACAGCAGCTTCTCCCAAAGATGCTGAAGAATGGGTACAGC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 237551 T...TAGTTTACAGCAGCTTCTCCCAAAGATGCTGAAGAATGGGTACAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AGCTGAAATTTGTATTGCAAG         ATATGGAATCTGATATTATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 238487 AGCTGAAATTTGTATTGCAAGGTA...TAGATATGGAATCTGATATTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CCTGAGGATTATGATGAGAGAGGAGAATTATATGATGATGTTGATCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238885 CCTGAGGATTATGATGAGAGAGGAGAATTATATGATGATGTTGATCATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TCTACCAATAAGCAATCCACTAACAAGCAGTCAACCAATAGATGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 238935 TCTACCAATAAGCAATCCACTAACAAGCAGTCAACCAATAGATGATGAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTTATGAAGAACTTCCAG         AAGAAGAAGAGGACAGTGCTCCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 238985 TTTATGAAGAACTTCCAGGTA...CAGAAGAAGAAGAGGACAGTGCTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GTGAAAGTGGAAGAACAAAGGAAGATGAGTCAGGATAGTGTCCATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274091 GTGAAAGTGGAAGAACAAAGGAAGATGAGTCAGGATAGTGTCCATCACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 CTCAG         GGGATAAGAGCACTGATTATGCTAATTTTTACCAGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 274141 CTCAGGTA...TAGGGGATAAGAGCACTGATTATGCTAATTTTTACCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 GATTGTGGGATTGTACTGGAGCTTTTTCTGATGAGTTGTCATTTAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 279618 GATTGTGGGATTGTACTGGAGCTTTTTCTGATGAGTTGTCATTTAAGCGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGTGATGTGATTTACATTCTTAGCAAG         GAATACAATAGATA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 279668 GGTGATGTGATTTACATTCTTAGCAAGGTA...TAGGAATACAATAGATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1002 TGGCTGGTGGGTAGGAGAAATGAAGGGAGCCATTGGCTTGGTGCCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 294252 TGGCTGGTGGGTAGGAGAAATGAAGGGAGCCATTGGCTTGGTGCCTAAAG

   1150     .    :    .    :    .
   1052 CCTACATAATGGAGATGTATGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||
 294302 CCTACATAATGGAGATGTATGATATT