seq1 = pF1KE0603.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KE0603/gi568815595r_196837014.tfa (gi568815595r:196837014_197042503), 205490 bp

>pF1KE0603 468
>gi568815595r:196837014_197042503 (Chr3)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-260  (103072-103253)   100% ->
261-399  (104856-104994)   100% ->
400-468  (105422-105490)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGTGGCCTCCTGAAGGCGCTGCGCAGCGACTCCTACGTGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGTGGCCTCCTGAAGGCGCTGCGCAGCGACTCCTACGTGGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCCAGTACCGGGACCAGCACTTCCGG         GGTGACAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GAGCCAGTACCGGGACCAGCACTTCCGGGTG...TAGGGTGACAATGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACAAGAAAAATTACTGAAGAAAAGCTGTACGTTATATGTTGGAAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103085 AACAAGAAAAATTACTGAAGAAAAGCTGTACGTTATATGTTGGAAATCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCTTTTTACACAACTGAAGAACAAATCTATGAACTCTTCAGCAAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103135 TCTTTTTACACAACTGAAGAACAAATCTATGAACTCTTCAGCAAAAGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACATAAAGAAAATCATTATGGGTCTGGATAAAATGAAGAAAACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103185 TGACATAAAGAAAATCATTATGGGTCTGGATAAAATGAAGAAAACAGCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGGATTCTGTTTTGTGGA         ATATTACTCACGCGCAGATGCG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103235 GTGGATTCTGTTTTGTGGAGTA...AAGATATTACTCACGCGCAGATGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAAAACGCCATGCGGTACATAAATGGGACGCGTCTGGATGACCGAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104878 GAAAACGCCATGCGGTACATAAATGGGACGCGTCTGGATGACCGAATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGCACAGACTGGGACGCAGGCTTTAAGGAGGGCAGGCAATACGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104928 TCGCACAGACTGGGACGCAGGCTTTAAGGAGGGCAGGCAATACGGCCGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCGATCTGGGGGCCAG         GTTCGGGATGAGTATCGGCAGGAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104978 GGCGATCTGGGGGCCAGGTA...AAGGTTCGGGATGAGTATCGGCAGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    424 TACGATGCTGGGAGAGGAGGCTATGGAAAACTGGCACAGAACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105446 TACGATGCTGGGAGAGGAGGCTATGGAAAACTGGCACAGAACCAG